120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1905 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1905  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  758    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.397006  hitchhiker  0.00000424663 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  24.79 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  24.51 
 
 		 406 aa  69.7  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1085  hypothetical protein  31.4 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  34.11 
 
 		 424 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  21.94 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2136  phage integrase family protein  29.66 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0404563  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  32.28 
 
 		 410 aa  59.7  0.00000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  23.12 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1272  phage integrase family protein  30.57 
 
 		 425 aa  59.3  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000707551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0847  phage integrase  24.56 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237314  normal  0.433067 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  22.28 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  25.33 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1370  phage integrase  27.5 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000628694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  24.4 
 
 		 425 aa  56.2  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3377  phage integrase family protein  21.33 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  24.39 
 
 		 404 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  24.39 
 
 		 404 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3582  integrase  23.1 
 
 		 397 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000010448 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3498  integrase family protein  24.62 
 
 		 486 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  22.6 
 
 		 402 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  24.04 
 
 		 404 aa  54.7  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  20.53 
 
 		 387 aa  53.9  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  22.4 
 
 		 394 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  21.45 
 
 		 396 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  22.61 
 
 		 394 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  22.56 
 
 		 404 aa  53.1  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1309  integrase family protein  22.76 
 
 		 385 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00894189  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  23 
 
 		 404 aa  52.8  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  27.08 
 
 		 415 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  21.43 
 
 		 396 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3323  integrase family protein  27.22 
 
 		 441 aa  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3039  phage integrase  33.72 
 
 		 339 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3051  integrase family protein  29.66 
 
 		 413 aa  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0515706  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  20.87 
 
 		 394 aa  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  23.39 
 
 		 406 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  27.49 
 
 		 413 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  22.89 
 
 		 440 aa  51.2  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  21.81 
 
 		 394 aa  51.2  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0614  integrase family protein  27.69 
 
 		 476 aa  51.2  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3795  integrase family protein  26.39 
 
 		 413 aa  50.8  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000111159  unclonable  0.000000215958 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  28.04 
 
 		 351 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3493  integrase  34.29 
 
 		 571 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7388  putative integrase  31.88 
 
 		 432 aa  49.7  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  19.64 
 
 		 404 aa  49.7  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0657  phage integrase family protein  22.18 
 
 		 412 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.907789  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  24.91 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0292  phage integrase family protein  20.41 
 
 		 440 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  27.51 
 
 		 351 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3493  integrase family protein  23.35 
 
 		 409 aa  48.9  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.247982  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1526  phage integrase  23.08 
 
 		 440 aa  48.9  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  24.75 
 
 		 463 aa  48.5  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0792  integrase family protein  27.68 
 
 		 417 aa  48.9  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.637485 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  25 
 
 		 337 aa  47.8  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2956  integrase family protein  27.1 
 
 		 487 aa  47.8  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3028  putative phage integrase family protein  21.51 
 
 		 486 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  28.7 
 
 		 276 aa  47.8  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0350  phage integrase family protein  36.62 
 
 		 427 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.73479 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0800  phage integrase family protein  27.78 
 
 		 356 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501928  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2889  lambda integrase  27.78 
 
 		 356 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3112  integrase family protein  22.15 
 
 		 412 aa  47.4  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.053252  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0877  phage integrase family protein  27.78 
 
 		 356 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  23.84 
 
 		 414 aa  47  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3805  integrase family protein  27.78 
 
 		 450 aa  46.6  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  19.29 
 
 		 414 aa  46.6  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0919  integrase family protein  20 
 
 		 448 aa  46.6  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.295922  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  21.27 
 
 		 413 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  20.88 
 
 		 413 aa  46.6  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  24.4 
 
 		 400 aa  46.2  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0637  phage integrase family protein  25.24 
 
 		 411 aa  46.2  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102856 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  32.47 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0550  phage integrase family protein  32.39 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0970  phage integrase family protein  20.54 
 
 		 406 aa  45.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3921  phage integrase family protein  23.81 
 
 		 327 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  hitchhiker  0.00183347 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2659  integrase family protein  32.47 
 
 		 531 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5109  integrase family protein  25.77 
 
 		 420 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3606  integrase family protein  24.26 
 
 		 420 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  23.26 
 
 		 421 aa  45.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00705  hypothetical protein  25.81 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  20.49 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  21.83 
 
 		 397 aa  45.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  21.25 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  25.16 
 
 		 387 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  22.03 
 
 		 403 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1220  integrase  26.26 
 
 		 286 aa  44.3  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  32.89 
 
 		 367 aa  44.3  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  36.07 
 
 		 337 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  36.23 
 
 		 353 aa  43.9  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  19.8 
 
 		 400 aa  44.3  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0151  phage integrase  27.54 
 
 		 429 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5749  integrase family protein  24.88 
 
 		 407 aa  44.3  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.857054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  24.19 
 
 		 398 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  33.77 
 
 		 301 aa  43.9  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3686  integrase family protein  33.33 
 
 		 200 aa  43.9  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.73173  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  28.12 
 
 		 159 aa  43.9  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  34.29 
 
 		 295 aa  43.9  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04141  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  43.5  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.941036  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4538  tyrosine recombinase  33.33 
 
 		 200 aa  43.9  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000945122  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  20.89 
 
 		 402 aa  43.9  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5818  tyrosine recombinase  33.33 
 
 		 200 aa  43.9  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.855252 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>