More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4340 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  100 
 
 		 420 aa  850    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  42.21 
 
 		 452 aa  294  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  42.22 
 
 		 452 aa  291  2e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  41.98 
 
 		 451 aa  289  8e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  41.77 
 
 		 451 aa  286  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  41.01 
 
 		 451 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  40.38 
 
 		 432 aa  270  2.9999999999999997e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  42.96 
 
 		 429 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  35.06 
 
 		 463 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3752  phage integrase family protein  36.58 
 
 		 422 aa  191  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.538338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  37.47 
 
 		 430 aa  189  8e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  34.55 
 
 		 397 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  32.91 
 
 		 393 aa  157  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  31.19 
 
 		 384 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  30.95 
 
 		 384 aa  152  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  32.16 
 
 		 400 aa  149  6e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  31.7 
 
 		 411 aa  149  7e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3853  integrase family protein  31.9 
 
 		 500 aa  141  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  29.9 
 
 		 388 aa  133  6e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3867  phage integrase  32.84 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  28.57 
 
 		 434 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2401  phage integrase  34.05 
 
 		 242 aa  124  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340015  normal  0.0277032 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  28.01 
 
 		 402 aa  120  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  26.42 
 
 		 467 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  27.61 
 
 		 444 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 376 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  28.84 
 
 		 376 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  28.57 
 
 		 376 aa  106  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  28.57 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  27.75 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  24.85 
 
 		 379 aa  99.4  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1236  phage integrase  25.98 
 
 		 399 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449507  normal  0.10874 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  33.62 
 
 		 451 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  25.12 
 
 		 482 aa  97.8  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  27.38 
 
 		 400 aa  97.8  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  26.56 
 
 		 401 aa  98.2  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  27.38 
 
 		 400 aa  97.8  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  33.62 
 
 		 451 aa  97.4  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  26.78 
 
 		 417 aa  97.4  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  33.19 
 
 		 451 aa  96.7  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3747  integrase  25.73 
 
 		 399 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  28.67 
 
 		 424 aa  95.9  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  33.19 
 
 		 456 aa  95.1  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  25.13 
 
 		 396 aa  94  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  25.89 
 
 		 400 aa  93.6  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  26.73 
 
 		 417 aa  93.6  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3323  integrase family protein  24.19 
 
 		 441 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  25.54 
 
 		 400 aa  90.9  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  26.46 
 
 		 406 aa  90.9  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  26.76 
 
 		 410 aa  89.4  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  33.19 
 
 		 367 aa  89.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  30.82 
 
 		 381 aa  88.6  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3540  integrase family protein  26.62 
 
 		 399 aa  87.8  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3045  phage integrase  26.38 
 
 		 415 aa  87  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2745  integrase family protein  26.38 
 
 		 415 aa  87  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.99512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2601  integrase family protein  26.38 
 
 		 399 aa  86.7  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  25.15 
 
 		 387 aa  86.3  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  28.01 
 
 		 415 aa  86.3  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  25 
 
 		 412 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2018  integrase family protein  27.16 
 
 		 452 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0686  integrase family protein  26.01 
 
 		 472 aa  84.7  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0922  Phage integrase  23.19 
 
 		 403 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12188  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  23.16 
 
 		 433 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1272  phage integrase family protein  25.21 
 
 		 425 aa  79.3  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000707551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2625  phage integrase family protein  27.18 
 
 		 400 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3493  integrase family protein  23.89 
 
 		 409 aa  79  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.247982  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0497  integrase family protein  26.3 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  29.35 
 
 		 392 aa  76.3  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  26.85 
 
 		 407 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  30.25 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  30.66 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  35.57 
 
 		 159 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1865  integrase family protein  26.37 
 
 		 401 aa  73.9  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.94549  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31280  putative integrase  26.37 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000488668  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  25.87 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  23.57 
 
 		 393 aa  73.6  0.000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  21.43 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  31.03 
 
 		 353 aa  72  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  25.25 
 
 		 413 aa  72  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0637  phage integrase family protein  24.51 
 
 		 411 aa  72  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102856 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  23.95 
 
 		 396 aa  72  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  33.33 
 
 		 351 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0094  Phage integrase  25.39 
 
 		 449 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000297047  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  21.66 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2924  integrase family protein  24.74 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2283  integrase family protein  23.03 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1997  integrase family protein  24.67 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.726133 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  34.78 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  23.65 
 
 		 410 aa  69.7  0.00000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  24.87 
 
 		 443 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0845  phage integrase  23.4 
 
 		 457 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1326  phage integrase family protein  23.4 
 
 		 457 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.558955  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  25.73 
 
 		 425 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4935  putative phage-like integrase  27.84 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  26.17 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  24.94 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  25.3 
 
 		 426 aa  68.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  29.53 
 
 		 421 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2900  phage integrase  23.68 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0318  hypothetical protein  27.31 
 
 		 515 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>