More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3853 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3853  integrase family protein  100 
 
 		 500 aa  1010    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  41.87 
 
 		 463 aa  297  3e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  41.87 
 
 		 430 aa  279  9e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  31.17 
 
 		 452 aa  166  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  30.16 
 
 		 451 aa  160  5e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  33.11 
 
 		 432 aa  158  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  30.79 
 
 		 452 aa  157  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  30.28 
 
 		 451 aa  157  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  31.25 
 
 		 451 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3752  phage integrase family protein  29.03 
 
 		 422 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.538338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  32.13 
 
 		 420 aa  149  9e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  31.03 
 
 		 429 aa  149  9e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  29.36 
 
 		 384 aa  142  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  27.81 
 
 		 384 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  27.06 
 
 		 397 aa  126  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  27.03 
 
 		 411 aa  117  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  27.31 
 
 		 400 aa  111  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  27.43 
 
 		 402 aa  107  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  28.06 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  25.83 
 
 		 400 aa  103  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3747  integrase  24.28 
 
 		 399 aa  100  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  25.73 
 
 		 434 aa  98.2  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  24.33 
 
 		 399 aa  92  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  24.45 
 
 		 387 aa  89.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1236  phage integrase  23.44 
 
 		 399 aa  87.8  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449507  normal  0.10874 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  36.57 
 
 		 393 aa  87.8  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2401  phage integrase  30.73 
 
 		 242 aa  86.3  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340015  normal  0.0277032 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  24.51 
 
 		 412 aa  85.9  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0919  integrase family protein  25.16 
 
 		 448 aa  84.3  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.295922  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  24.68 
 
 		 444 aa  84  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  29.58 
 
 		 398 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  22.98 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  23.13 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  22.98 
 
 		 376 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  23.01 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  31.63 
 
 		 392 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0497  integrase family protein  25.39 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0089  phage integrase family protein  32.85 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  26.54 
 
 		 451 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  23.7 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  27.59 
 
 		 451 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  28.25 
 
 		 451 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2399  hypothetical protein  39.64 
 
 		 137 aa  71.6  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229698  normal  0.0250128 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  34.91 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  23.17 
 
 		 413 aa  71.2  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1481  phage integrase family protein  32.05 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0281722  normal  0.205606 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2460  integrase family protein  25.76 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  26.1 
 
 		 413 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  21.96 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  24.14 
 
 		 424 aa  70.9  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  27.8 
 
 		 456 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  29.52 
 
 		 467 aa  70.1  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3796  phage integrase family protein  25.87 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  28.1 
 
 		 415 aa  69.7  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  23.06 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  31.66 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0912  integrase/recombinase  24.57 
 
 		 304 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0261382  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  29.41 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  21.9 
 
 		 417 aa  67.4  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2625  phage integrase family protein  28.4 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.046264 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  26.6 
 
 		 291 aa  66.2  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2564  phage integrase family protein  27.57 
 
 		 417 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.326638  hitchhiker  0.000921348 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1914  integrase/recombinase  25.79 
 
 		 304 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00100079  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  35.51 
 
 		 283 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  27.44 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  27.44 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  27.71 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  33.33 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1865  integrase family protein  28.4 
 
 		 401 aa  64.3  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.94549  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31280  putative integrase  28.4 
 
 		 401 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000488668  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0545  prophage LambdaSa1, site-specific recombinase phage integrase family protein  26.51 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000831336  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1189  integrase family protein  26.83 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203109  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3683  phage integrase family protein  23.72 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3047  phage integrase  28.04 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.182322  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0807  integrase protein  29.31 
 
 		 181 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2136  phage integrase family protein  30.88 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0404563  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  24.79 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  30.92 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  30.92 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  24.79 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  29.69 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.73 
 
 		 299 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  26.83 
 
 		 401 aa  62  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0447  phage integrase  27.68 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0926  phage integrase family protein  27.68 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  31 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  24.02 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.73 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  23.6 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.73 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  22.33 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  25.73 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  30.2 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3306  Phage integrase  25.39 
 
 		 450 aa  60.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889733  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2249  putative transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  25 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1634  integrase family protein  36.36 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3498  integrase family protein  25.42 
 
 		 486 aa  60.8  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  31.85 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>