More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2401 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2401  phage integrase  100 
 
 		 242 aa  488  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340015  normal  0.0277032 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3752  phage integrase family protein  81.03 
 
 		 422 aa  365  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.538338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  38.1 
 
 		 432 aa  133  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  34.06 
 
 		 451 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  34.93 
 
 		 451 aa  132  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  33.63 
 
 		 452 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  38.76 
 
 		 429 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  33.92 
 
 		 451 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  34.05 
 
 		 420 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  32.03 
 
 		 452 aa  122  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  31.58 
 
 		 430 aa  111  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  30.51 
 
 		 463 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  32.37 
 
 		 384 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  32.04 
 
 		 393 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  33.64 
 
 		 384 aa  98.6  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  31.88 
 
 		 397 aa  94.7  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  34.4 
 
 		 456 aa  89.7  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  33.64 
 
 		 451 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  33.94 
 
 		 451 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  33.94 
 
 		 451 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1272  phage integrase family protein  31.02 
 
 		 425 aa  86.7  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000707551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3853  integrase family protein  30.73 
 
 		 500 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  29.87 
 
 		 402 aa  86.7  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  31.3 
 
 		 376 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  30.43 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  28.81 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  30.87 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  30.26 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  33.16 
 
 		 482 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  32.28 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  26.05 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1370  phage integrase  27.84 
 
 		 423 aa  62.4  0.000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000628694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0775  phage integrase family protein  30.95 
 
 		 286 aa  62  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0341069  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  23.15 
 
 		 467 aa  61.6  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  30.14 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  31.41 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3493  integrase family protein  26.64 
 
 		 409 aa  59.3  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.247982  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1118  tyrosine recombinase XerD  30.57 
 
 		 304 aa  58.9  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  26.43 
 
 		 379 aa  58.9  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  40.26 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  30.77 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  30.41 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  28.64 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1891  phage integrase family protein  39.74 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0939  integrase family protein  23.72 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0828563 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  26.7 
 
 		 365 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2723  integrase family protein  26.64 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  25 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2567  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.27 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  25.45 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2900  phage integrase  25 
 
 		 391 aa  55.8  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211341  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  25.42 
 
 		 414 aa  54.7  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  29.25 
 
 		 159 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  25.91 
 
 		 367 aa  54.7  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  30.64 
 
 		 295 aa  53.9  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2439  integrase family protein  23.79 
 
 		 283 aa  54.3  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000285613  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0116  Phage integrase, N-terminal SAM- like  40.74 
 
 		 309 aa  54.3  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  31.25 
 
 		 295 aa  53.9  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  23.11 
 
 		 444 aa  54.3  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  29.48 
 
 		 340 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  28.05 
 
 		 388 aa  53.5  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  22.22 
 
 		 410 aa  53.1  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3366  integron integrase  28.16 
 
 		 332 aa  53.1  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.341619 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  27.23 
 
 		 317 aa  53.1  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  26.26 
 
 		 298 aa  52.8  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2714  integron integrase  28.16 
 
 		 332 aa  53.1  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  26.44 
 
 		 412 aa  52.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2692  tyrosine recombinase XerD  28.25 
 
 		 295 aa  52.8  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.457784  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  26.82 
 
 		 295 aa  52.4  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  26.67 
 
 		 387 aa  52.4  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4618  integrase family protein  24.78 
 
 		 311 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  25.99 
 
 		 381 aa  52.4  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0724  integrase family protein  38.27 
 
 		 308 aa  52.4  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.971464 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0017  integrase family protein  28.5 
 
 		 414 aa  52.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  40.48 
 
 		 319 aa  52.4  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4462  integrase family protein  24.78 
 
 		 311 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0590  tyrosine recombinase XerD  29.49 
 
 		 306 aa  52  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.07 
 
 		 296 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 296 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.74 
 
 		 296 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.74 
 
 		 296 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.74 
 
 		 296 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  25 
 
 		 414 aa  51.2  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.07 
 
 		 296 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2601  integrase family protein  23.58 
 
 		 399 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.74 
 
 		 296 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 296 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  24.62 
 
 		 424 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0173  tyrosine recombinase XerD  25.33 
 
 		 309 aa  51.2  0.00001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.861385  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2745  integrase family protein  23.58 
 
 		 415 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.99512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3045  phage integrase  23.58 
 
 		 415 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53570  putative integrase  28.17 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000326616  decreased coverage  0.0000890956 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.74 
 
 		 296 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  25.55 
 
 		 316 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  29.14 
 
 		 295 aa  51.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4591  integrase family protein  27.03 
 
 		 316 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000000427706  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  28.63 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.74 
 
 		 296 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0687  Phage integrase  38.75 
 
 		 310 aa  50.8  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.004827  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0736  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.5 
 
 		 294 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>