More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2244 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2244  phage integrase family protein  100 
 
 		 348 aa  707    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1465  integrase family protein  35.67 
 
 		 334 aa  172  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.890522 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2297  integrative genetic element Ppu40, integrase  33.74 
 
 		 274 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0669  phage integrase family protein  34.8 
 
 		 343 aa  126  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0631  phage integrase family site specific recombinase  32.62 
 
 		 308 aa  123  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0636  phage integrase family site specific recombinase  32.01 
 
 		 308 aa  122  8e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2647  phage integrase family protein  30.77 
 
 		 315 aa  116  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  27.27 
 
 		 341 aa  105  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  24.19 
 
 		 337 aa  94  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2622  integrase family protein  27.36 
 
 		 335 aa  92  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.647869  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2307  integrase family protein  27.67 
 
 		 335 aa  87  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.109793  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  26.3 
 
 		 334 aa  86.7  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  27.69 
 
 		 402 aa  86.3  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  29.22 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0447  phage integrase  29.01 
 
 		 381 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2649  phage integrase family protein  25.89 
 
 		 381 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.833719 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0926  phage integrase family protein  29.01 
 
 		 381 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  26.93 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  27.87 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  25.54 
 
 		 367 aa  83.2  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  25.15 
 
 		 349 aa  82.8  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  22.37 
 
 		 387 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  29.6 
 
 		 404 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  29.34 
 
 		 407 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2649  integrase family protein  27.76 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.413706  hitchhiker  0.000000656425 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3047  phage integrase  28.95 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.182322  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  25.51 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  24.41 
 
 		 386 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  25.99 
 
 		 353 aa  76.3  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  26.69 
 
 		 354 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  26.69 
 
 		 354 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3005  phage integrase family site specific recombinase  30.05 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1532  phage integrase family site specific recombinase  30.05 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3070  prophage DLP12 integrase  30.05 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3300  phage integrase family site specific recombinase  30.05 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248425  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  26.94 
 
 		 482 aa  73.6  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  28.31 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1360  integrase/recombinase  25.1 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6099899999999998e-31 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4162  integrase family protein  26.67 
 
 		 396 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  25.55 
 
 		 397 aa  72.8  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  27.84 
 
 		 396 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0981  phage integrase family site specific recombinase  26.72 
 
 		 331 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.896677  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3507  phage integrase family protein  27.36 
 
 		 345 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000014558 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  24.69 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  27.11 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  25.08 
 
 		 413 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  25.31 
 
 		 384 aa  70.1  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  26.79 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  31.46 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0165  integrase family protein  30.84 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  22.51 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  24.09 
 
 		 354 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2427  phage integrase family protein  29.43 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  32.62 
 
 		 159 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  25.96 
 
 		 375 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1079  integrase  24.77 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  25.76 
 
 		 351 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0716  integrase  25.57 
 
 		 394 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  26.33 
 
 		 411 aa  66.6  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  21.55 
 
 		 387 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  25.42 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  29.02 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  27.89 
 
 		 412 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  26.87 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  24.36 
 
 		 401 aa  66.2  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  25.22 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  28.69 
 
 		 429 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2157  phage integrase  27.07 
 
 		 363 aa  65.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0421336  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  23.1 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  32.63 
 
 		 372 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0037  integrase-recombinase protein  22.78 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.491877  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1808  phage integrase family site specific recombinase  25.42 
 
 		 352 aa  65.1  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.595703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  27.27 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2312  hypothetical protein  25.84 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3701  integrase family protein  27.51 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1462  Phage integrase  25 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1727  phage integrase  26.52 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  32.24 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2797  phage integrase family protein  26.36 
 
 		 451 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  23.08 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  27.71 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1633  phage integrase  26.64 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  29.93 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  20.36 
 
 		 387 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  20.36 
 
 		 387 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  23.87 
 
 		 387 aa  62.8  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2124  phage integrase family protein  22.31 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.308322  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  31.78 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  25.89 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2882  phage integrase  27.5 
 
 		 341 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.948794  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  25.35 
 
 		 374 aa  62  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2810  integrase  23.68 
 
 		 336 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2951  phage integrase  25.5 
 
 		 336 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.339524  hitchhiker  3.4545800000000002e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5040  prophage CP-933T integrase  25.99 
 
 		 371 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.530892  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  23.59 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  25.81 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3066  phage integrase  27.5 
 
 		 341 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5364  integrase  24.63 
 
 		 332 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0089  phage integrase family protein  27.35 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3921  phage integrase family protein  25.89 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  hitchhiker  0.00183347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>