More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3493 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3493  integrase family protein  100 
 
 		 409 aa  848    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.247982  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3498  integrase family protein  33.82 
 
 		 486 aa  239  9e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1085  hypothetical protein  37.32 
 
 		 413 aa  233  6e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  35.84 
 
 		 417 aa  229  7e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  37.5 
 
 		 406 aa  224  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  33.73 
 
 		 424 aa  172  9e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1370  phage integrase  27.75 
 
 		 423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000628694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1272  phage integrase family protein  25.9 
 
 		 425 aa  123  7e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000707551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2136  phage integrase family protein  29.13 
 
 		 389 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0404563  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0614  integrase family protein  26.54 
 
 		 476 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  26.42 
 
 		 410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  26.65 
 
 		 412 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0596  integrase family protein  26.46 
 
 		 515 aa  103  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  25.68 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  26.15 
 
 		 451 aa  91.3  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0474  integrase family protein  24.81 
 
 		 442 aa  91.3  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  24.94 
 
 		 451 aa  87  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  29.21 
 
 		 398 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0606  hypothetical protein  24.28 
 
 		 505 aa  83.6  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0402  hypothetical protein  24.28 
 
 		 505 aa  83.6  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.124303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  24.12 
 
 		 452 aa  82.8  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  25.34 
 
 		 412 aa  82.8  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  25.34 
 
 		 418 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2460  integrase family protein  25.84 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  26.65 
 
 		 396 aa  80.5  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1555  phage integrase, putative  27.93 
 
 		 423 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.206278  decreased coverage  0.0000047649 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  23.38 
 
 		 402 aa  79.7  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  23.89 
 
 		 420 aa  79  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  25.74 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  23.06 
 
 		 434 aa  77.4  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0094  Phage integrase  23.84 
 
 		 449 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000297047  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3323  integrase family protein  23.91 
 
 		 441 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0845  phage integrase  24.94 
 
 		 457 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1326  phage integrase family protein  24.94 
 
 		 457 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.558955  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  25.13 
 
 		 421 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  24.14 
 
 		 418 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0919  integrase family protein  23.19 
 
 		 448 aa  75.1  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.295922  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  24.15 
 
 		 463 aa  75.1  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  25.12 
 
 		 452 aa  74.7  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0234  phage integrase family protein  23.89 
 
 		 416 aa  73.6  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  23.88 
 
 		 418 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  23.58 
 
 		 393 aa  73.2  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  26.09 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  25.14 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  23.28 
 
 		 429 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3752  phage integrase family protein  23.61 
 
 		 422 aa  69.7  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.538338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  22.57 
 
 		 444 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1686  phage integrase family protein  22.89 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.034435  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1761  phage integrase family protein  23.16 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0148676  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  23.8 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3340  phage integrase family protein  30.57 
 
 		 452 aa  68.2  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.58116  normal  0.0453376 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  23.43 
 
 		 451 aa  67.8  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  21.6 
 
 		 400 aa  68.2  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  21.6 
 
 		 400 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  24.27 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3028  putative phage integrase family protein  23.47 
 
 		 486 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1791  phage integrase family protein  22.89 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.275952  normal  0.224939 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  26.49 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  25.62 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  24.02 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2601  integrase family protein  23.67 
 
 		 399 aa  67  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3540  integrase family protein  23.67 
 
 		 399 aa  67  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  22.48 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  22.61 
 
 		 443 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  23.62 
 
 		 403 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02509  Fels-2 prophage protein  24.56 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  22.22 
 
 		 426 aa  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02473  hypothetical protein  24.56 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.36664  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  24.81 
 
 		 419 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2905  phage integrase family protein  24.56 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  24.33 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  22.78 
 
 		 403 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1309  integrase family protein  22.47 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00894189  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2745  integrase family protein  23.59 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.99512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  22.51 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3582  integrase  22.28 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000010448 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  25.19 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0318  hypothetical protein  22.38 
 
 		 515 aa  65.5  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  25.49 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3045  phage integrase  23.59 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3385  site-specific recombinase, phage integrase family  23.12 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059991  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  25.98 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  22.85 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  28.9 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2717  Phage integrase  28.07 
 
 		 479 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0686  integrase family protein  23.02 
 
 		 472 aa  64.3  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  27.05 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  22.22 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2529  phage integrase  22.56 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153189  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  27.2 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2956  integrase family protein  22.2 
 
 		 487 aa  63.5  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1687  integrase family protein  27.81 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  23.74 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2906  integrase family protein  26.67 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0825768  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  22.45 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  22.51 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  23.63 
 
 		 404 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  23.28 
 
 		 400 aa  62.8  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  25 
 
 		 401 aa  62.4  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3461  integrase family protein  27.63 
 
 		 435 aa  62.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538189  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>