More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2279 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2279  Phage integrase  100 
 
 		 414 aa  858    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0066545  normal  0.0551798 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  46.52 
 
 		 437 aa  348  1e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  40.39 
 
 		 439 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2119  integrative genetic element Gsu56, integrase  39.22 
 
 		 453 aa  295  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0813  integrase family protein  38.46 
 
 		 427 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000471518 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  34.72 
 
 		 433 aa  234  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  35.27 
 
 		 427 aa  226  6e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  34.19 
 
 		 439 aa  219  6e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  33.03 
 
 		 449 aa  219  6e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2416  integrase family protein  32.36 
 
 		 443 aa  207  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1371  phage integrase family protein  32.82 
 
 		 453 aa  204  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  28.05 
 
 		 414 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  28.05 
 
 		 414 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  28.94 
 
 		 413 aa  144  4e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  30.22 
 
 		 413 aa  143  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  28.71 
 
 		 400 aa  143  7e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  27.32 
 
 		 417 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  26.47 
 
 		 409 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  28.27 
 
 		 415 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  28.1 
 
 		 413 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  26.41 
 
 		 414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  26.41 
 
 		 409 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  28.09 
 
 		 393 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  26.16 
 
 		 409 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  27.36 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  28.06 
 
 		 413 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  31.21 
 
 		 361 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  26.1 
 
 		 399 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  25.43 
 
 		 395 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1709  putative phage integrase  25.18 
 
 		 446 aa  126  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  25.12 
 
 		 410 aa  126  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  25.43 
 
 		 400 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  25.67 
 
 		 400 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3683  phage integrase family protein  28.77 
 
 		 444 aa  123  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  25.18 
 
 		 402 aa  122  9e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6547  integrase family protein  25.82 
 
 		 455 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352142  normal  0.0182485 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1262  integrase family protein  26.56 
 
 		 418 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2015  phage integrase family site specific recombinase  27.61 
 
 		 390 aa  121  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  24.69 
 
 		 395 aa  120  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2336  Phage integrase  24.94 
 
 		 426 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  27.72 
 
 		 414 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  27.23 
 
 		 402 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  24.82 
 
 		 402 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  25.97 
 
 		 418 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  26.25 
 
 		 396 aa  117  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1130  integrase family protein  28.5 
 
 		 418 aa  116  7.999999999999999e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3112  integrase family protein  26.33 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2142  phage integrase  26.63 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  23.96 
 
 		 398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1172  integrase family protein  26.09 
 
 		 418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3563  integrase family protein  26.09 
 
 		 418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2900  phage integrase  25.69 
 
 		 391 aa  114  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  26.37 
 
 		 420 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  26.21 
 
 		 403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3366  phage integrase family protein  27.94 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  25.9 
 
 		 421 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  28.12 
 
 		 415 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1878  putative integrase  25.92 
 
 		 425 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.184819 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  26.04 
 
 		 439 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  25.06 
 
 		 404 aa  111  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3867  phage integrase  27.67 
 
 		 400 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  27.34 
 
 		 419 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  24.03 
 
 		 410 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2460  integrase family protein  28.53 
 
 		 415 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  25.06 
 
 		 404 aa  110  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  25.64 
 
 		 405 aa  110  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  25.51 
 
 		 440 aa  109  7.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  25.49 
 
 		 404 aa  109  9.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  26.89 
 
 		 397 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  25.69 
 
 		 420 aa  108  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  28.08 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  25.58 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3062  phage integrase  26.03 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361431  normal  0.0996208 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1465  phage integrase  26.57 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0137829  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0496  phage integrase  24.64 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3484  phage integrase family protein  28.3 
 
 		 418 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3232  integrase family protein  23.34 
 
 		 434 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.462781 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0672  phage integrase  27.79 
 
 		 410 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0444  integrase family protein  25.73 
 
 		 461 aa  107  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  27.29 
 
 		 402 aa  107  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  27.48 
 
 		 403 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  28.16 
 
 		 406 aa  107  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  25 
 
 		 419 aa  106  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3579  integrase  25 
 
 		 389 aa  106  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000745226 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2217  integrase family protein  26.32 
 
 		 418 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.664863  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  27.32 
 
 		 413 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0294  phage integrase  28.23 
 
 		 399 aa  104  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  26.83 
 
 		 412 aa  104  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  26.98 
 
 		 432 aa  104  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  27.47 
 
 		 395 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  24.64 
 
 		 401 aa  103  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  23.79 
 
 		 426 aa  103  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  25.85 
 
 		 402 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3983  integrase family protein  25.06 
 
 		 404 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  25.91 
 
 		 389 aa  103  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  24.94 
 
 		 404 aa  103  7e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  25.99 
 
 		 397 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  25.65 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0318  hypothetical protein  28.32 
 
 		 515 aa  102  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  24.88 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>