More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0620 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  77.35 
 
 		 452 aa  705    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  100 
 
 		 452 aa  920    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  77.75 
 
 		 451 aa  702    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  73.23 
 
 		 451 aa  674    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  73 
 
 		 451 aa  688    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  53.83 
 
 		 432 aa  424  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  48.9 
 
 		 429 aa  348  2e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  42.21 
 
 		 420 aa  294  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  35.49 
 
 		 463 aa  250  4e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3752  phage integrase family protein  37.41 
 
 		 422 aa  239  9e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.538338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  34.32 
 
 		 384 aa  206  5e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  33.33 
 
 		 430 aa  206  7e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  34.95 
 
 		 393 aa  198  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  32.84 
 
 		 384 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  31.38 
 
 		 397 aa  175  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  31.84 
 
 		 411 aa  171  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  31.52 
 
 		 434 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  31.37 
 
 		 388 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3853  integrase family protein  31.09 
 
 		 500 aa  152  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  30.83 
 
 		 400 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  27.85 
 
 		 444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1236  phage integrase  27.59 
 
 		 399 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449507  normal  0.10874 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  28.3 
 
 		 400 aa  134  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  26.78 
 
 		 467 aa  133  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  28.71 
 
 		 400 aa  133  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2401  phage integrase  33.63 
 
 		 242 aa  130  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340015  normal  0.0277032 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  27.63 
 
 		 401 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2745  integrase family protein  28.71 
 
 		 415 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.99512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2601  integrase family protein  28.71 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3045  phage integrase  28.71 
 
 		 415 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3540  integrase family protein  29.44 
 
 		 399 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  26.62 
 
 		 400 aa  125  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  26.62 
 
 		 400 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  29.46 
 
 		 424 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3747  integrase  26.1 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  25.94 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  28.19 
 
 		 402 aa  117  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0497  integrase family protein  28.29 
 
 		 412 aa  113  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  25.98 
 
 		 376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  25.74 
 
 		 376 aa  107  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0807  integrase protein  39.75 
 
 		 181 aa  107  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  25.74 
 
 		 376 aa  106  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  26.1 
 
 		 376 aa  106  9e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  27.97 
 
 		 406 aa  103  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1865  integrase family protein  26.28 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.94549  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31280  putative integrase  26.28 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000488668  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2399  hypothetical protein  45.04 
 
 		 137 aa  102  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229698  normal  0.0250128 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  26.82 
 
 		 412 aa  99.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2625  phage integrase family protein  25.79 
 
 		 400 aa  99  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  26.13 
 
 		 410 aa  98.6  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3954  hypothetical protein  67.11 
 
 		 79 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  23.41 
 
 		 379 aa  98.2  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  26.13 
 
 		 417 aa  98.2  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3867  phage integrase  29.8 
 
 		 400 aa  97.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  25 
 
 		 451 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  25 
 
 		 451 aa  94  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  24.51 
 
 		 451 aa  94  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  25.78 
 
 		 417 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  24.21 
 
 		 456 aa  91.3  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  23.64 
 
 		 482 aa  90.5  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  23.58 
 
 		 396 aa  89.4  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2460  integrase family protein  30.33 
 
 		 415 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5073  hypothetical protein  38.99 
 
 		 159 aa  89  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  24.8 
 
 		 387 aa  87  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3498  integrase family protein  25.56 
 
 		 486 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  27.54 
 
 		 412 aa  85.9  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  25.08 
 
 		 337 aa  85.9  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  28.24 
 
 		 397 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  28.67 
 
 		 439 aa  84  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  26.1 
 
 		 415 aa  83.6  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2136  phage integrase family protein  25 
 
 		 389 aa  83.6  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0404563  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0919  integrase family protein  24.01 
 
 		 448 aa  83.2  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.295922  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  26.86 
 
 		 426 aa  82.4  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3493  integrase family protein  24.12 
 
 		 409 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.247982  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0686  integrase family protein  25.05 
 
 		 472 aa  82.8  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  25.65 
 
 		 443 aa  82  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0094  Phage integrase  25.11 
 
 		 449 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000297047  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  28.75 
 
 		 413 aa  80.1  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  24.88 
 
 		 449 aa  80.1  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  29.18 
 
 		 420 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3724  putative integrase protein  40.57 
 
 		 143 aa  77.8  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  25.67 
 
 		 433 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1085  hypothetical protein  25 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  23.67 
 
 		 421 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  25.06 
 
 		 414 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  25.13 
 
 		 401 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1370  phage integrase  25.97 
 
 		 423 aa  75.9  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000628694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  24.56 
 
 		 400 aa  75.1  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2351  phage integrase  22.61 
 
 		 452 aa  74.7  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0439669  hitchhiker  0.00873644 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  23.56 
 
 		 395 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  22.08 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1272  phage integrase family protein  25.75 
 
 		 425 aa  73.6  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000707551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  24.23 
 
 		 420 aa  73.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  24.05 
 
 		 396 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2018  integrase family protein  26.7 
 
 		 452 aa  72.4  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  24.48 
 
 		 439 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1118  integrase family protein  29 
 
 		 384 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.868732  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  26.22 
 
 		 381 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  23.82 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  23.88 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>