More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0395 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  100 
 
 		 397 aa  817    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  77.75 
 
 		 411 aa  634    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  53.66 
 
 		 393 aa  404  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  51.3 
 
 		 384 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  51.3 
 
 		 384 aa  388  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  43.6 
 
 		 388 aa  281  1e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  38.13 
 
 		 467 aa  261  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  40 
 
 		 400 aa  258  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2625  phage integrase family protein  39.79 
 
 		 400 aa  258  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  38.6 
 
 		 444 aa  256  4e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  38.74 
 
 		 434 aa  256  7e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  38.4 
 
 		 400 aa  253  5.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  38.4 
 
 		 400 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1236  phage integrase  39.73 
 
 		 399 aa  252  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449507  normal  0.10874 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2601  integrase family protein  39.47 
 
 		 399 aa  252  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3045  phage integrase  39.47 
 
 		 415 aa  252  9.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2745  integrase family protein  39.47 
 
 		 415 aa  252  9.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.99512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  40 
 
 		 400 aa  251  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31280  putative integrase  39.2 
 
 		 401 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000488668  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1865  integrase family protein  39.2 
 
 		 401 aa  251  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.94549  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3540  integrase family protein  38.93 
 
 		 399 aa  250  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3747  integrase  39.47 
 
 		 399 aa  250  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  38.73 
 
 		 401 aa  244  3e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  38.56 
 
 		 399 aa  241  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0497  integrase family protein  38.4 
 
 		 412 aa  238  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  35.73 
 
 		 400 aa  207  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  38 
 
 		 432 aa  200  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  34.64 
 
 		 376 aa  199  6e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  34.29 
 
 		 376 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  34.29 
 
 		 376 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  34.67 
 
 		 376 aa  196  7e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  33.96 
 
 		 451 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  33.83 
 
 		 451 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  33.25 
 
 		 451 aa  181  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  32.09 
 
 		 451 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  35.27 
 
 		 429 aa  181  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  31.98 
 
 		 451 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  32.09 
 
 		 451 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  32.68 
 
 		 452 aa  177  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  32.38 
 
 		 456 aa  176  5e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  34.62 
 
 		 402 aa  176  5e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  31.38 
 
 		 452 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  34.55 
 
 		 420 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  29.44 
 
 		 463 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3752  phage integrase family protein  31.57 
 
 		 422 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.538338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  29.77 
 
 		 412 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  31.54 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  29.35 
 
 		 379 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  31.6 
 
 		 430 aa  137  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0807  integrase protein  41.81 
 
 		 181 aa  131  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  28.81 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  28.45 
 
 		 482 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  30.32 
 
 		 424 aa  126  5e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  29.43 
 
 		 397 aa  124  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  30.24 
 
 		 412 aa  123  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3853  integrase family protein  27.17 
 
 		 500 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  31.76 
 
 		 367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  28.57 
 
 		 410 aa  120  3e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  28.29 
 
 		 404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  29.43 
 
 		 406 aa  116  6e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  28.89 
 
 		 443 aa  113  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  29.62 
 
 		 413 aa  112  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  28.03 
 
 		 421 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  29.92 
 
 		 417 aa  111  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0919  integrase family protein  25.35 
 
 		 448 aa  107  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.295922  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  28.79 
 
 		 429 aa  106  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  28.15 
 
 		 412 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  27.59 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  26.3 
 
 		 439 aa  100  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  26.41 
 
 		 426 aa  99.4  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  27.2 
 
 		 417 aa  99.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  25.65 
 
 		 427 aa  97.8  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  24.59 
 
 		 414 aa  96.3  8e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  26.96 
 
 		 389 aa  95.9  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  25.84 
 
 		 433 aa  95.9  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2401  phage integrase  31.88 
 
 		 242 aa  94.7  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340015  normal  0.0277032 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2399  hypothetical protein  45.45 
 
 		 137 aa  94  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229698  normal  0.0250128 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  24.38 
 
 		 414 aa  93.2  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2136  phage integrase family protein  27.57 
 
 		 389 aa  93.2  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0404563  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  25.41 
 
 		 337 aa  91.7  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  29.49 
 
 		 381 aa  91.3  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  28.9 
 
 		 353 aa  90.9  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  33.33 
 
 		 251 aa  90.5  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  26.34 
 
 		 413 aa  90.1  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  25.84 
 
 		 444 aa  89.7  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  29.73 
 
 		 354 aa  89.7  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  29.73 
 
 		 354 aa  89.7  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  27.52 
 
 		 392 aa  88.6  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  25.72 
 
 		 406 aa  88.6  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  28.77 
 
 		 374 aa  88.2  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  30.86 
 
 		 449 aa  88.6  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  30.37 
 
 		 356 aa  87.8  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  27.63 
 
 		 439 aa  87.8  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  28.42 
 
 		 374 aa  87.4  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  24.39 
 
 		 368 aa  86.7  6e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  29.37 
 
 		 407 aa  86.3  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  27.46 
 
 		 420 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  28.97 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  33.95 
 
 		 334 aa  85.5  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  28.07 
 
 		 347 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>