More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3398 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 407 aa  848    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2954  integrase family protein  40.48 
 
 		 409 aa  247  2e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2865  site-specific recombinase XerD-like  32.01 
 
 		 417 aa  194  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.11888  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  32.43 
 
 		 372 aa  179  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2427  phage integrase family protein  29.33 
 
 		 414 aa  155  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0089  phage integrase family protein  30.79 
 
 		 400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  27.36 
 
 		 368 aa  129  8.000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  32.06 
 
 		 402 aa  119  9e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  36.32 
 
 		 367 aa  116  8.999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  29.94 
 
 		 379 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  30.66 
 
 		 381 aa  112  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  31.72 
 
 		 412 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0930  site-specific recombinase, phage integrase family protein  27.35 
 
 		 385 aa  109  8.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  32.51 
 
 		 397 aa  107  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  25.62 
 
 		 415 aa  107  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2564  phage integrase family protein  26.58 
 
 		 417 aa  104  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.326638  hitchhiker  0.000921348 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0241  Phage integrase  23.26 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  31.76 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  31.87 
 
 		 404 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  30.15 
 
 		 401 aa  99  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  25.27 
 
 		 398 aa  97.8  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  31.27 
 
 		 396 aa  96.7  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  29.37 
 
 		 275 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3047  phage integrase  27.99 
 
 		 381 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.182322  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  27.69 
 
 		 392 aa  93.2  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  32.53 
 
 		 482 aa  91.3  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  29.53 
 
 		 384 aa  91.3  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  37.09 
 
 		 421 aa  90.1  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  33.63 
 
 		 334 aa  89.4  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  38.96 
 
 		 429 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48880  putative bacteriophage integrase  32.34 
 
 		 338 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000942528  hitchhiker  0.000000101575 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  27.25 
 
 		 384 aa  89  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3701  integrase family protein  25.97 
 
 		 392 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  26.67 
 
 		 397 aa  87.4  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0447  phage integrase  27.61 
 
 		 381 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0926  phage integrase family protein  27.61 
 
 		 381 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  30.54 
 
 		 285 aa  87  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  31.92 
 
 		 413 aa  87  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  25.68 
 
 		 347 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1917  integrase  29.31 
 
 		 375 aa  87  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  25.09 
 
 		 390 aa  86.3  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0969  integrase family protein  26.95 
 
 		 348 aa  85.9  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.23183  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  30.33 
 
 		 296 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0653  integrase family protein  27.64 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.319783  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  37.5 
 
 		 159 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  30.25 
 
 		 389 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2002  phage integrase  33.75 
 
 		 188 aa  84.7  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  26.86 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5550  phage integrase family protein  29.18 
 
 		 365 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4490  phage integrase family protein  29.18 
 
 		 365 aa  84  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6537  normal  0.0343494 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  27.44 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  28.63 
 
 		 411 aa  83.2  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3066  integrase  28.57 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0315896  hitchhiker  0.000000103666 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  27.05 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  29.37 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1808  phage integrase family site specific recombinase  30.48 
 
 		 352 aa  81.6  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.595703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  25.77 
 
 		 477 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2244  phage integrase family protein  29.34 
 
 		 348 aa  81.3  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  25.49 
 
 		 337 aa  81.3  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2622  integrase family protein  27.8 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.647869  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2157  phage integrase  30.67 
 
 		 363 aa  80.1  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0421336  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3848  integrase family protein  27.83 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250043  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  31.22 
 
 		 299 aa  79.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  29.84 
 
 		 356 aa  79.3  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  27.42 
 
 		 420 aa  79  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4348  site-specific recombinase, phage integrase family  27.39 
 
 		 326 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.175546  hitchhiker  0.00000000567763 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  29.24 
 
 		 432 aa  78.2  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  28.4 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7637  integrase family protein  33.91 
 
 		 425 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  28.14 
 
 		 338 aa  78.2  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  30.57 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  29.79 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  29.02 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  31.02 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  29.1 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  28.19 
 
 		 347 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  28.19 
 
 		 347 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2872  phage integrase family protein  31.65 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000984905  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  28.46 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4307  phage integrase family site specific recombinase  27.8 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0756066  hitchhiker  0.00146275 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  28.05 
 
 		 397 aa  76.3  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4828  phage integrase  26.13 
 
 		 433 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  30.23 
 
 		 393 aa  76.3  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  28.46 
 
 		 351 aa  76.3  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2951  phage integrase  26.43 
 
 		 336 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.339524  hitchhiker  3.4545800000000002e-18 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  29.91 
 
 		 334 aa  75.5  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  25.5 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1633  phage integrase  29.83 
 
 		 362 aa  75.1  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  28.81 
 
 		 354 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  31.51 
 
 		 444 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  28.81 
 
 		 354 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0981  phage integrase family site specific recombinase  26.75 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.896677  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0775  phage integrase family protein  27.76 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0341069  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  25.1 
 
 		 354 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0745  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 357 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.107824 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  28.2 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  24.5 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  25.53 
 
 		 392 aa  74.7  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  33.33 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  25.46 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>