222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1878 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1878  putative integrase  100 
 
 		 425 aa  869    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.184819 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1914  integrative genetic element Gsu32, integrase, putative  56.25 
 
 		 433 aa  484  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.409637  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3239  integrase family protein  56.56 
 
 		 424 aa  478  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0978515  normal  0.26506 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5552  integrase family protein  55.4 
 
 		 424 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1028  Phage integrase  54.92 
 
 		 424 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214982  normal  0.0128497 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4138  integrase family protein  40.2 
 
 		 403 aa  263  4.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.551003  hitchhiker  0.000000726175 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  29.84 
 
 		 437 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  26.83 
 
 		 433 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2279  Phage integrase  25.92 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0066545  normal  0.0551798 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  26.32 
 
 		 449 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  26.25 
 
 		 439 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  27.13 
 
 		 439 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1371  phage integrase family protein  24.95 
 
 		 453 aa  98.2  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  28.09 
 
 		 413 aa  95.5  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2119  integrative genetic element Gsu56, integrase  32.44 
 
 		 453 aa  94.4  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  28.06 
 
 		 413 aa  94  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2416  integrase family protein  25.87 
 
 		 443 aa  93.6  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0813  integrase family protein  33.17 
 
 		 427 aa  90.5  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000471518 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  30.4 
 
 		 432 aa  89  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  26.55 
 
 		 427 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  26.35 
 
 		 410 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  28.19 
 
 		 425 aa  82.8  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  30.04 
 
 		 361 aa  82.4  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  26.77 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3867  phage integrase  28.21 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  29.91 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4935  putative phage-like integrase  30.24 
 
 		 434 aa  79  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2526  Phage integrase  24.39 
 
 		 481 aa  78.6  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000237436  normal  0.0434699 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  32.09 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  23.66 
 
 		 414 aa  78.2  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  29.67 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  31.88 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  23.66 
 
 		 414 aa  77  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  23.65 
 
 		 403 aa  77  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  23.56 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  25.5 
 
 		 439 aa  75.1  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0388  phage integrase family site specific recombinase  24.32 
 
 		 429 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  25.24 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  24.48 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2668  phage integrase family site specific recombinase  25.25 
 
 		 411 aa  73.9  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  25.77 
 
 		 418 aa  73.9  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  25.38 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2942  phage integrase family protein  24.47 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000983731 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2845  phage integrase family protein  27.14 
 
 		 409 aa  73.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  0.121401 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  30.62 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3410  integrase family protein  23.37 
 
 		 401 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134022  hitchhiker  0.000868318 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  35.65 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3273  phage integrase family protein  23.12 
 
 		 401 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0956673  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  26.79 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0318  hypothetical protein  27.43 
 
 		 515 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2650  integrase family protein  23.19 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0205154  hitchhiker  0.00000395125 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1639  phage integrase family protein  27.75 
 
 		 403 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0427266  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04051  site-specific recombinase, phage integrase family protein  24.74 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1997  integrase family protein  25.73 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.726133 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  25 
 
 		 409 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2211  phage integrase  26.91 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684899  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  25.74 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  25.99 
 
 		 422 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3683  phage integrase family protein  29.18 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2767  phage integrase family protein  27.71 
 
 		 421 aa  68.2  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  25.78 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3579  integrase  22.4 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000745226 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  25.6 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3261  phage integrase  23.82 
 
 		 417 aa  67  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0304734  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  24.21 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1410  Phage integrase  22.52 
 
 		 396 aa  66.6  0.0000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2900  phage integrase  25.6 
 
 		 391 aa  66.6  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211341  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  24.55 
 
 		 417 aa  66.6  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2501  phage integrase, putative  25.92 
 
 		 469 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  24.08 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  25.53 
 
 		 443 aa  65.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5642  Phage integrase  27.14 
 
 		 403 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2292  phage integrase family protein  25 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.919949  normal  0.20238 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2626  phage integrase family protein  24.3 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000269871  normal  0.0831358 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2203  integrase family protein  24.93 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0772  integrase family protein  24.07 
 
 		 418 aa  63.2  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.045428  normal  0.308658 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0745  phage integrase family protein  24.07 
 
 		 418 aa  63.2  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0686713  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2015  phage integrase family site specific recombinase  21.22 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3013  phage integrase family site specific recombinase  26.56 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2704  Phage integrase  25.18 
 
 		 404 aa  62.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143842  hitchhiker  0.00000139825 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2200  integrase family protein  25.37 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0922  Phage integrase  24.41 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12188  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  27.07 
 
 		 398 aa  62.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0948  putative integrase  23.12 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0775  integrase family protein  24.07 
 
 		 418 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012471 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5324  integrase  24.02 
 
 		 395 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  24.43 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3610  phage integrase family protein  24.07 
 
 		 418 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000842919  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  24.87 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  25.32 
 
 		 420 aa  62  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  25.95 
 
 		 400 aa  62  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4176  hypothetical protein  41.79 
 
 		 161 aa  62  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1116  phage integrase family protein  22.93 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0425544  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  24.49 
 
 		 409 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1100  site-specific recombinase, phage integrase family  25 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1967  integrase family protein  22.53 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.0364461 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1896  putative integrase prophage protein  25.56 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.240804  normal  0.815259 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  24.62 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  25.95 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  25.36 
 
 		 429 aa  58.9  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>