More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2240 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  100 
 
 		 406 aa  837    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  54.24 
 
 		 424 aa  425  1e-118  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  48.64 
 
 		 417 aa  397  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1085  hypothetical protein  46.91 
 
 		 413 aa  380  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3498  integrase family protein  35.99 
 
 		 486 aa  264  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3493  integrase family protein  37.5 
 
 		 409 aa  224  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.247982  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0614  integrase family protein  32.19 
 
 		 476 aa  211  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1272  phage integrase family protein  30.79 
 
 		 425 aa  189  1e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000707551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  31.33 
 
 		 410 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1370  phage integrase  27.25 
 
 		 423 aa  173  5e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000628694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2136  phage integrase family protein  30.35 
 
 		 389 aa  145  9e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0404563  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3340  phage integrase family protein  28.01 
 
 		 452 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.58116  normal  0.0453376 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  26.75 
 
 		 412 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0919  integrase family protein  27.35 
 
 		 448 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.295922  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0845  phage integrase  26.98 
 
 		 457 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1326  phage integrase family protein  26.98 
 
 		 457 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.558955  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  27.62 
 
 		 387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  29.43 
 
 		 397 aa  116  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2717  Phage integrase  26.46 
 
 		 479 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3323  integrase family protein  26.48 
 
 		 441 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3461  integrase family protein  26.99 
 
 		 435 aa  112  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  28.88 
 
 		 411 aa  110  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  27.5 
 
 		 451 aa  110  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0094  Phage integrase  24.31 
 
 		 449 aa  107  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000297047  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  28.57 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  29.08 
 
 		 400 aa  104  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  27.97 
 
 		 452 aa  103  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  28.75 
 
 		 452 aa  103  7e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  27.25 
 
 		 402 aa  103  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2211  phage integrase  27 
 
 		 423 aa  102  8e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684899  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  27.91 
 
 		 389 aa  102  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0686  integrase family protein  25 
 
 		 472 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3805  integrase family protein  29.13 
 
 		 450 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  28.87 
 
 		 413 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  27.53 
 
 		 463 aa  99  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2460  integrase family protein  28.88 
 
 		 415 aa  99  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3867  phage integrase  29.41 
 
 		 400 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1526  phage integrase  23.75 
 
 		 440 aa  98.2  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  29.44 
 
 		 384 aa  98.2  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  27.56 
 
 		 393 aa  97.4  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  28.64 
 
 		 451 aa  97.1  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  28.03 
 
 		 412 aa  97.1  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  29.64 
 
 		 384 aa  96.7  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  28.29 
 
 		 388 aa  94  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0596  integrase family protein  26.35 
 
 		 515 aa  93.2  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2956  integrase family protein  25.78 
 
 		 487 aa  92  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  27.39 
 
 		 429 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  26.46 
 
 		 420 aa  90.9  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  25.38 
 
 		 426 aa  90.1  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0474  integrase family protein  25.36 
 
 		 442 aa  89.4  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  28.45 
 
 		 413 aa  88.6  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  26.06 
 
 		 414 aa  89  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3028  putative phage integrase family protein  26.02 
 
 		 486 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0606  hypothetical protein  28.17 
 
 		 505 aa  87.4  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0402  hypothetical protein  28.17 
 
 		 505 aa  87.4  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.124303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  26.16 
 
 		 400 aa  85.1  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  28.82 
 
 		 404 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2529  phage integrase  26.39 
 
 		 375 aa  83.6  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153189  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  23.9 
 
 		 396 aa  84  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  27.73 
 
 		 417 aa  83.6  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  27.23 
 
 		 432 aa  83.6  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  24.86 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  25.34 
 
 		 434 aa  77.8  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2399  hypothetical protein  38.4 
 
 		 137 aa  77.8  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229698  normal  0.0250128 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3752  phage integrase family protein  40.74 
 
 		 422 aa  77.4  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.538338  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  25.91 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  22.22 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0292  phage integrase family protein  24.94 
 
 		 440 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  25.07 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2142  phage integrase  26.86 
 
 		 418 aa  73.6  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  24.8 
 
 		 401 aa  72.8  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  27.25 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  24.11 
 
 		 482 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  27.64 
 
 		 397 aa  72.8  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  26.53 
 
 		 420 aa  70.1  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  24.51 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  26.49 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  25.54 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1905  hypothetical protein  24.51 
 
 		 366 aa  69.7  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.397006  hitchhiker  0.00000424663 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  22.19 
 
 		 439 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3582  integrase  24.22 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000010448 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1309  integrase family protein  24.93 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00894189  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3747  integrase  25.41 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  25.89 
 
 		 367 aa  67.4  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  22.35 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0318  hypothetical protein  23.61 
 
 		 515 aa  67  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  25.18 
 
 		 467 aa  66.6  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  24.25 
 
 		 432 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2668  phage integrase family site specific recombinase  24.58 
 
 		 411 aa  66.2  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  26.28 
 
 		 400 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  26.72 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  25.83 
 
 		 404 aa  65.9  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3366  phage integrase family protein  25.07 
 
 		 394 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  34.18 
 
 		 172 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  35.86 
 
 		 365 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  26.38 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  24.38 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0496  phage integrase  25.07 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4160  phage integrase family protein  26.47 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0690268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  27.75 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>