More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3983 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4470  putative phage integrase  87.15 
 
 		 399 aa  685    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.052147 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3983  integrase family protein  100 
 
 		 404 aa  825    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3095  integrase family protein  61.42 
 
 		 392 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000033184 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  57.64 
 
 		 414 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  57.64 
 
 		 409 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  57.39 
 
 		 409 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  57.14 
 
 		 409 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  55.19 
 
 		 410 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  40.28 
 
 		 440 aa  292  8e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  36.19 
 
 		 418 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  38.01 
 
 		 410 aa  237  4e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1262  integrase family protein  36.25 
 
 		 418 aa  231  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3563  integrase family protein  32.93 
 
 		 418 aa  224  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1172  integrase family protein  32.93 
 
 		 418 aa  224  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3062  phage integrase  33.74 
 
 		 418 aa  223  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361431  normal  0.0996208 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  34.11 
 
 		 403 aa  219  5e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3112  integrase family protein  31.3 
 
 		 418 aa  212  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3366  phage integrase family protein  35.11 
 
 		 394 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2142  phage integrase  31.67 
 
 		 418 aa  206  8e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0496  phage integrase  31.54 
 
 		 418 aa  205  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  33.09 
 
 		 402 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  32.74 
 
 		 400 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1465  phage integrase  34.43 
 
 		 418 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0137829  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  33.17 
 
 		 399 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  32.65 
 
 		 389 aa  200  5e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2336  Phage integrase  32.13 
 
 		 426 aa  199  6e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1130  integrase family protein  33.5 
 
 		 418 aa  199  6e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  32.49 
 
 		 398 aa  199  7.999999999999999e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  32.49 
 
 		 395 aa  199  9e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3484  phage integrase family protein  35 
 
 		 418 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6547  integrase family protein  31.19 
 
 		 455 aa  192  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352142  normal  0.0182485 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  32.23 
 
 		 395 aa  192  8e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  31.73 
 
 		 402 aa  192  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  32.84 
 
 		 415 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  31.98 
 
 		 400 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3232  integrase family protein  30.75 
 
 		 434 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.462781 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1709  putative phage integrase  29.83 
 
 		 446 aa  186  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558135  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  32.44 
 
 		 417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2875  phage integrase family protein  29.82 
 
 		 422 aa  184  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.698524  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2217  integrase family protein  30.5 
 
 		 418 aa  182  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.664863  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  30.48 
 
 		 403 aa  182  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  29.61 
 
 		 421 aa  181  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1623  integrase or site-specific recombinase  30.56 
 
 		 466 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  30.23 
 
 		 402 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  31.41 
 
 		 445 aa  179  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  29.82 
 
 		 414 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  29.76 
 
 		 429 aa  175  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  29.56 
 
 		 394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0628  phage integrase  32.31 
 
 		 405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.173679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0927  integrase family protein  30.71 
 
 		 422 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  28.36 
 
 		 406 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  29.32 
 
 		 390 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0484  phage integrase family protein  30.36 
 
 		 421 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0444  integrase family protein  28.74 
 
 		 461 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  29.02 
 
 		 420 aa  171  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  31.63 
 
 		 393 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  29.27 
 
 		 402 aa  170  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  30.12 
 
 		 401 aa  170  5e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  29.77 
 
 		 428 aa  166  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  30.81 
 
 		 395 aa  166  5e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  31.41 
 
 		 404 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  29.56 
 
 		 409 aa  166  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5324  integrase  31.27 
 
 		 395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  28.13 
 
 		 404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  29.18 
 
 		 404 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  28.35 
 
 		 396 aa  163  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  28.79 
 
 		 404 aa  162  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  28.79 
 
 		 404 aa  162  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  29.65 
 
 		 404 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  28.79 
 
 		 404 aa  162  9e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  29.74 
 
 		 411 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  29.06 
 
 		 401 aa  162  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  28.61 
 
 		 394 aa  162  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  29.55 
 
 		 400 aa  161  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  28.35 
 
 		 394 aa  160  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  29.27 
 
 		 419 aa  160  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  28.36 
 
 		 396 aa  160  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4495  integrase family protein  29.22 
 
 		 409 aa  160  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.338332  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3669  prophage CP4-like integrase  31.22 
 
 		 462 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18314  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  30.17 
 
 		 413 aa  159  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1100  site-specific recombinase, phage integrase family  28.86 
 
 		 395 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  32.96 
 
 		 420 aa  159  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  29.47 
 
 		 438 aa  159  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  28.02 
 
 		 402 aa  159  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  30.95 
 
 		 402 aa  159  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  29.92 
 
 		 401 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3223  integrase  29.09 
 
 		 413 aa  158  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1053  integrase family protein  27.76 
 
 		 413 aa  157  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  29.07 
 
 		 403 aa  157  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4347  integrase family protein  30.3 
 
 		 402 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  33.15 
 
 		 419 aa  156  7e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  28.95 
 
 		 394 aa  155  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  29.66 
 
 		 398 aa  155  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0757  integrase family protein  26.68 
 
 		 419 aa  154  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.731198  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  29.52 
 
 		 404 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  30 
 
 		 410 aa  154  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  28.75 
 
 		 404 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  28.75 
 
 		 404 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  29.15 
 
 		 397 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  33.7 
 
 		 425 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>