286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3051 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3051  integrase family protein  100 
 
 		 413 aa  850    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0515706  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7388  putative integrase  84.95 
 
 		 432 aa  734    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3795  integrase family protein  81.11 
 
 		 413 aa  686    Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000111159  unclonable  0.000000215958 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0792  integrase family protein  81.37 
 
 		 417 aa  684    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.637485 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00841  integrase  33.77 
 
 		 356 aa  155  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0672  phage integrase  27.54 
 
 		 410 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  27.93 
 
 		 449 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1061  phage integrase family protein  27.01 
 
 		 464 aa  113  7.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.69421  normal  0.669577 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  27.85 
 
 		 427 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  25.87 
 
 		 439 aa  95.5  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  24.7 
 
 		 414 aa  94  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5206  phage integrase  24.78 
 
 		 451 aa  94  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10612  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  24.7 
 
 		 414 aa  93.2  8e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1318  phage integrase  28.09 
 
 		 457 aa  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.398126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2279  Phage integrase  25.47 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0066545  normal  0.0551798 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  24.57 
 
 		 433 aa  84  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  25.88 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2211  phage integrase  26.82 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684899  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4935  putative phage-like integrase  27.54 
 
 		 434 aa  81.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  23.81 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0368  phage integrase  24.55 
 
 		 469 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  26.67 
 
 		 361 aa  79.7  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  23.49 
 
 		 416 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  23.17 
 
 		 439 aa  77.8  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  26 
 
 		 414 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  26.2 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  28.14 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  22.53 
 
 		 425 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3107  integrase  52.31 
 
 		 151 aa  74.7  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0236409  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  25.24 
 
 		 438 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  23.89 
 
 		 420 aa  71.2  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  22.98 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  25.41 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0948  putative integrase  24.79 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  24 
 
 		 413 aa  69.7  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  22.51 
 
 		 419 aa  68.6  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  24.23 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3372  integrase family protein  23.76 
 
 		 601 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  23.86 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  24.1 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  25.31 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  24.57 
 
 		 439 aa  67  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  22.67 
 
 		 404 aa  67  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  23.99 
 
 		 404 aa  67  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  23.99 
 
 		 404 aa  67  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  23.54 
 
 		 404 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0292  phage integrase family protein  23.84 
 
 		 440 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  21.06 
 
 		 422 aa  66.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  21.94 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2892  phage integrase family protein  23.5 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  24.08 
 
 		 418 aa  65.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  24.53 
 
 		 440 aa  65.1  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  22.77 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3747  integrase  24 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  25.36 
 
 		 437 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  23.99 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02509  Fels-2 prophage protein  23.15 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02473  hypothetical protein  23.15 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.36664  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  23.08 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2905  phage integrase family protein  23.42 
 
 		 436 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2119  integrative genetic element Gsu56, integrase  27.23 
 
 		 453 aa  63.2  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  23.66 
 
 		 394 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  23.87 
 
 		 415 aa  63.2  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  23.75 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  23.41 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2460  phage integrase family protein  24.93 
 
 		 413 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269087  normal  0.494365 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  26.87 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2900  phage integrase  25.71 
 
 		 391 aa  62.8  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0813  integrase family protein  28.22 
 
 		 427 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000471518 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  25.06 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  21.72 
 
 		 411 aa  62.4  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  22.82 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1675  Phage integrase  22.88 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  24.58 
 
 		 404 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3683  phage integrase family protein  25.5 
 
 		 444 aa  62  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  22.81 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  22.86 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  23.75 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  24.46 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3466  integrase family protein  23.52 
 
 		 644 aa  60.5  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3377  phage integrase family protein  25.28 
 
 		 353 aa  60.5  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0970  phage integrase family protein  23.43 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0657  phage integrase family protein  21.88 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.907789  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  20.35 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  24.72 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  24.39 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  24.72 
 
 		 409 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1340  phage integrase family protein  23.36 
 
 		 487 aa  59.7  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.680009  normal  0.929089 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  23 
 
 		 404 aa  59.7  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  23.31 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1097  putative phage integrase  23.29 
 
 		 643 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0408493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1370  prophage CP4-57 integrase  22.59 
 
 		 399 aa  59.7  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000288538  normal  0.0147519 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  23.69 
 
 		 400 aa  59.7  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  24.35 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0697  integrase family protein  21.69 
 
 		 618 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1639  phage integrase family protein  26.6 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0427266  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  25.32 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  24.71 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1143  phage integrase family protein  23.73 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  23.33 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>