More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1844 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  100 
 
 
426 aa  880    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  36.79 
 
 
413 aa  272  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  36.54 
 
 
413 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  37.91 
 
 
414 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  36.78 
 
 
412 aa  248  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  34.61 
 
 
413 aa  246  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  34.99 
 
 
400 aa  237  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  35.1 
 
 
417 aa  232  8.000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3306  Phage integrase  33.18 
 
 
450 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889733  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2460  integrase family protein  32.94 
 
 
415 aa  206  8e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  31.75 
 
 
389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  32.35 
 
 
449 aa  184  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  31.32 
 
 
439 aa  182  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3867  phage integrase  32.39 
 
 
400 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2900  phage integrase  30.99 
 
 
391 aa  171  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211341  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4935  putative phage-like integrase  28.01 
 
 
434 aa  167  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  28.81 
 
 
427 aa  162  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2211  phage integrase  28.47 
 
 
423 aa  161  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684899  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  27.92 
 
 
433 aa  145  9e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  30.46 
 
 
425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  27.88 
 
 
439 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  30.08 
 
 
420 aa  138  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  28.47 
 
 
400 aa  137  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  27.81 
 
 
422 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  28.43 
 
 
399 aa  134  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  27.32 
 
 
419 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  26.98 
 
 
439 aa  133  7.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  27.11 
 
 
410 aa  132  9e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  27.99 
 
 
406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  24.94 
 
 
414 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  29.23 
 
 
402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  28.2 
 
 
400 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  30.12 
 
 
361 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  28.99 
 
 
409 aa  131  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  27.47 
 
 
422 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  25.36 
 
 
414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  28.04 
 
 
420 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  27.47 
 
 
395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  28.16 
 
 
388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3683  phage integrase family protein  27.12 
 
 
444 aa  126  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  26.6 
 
 
413 aa  126  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  27.78 
 
 
398 aa  125  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  27.51 
 
 
395 aa  124  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  26.37 
 
 
403 aa  124  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  30 
 
 
414 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  28.98 
 
 
410 aa  124  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  30 
 
 
409 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  28.39 
 
 
400 aa  123  5e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  30 
 
 
409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  26.78 
 
 
401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1371  phage integrase family protein  26.5 
 
 
453 aa  120  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  26.81 
 
 
402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  29.44 
 
 
418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  26.33 
 
 
405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1262  integrase family protein  25.3 
 
 
418 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  26.5 
 
 
437 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  25.8 
 
 
387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  25.78 
 
 
418 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3563  integrase family protein  25.9 
 
 
418 aa  114  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1172  integrase family protein  25.9 
 
 
418 aa  114  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69238  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2142  phage integrase  26.83 
 
 
418 aa  113  7.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306676  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3273  phage integrase family protein  24.88 
 
 
401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0956673  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2675  hypothetical protein  24.95 
 
 
443 aa  110  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  28.17 
 
 
412 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3366  phage integrase family protein  25.26 
 
 
394 aa  110  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  25.52 
 
 
403 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1465  phage integrase  25.85 
 
 
418 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0137829  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  24.88 
 
 
402 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  23.2 
 
 
440 aa  108  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  27.14 
 
 
410 aa  108  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4160  phage integrase family protein  26.82 
 
 
419 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0690268  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1967  integrase family protein  26.26 
 
 
429 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.0364461 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2336  Phage integrase  25.47 
 
 
426 aa  107  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3112  integrase family protein  24.64 
 
 
418 aa  106  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3410  integrase family protein  23.8 
 
 
401 aa  106  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134022  hitchhiker  0.000868318 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  26.22 
 
 
467 aa  106  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3983  integrase family protein  25.24 
 
 
404 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  25.92 
 
 
393 aa  104  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3095  integrase family protein  30.51 
 
 
392 aa  104  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000033184 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2279  Phage integrase  23.79 
 
 
414 aa  103  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0066545  normal  0.0551798 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6547  integrase family protein  25.06 
 
 
455 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352142  normal  0.0182485 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3062  phage integrase  25.78 
 
 
418 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361431  normal  0.0996208 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2668  phage integrase family site specific recombinase  23.19 
 
 
411 aa  103  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2845  phage integrase family protein  24.94 
 
 
409 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  0.121401 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1236  phage integrase  27.67 
 
 
399 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449507  normal  0.10874 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0550  phage integrase family protein  23.25 
 
 
413 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2875  phage integrase family protein  25 
 
 
422 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.698524  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4470  putative phage integrase  27.49 
 
 
399 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.052147 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2625  phage integrase family protein  28.24 
 
 
400 aa  101  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1709  putative phage integrase  24.49 
 
 
446 aa  101  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558135  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0496  phage integrase  25.12 
 
 
418 aa  101  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  25.19 
 
 
411 aa  100  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  22.28 
 
 
390 aa  99.4  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  27.78 
 
 
415 aa  99.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  26.41 
 
 
397 aa  99.4  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  25.21 
 
 
432 aa  98.6  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  24.46 
 
 
404 aa  98.6  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  28.01 
 
 
417 aa  97.4  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3232  integrase family protein  24.88 
 
 
434 aa  97.1  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.462781 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3484  phage integrase family protein  26.27 
 
 
418 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>