296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3795 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3051  integrase family protein  81.11 
 
 		 413 aa  701    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0515706  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3795  integrase family protein  100 
 
 		 413 aa  855    Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000111159  unclonable  0.000000215958 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7388  putative integrase  77.67 
 
 		 432 aa  672    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0792  integrase family protein  88.97 
 
 		 417 aa  746    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.637485 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00841  integrase  33.12 
 
 		 356 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  26.8 
 
 		 449 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0672  phage integrase  27.12 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1061  phage integrase family protein  27.34 
 
 		 464 aa  107  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.69421  normal  0.669577 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  24.89 
 
 		 433 aa  98.6  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  25.2 
 
 		 427 aa  96.7  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  25.92 
 
 		 439 aa  92.8  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5206  phage integrase  25.15 
 
 		 451 aa  90.5  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1318  phage integrase  29.32 
 
 		 457 aa  90.1  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.398126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  25 
 
 		 438 aa  87.4  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2279  Phage integrase  27.13 
 
 		 414 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0066545  normal  0.0551798 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  24.23 
 
 		 413 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  23.93 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  24.47 
 
 		 402 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  25.44 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  23.93 
 
 		 414 aa  82.8  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  24.11 
 
 		 413 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  27.18 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  23.39 
 
 		 439 aa  82  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  24.53 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  26.35 
 
 		 361 aa  79  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  24.88 
 
 		 425 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4935  putative phage-like integrase  26.69 
 
 		 434 aa  77.8  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2211  phage integrase  25.46 
 
 		 423 aa  78.2  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684899  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  24.94 
 
 		 404 aa  76.3  0.0000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  25.21 
 
 		 467 aa  75.9  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  24.82 
 
 		 402 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  25.12 
 
 		 404 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3107  integrase  53.12 
 
 		 151 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0236409  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  26.6 
 
 		 404 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  23.99 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  23.23 
 
 		 422 aa  73.9  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2900  phage integrase  28.07 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2460  integrase family protein  24.4 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  24.7 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  23.17 
 
 		 416 aa  73.2  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  23.57 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  24.52 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0292  phage integrase family protein  24.03 
 
 		 440 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  26.23 
 
 		 444 aa  72.8  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  24.88 
 
 		 404 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3747  integrase  24.53 
 
 		 399 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  23.54 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  24.88 
 
 		 404 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  22.17 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3683  phage integrase family protein  25.89 
 
 		 444 aa  71.6  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  24.83 
 
 		 418 aa  71.2  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  23.41 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  23.83 
 
 		 420 aa  70.9  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3372  integrase family protein  24.65 
 
 		 601 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  25.12 
 
 		 439 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0368  phage integrase  23.96 
 
 		 469 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  24.54 
 
 		 401 aa  69.7  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3377  phage integrase family protein  25.96 
 
 		 353 aa  69.7  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  24.82 
 
 		 404 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  25 
 
 		 387 aa  69.3  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4347  integrase family protein  25.71 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  25.41 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  24.53 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  22.9 
 
 		 394 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  24.76 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  24.51 
 
 		 400 aa  67  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  22.01 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  23.1 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  26.44 
 
 		 411 aa  65.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2119  integrative genetic element Gsu56, integrase  26.29 
 
 		 453 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  25.75 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  23.91 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1410  Phage integrase  25.41 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  24.43 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  24.57 
 
 		 396 aa  63.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2184  Phage integrase  24.22 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.264722  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  23.56 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  27.03 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  26.1 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3669  prophage CP4-like integrase  22.82 
 
 		 462 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18314  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  23.87 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.24 
 
 		 394 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0657  phage integrase family protein  23.24 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.907789  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  23.22 
 
 		 400 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  23.22 
 
 		 400 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.24 
 
 		 394 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  21.61 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0970  phage integrase family protein  22.62 
 
 		 406 aa  62  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  26.17 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  22.74 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  24.35 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  23.52 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  24.11 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  23.93 
 
 		 440 aa  61.6  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  23.73 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  25.29 
 
 		 437 aa  61.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0813  integrase family protein  25.99 
 
 		 427 aa  61.6  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000471518 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3366  phage integrase family protein  24 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  25.07 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1371  phage integrase family protein  22.98 
 
 		 453 aa  61.2  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>