83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5206 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007949  Bpro_5206  phage integrase  100 
 
 
451 aa  923    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10612  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1318  phage integrase  35.51 
 
 
457 aa  206  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.398126  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0368  phage integrase  30.09 
 
 
469 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00841  integrase  27.88 
 
 
356 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1061  phage integrase family protein  26.84 
 
 
464 aa  103  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.69421  normal  0.669577 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3051  integrase family protein  24.57 
 
 
413 aa  96.7  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0515706  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7388  putative integrase  25.44 
 
 
432 aa  95.1  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0792  integrase family protein  26.59 
 
 
417 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.637485 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3795  integrase family protein  25.15 
 
 
413 aa  82  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000111159  unclonable  0.000000215958 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0672  phage integrase  24.31 
 
 
410 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  26.23 
 
 
361 aa  77  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3107  integrase  30.77 
 
 
151 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0236409  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2279  Phage integrase  28.4 
 
 
414 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0066545  normal  0.0551798 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  23.05 
 
 
409 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3306  Phage integrase  23.58 
 
 
450 aa  70.5  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889733  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  27.15 
 
 
414 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  27.15 
 
 
409 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  27.15 
 
 
409 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  23.62 
 
 
439 aa  67  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  24.04 
 
 
413 aa  65.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  24.75 
 
 
400 aa  65.9  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  25.32 
 
 
413 aa  65.1  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2015  phage integrase family site specific recombinase  26.51 
 
 
390 aa  64.7  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  20.36 
 
 
414 aa  64.7  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  25.45 
 
 
410 aa  63.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  20.59 
 
 
414 aa  62.4  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  27.83 
 
 
389 aa  62.4  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2211  phage integrase  23.1 
 
 
423 aa  62  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684899  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  24.55 
 
 
414 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  24.59 
 
 
433 aa  61.6  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  24.05 
 
 
420 aa  60.5  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  23.82 
 
 
425 aa  60.1  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3683  phage integrase family protein  24.31 
 
 
444 aa  60.1  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  21.8 
 
 
413 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1639  phage integrase family protein  23.38 
 
 
403 aa  57.8  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0427266  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  23.29 
 
 
418 aa  57.8  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  25.08 
 
 
440 aa  56.6  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  26.36 
 
 
422 aa  55.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  23.74 
 
 
422 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2900  phage integrase  26.84 
 
 
391 aa  55.1  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211341  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  22.73 
 
 
419 aa  54.7  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2668  phage integrase family site specific recombinase  23.85 
 
 
411 aa  54.7  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  26.82 
 
 
412 aa  53.9  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  24.43 
 
 
439 aa  53.1  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4160  phage integrase family protein  23.53 
 
 
419 aa  53.1  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0690268  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  24.29 
 
 
413 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  25.97 
 
 
417 aa  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  24.31 
 
 
427 aa  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1655  phage integrase family protein  27.6 
 
 
420 aa  51.6  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0191595  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4935  putative phage-like integrase  26.22 
 
 
434 aa  51.2  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2460  integrase family protein  27.03 
 
 
415 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  28.22 
 
 
420 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  25.57 
 
 
418 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  25.68 
 
 
417 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3239  integrase family protein  27.95 
 
 
424 aa  48.5  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0978515  normal  0.26506 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2845  phage integrase family protein  24.26 
 
 
409 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  0.121401 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  23.15 
 
 
437 aa  48.5  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3540  phage integrase family protein  26.74 
 
 
420 aa  48.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.216413  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2675  hypothetical protein  27.75 
 
 
443 aa  48.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2200  integrase family protein  28.07 
 
 
415 aa  47.8  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3867  phage integrase  27.52 
 
 
400 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  28.85 
 
 
403 aa  47.4  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2643  phage integrase family protein  26.77 
 
 
413 aa  47  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2292  phage integrase family protein  25.6 
 
 
393 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.919949  normal  0.20238 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4176  hypothetical protein  35.29 
 
 
161 aa  47  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0519  phage integrase  24.8 
 
 
434 aa  46.6  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  23.12 
 
 
404 aa  46.6  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  39.13 
 
 
432 aa  46.2  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2626  phage integrase family protein  25 
 
 
393 aa  45.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000269871  normal  0.0831358 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  22.77 
 
 
449 aa  45.8  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2336  Phage integrase  28 
 
 
426 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2142  phage integrase  23.5 
 
 
418 aa  45.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306676  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  25.34 
 
 
406 aa  45.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2942  phage integrase family protein  24.19 
 
 
392 aa  45.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000983731 
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0026  Phage integrase  30.86 
 
 
309 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  23.25 
 
 
405 aa  45.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1709  putative phage integrase  25.45 
 
 
446 aa  45.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558135  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3754  integrase family protein  25.74 
 
 
407 aa  45.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.290204  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  31.58 
 
 
402 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0496  phage integrase  21.58 
 
 
418 aa  43.5  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0388  phage integrase family site specific recombinase  39.34 
 
 
429 aa  43.5  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1277  putative phage integrase  27.05 
 
 
454 aa  43.5  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2416  integrase family protein  25.12 
 
 
443 aa  43.1  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>