More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0926 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_0447  phage integrase  100 
 
 		 381 aa  793    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3047  phage integrase  97.38 
 
 		 381 aa  773    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.182322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0926  phage integrase family protein  100 
 
 		 381 aa  793    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  34.2 
 
 		 402 aa  106  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  30 
 
 		 412 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  27.61 
 
 		 407 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  24.66 
 
 		 372 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0165  integrase family protein  26.17 
 
 		 369 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  32.68 
 
 		 397 aa  86.7  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1532  phage integrase family site specific recombinase  25.71 
 
 		 369 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3005  phage integrase family site specific recombinase  25.71 
 
 		 369 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  29.33 
 
 		 404 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3070  prophage DLP12 integrase  25.71 
 
 		 369 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3300  phage integrase family site specific recombinase  25.71 
 
 		 369 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248425  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2954  integrase family protein  30.72 
 
 		 409 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2244  phage integrase family protein  29.01 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  36.94 
 
 		 159 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  28.81 
 
 		 401 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  25.33 
 
 		 338 aa  80.9  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  28.46 
 
 		 368 aa  79.7  0.00000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1465  integrase family protein  25.14 
 
 		 334 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.890522 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  26.84 
 
 		 421 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  36.31 
 
 		 172 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  35.46 
 
 		 482 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  23.98 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  29.88 
 
 		 367 aa  77  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  30.12 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  34.75 
 
 		 396 aa  76.3  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0669  phage integrase family protein  27.3 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  29.48 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2564  phage integrase family protein  27.93 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.326638  hitchhiker  0.000921348 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  26.38 
 
 		 392 aa  71.6  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  28.57 
 
 		 388 aa  72  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  28.21 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  23.47 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  26.69 
 
 		 429 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  26.4 
 
 		 386 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2297  integrative genetic element Ppu40, integrase  24.91 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0631  phage integrase family site specific recombinase  26.54 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0636  phage integrase family site specific recombinase  26.54 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  25.38 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  23.96 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  23.96 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  29.21 
 
 		 295 aa  69.3  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0762  phage integrase family protein  29.9 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  29.59 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  23.02 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2647  phage integrase family protein  25.87 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1227  integrase family protein  31.61 
 
 		 305 aa  67  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.842173  decreased coverage  0.000216705 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  32.08 
 
 		 270 aa  67  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  28.74 
 
 		 354 aa  67  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1360  integrase/recombinase  29.41 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6099899999999998e-31 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  29.45 
 
 		 384 aa  66.6  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  22.81 
 
 		 384 aa  66.2  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  25.98 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  30.12 
 
 		 384 aa  66.2  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  25.98 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  28.07 
 
 		 434 aa  66.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2622  integrase family protein  26.69 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.647869  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  26.67 
 
 		 353 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  28.48 
 
 		 463 aa  65.1  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  29.65 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0089  phage integrase family protein  27.14 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  24.58 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_002936  DET0272  phage integrase family site specific recombinase  32.3 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0295  phage integrase family site specific recombinase  32.3 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0905  phage integrase family site specific recombinase  32.3 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2002  phage integrase  30.91 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1316  integrase/recombinase  29.53 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.718184  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1170  integrase family protein  30.36 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.429636 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  25 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0949  phage integrase family protein  29.84 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.427827  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4832  phage integrase  32.93 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5364  integrase  26.42 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2633  phage integrase family protein  30.13 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0279  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.033075  hitchhiker  0.000013626 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  26.46 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  27.87 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  30.91 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1646  integrase family protein  31.55 
 
 		 330 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3507  phage integrase family protein  27.21 
 
 		 345 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000014558 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0687  Phage integrase  29.07 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.004827  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  35.22 
 
 		 443 aa  62.4  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4539  transposase B  21.95 
 
 		 637 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  26.8 
 
 		 411 aa  62  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3903  phage integrase family site specific recombinase  44.83 
 
 		 99 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.823274  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  30.34 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  28.9 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5613  hypothetical protein  25.9 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  28.66 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  24.46 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0370  phage integrase family protein  26.45 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53570  putative integrase  27.88 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000326616  decreased coverage  0.0000890956 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  30.77 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0015  Phage integrase  35.71 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.230922  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0240  tyrosine recombinase XerC subunit  27.78 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.295303  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1902  phage integrase  28.79 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  26.2 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  26.46 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0078  phage integrase family protein  31.33 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>