More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0927 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0927  integrase family protein  100 
 
 
422 aa  864    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2875  phage integrase family protein  89.57 
 
 
422 aa  786    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.698524  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0484  phage integrase family protein  66.9 
 
 
421 aa  599  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  43.38 
 
 
389 aa  310  4e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  39.8 
 
 
401 aa  288  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  39.39 
 
 
409 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  39.16 
 
 
396 aa  283  5.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  38.5 
 
 
410 aa  280  4e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  38.14 
 
 
394 aa  280  4e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  38.07 
 
 
396 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  37.79 
 
 
402 aa  278  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  37.22 
 
 
404 aa  275  8e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  37.22 
 
 
404 aa  275  8e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  38.07 
 
 
394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  37.22 
 
 
404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  38.27 
 
 
404 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  37.56 
 
 
394 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  36.04 
 
 
404 aa  271  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  37.85 
 
 
387 aa  271  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  36.67 
 
 
402 aa  270  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  35.84 
 
 
404 aa  270  4e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  37.02 
 
 
395 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  39.6 
 
 
404 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  39.6 
 
 
404 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  37.47 
 
 
404 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3554  integrase family protein  39.22 
 
 
419 aa  267  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  35.62 
 
 
404 aa  267  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  39.52 
 
 
421 aa  267  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3717  integrase family protein  39.22 
 
 
419 aa  267  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  38.1 
 
 
402 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  38.73 
 
 
414 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  39.6 
 
 
404 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  36.71 
 
 
401 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  36.62 
 
 
394 aa  265  2e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  35.99 
 
 
390 aa  264  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  36.71 
 
 
397 aa  263  3e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  36.9 
 
 
396 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0871  integrase family protein  38.83 
 
 
419 aa  263  4e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  36.87 
 
 
394 aa  263  6e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  36.87 
 
 
394 aa  263  6e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  36.22 
 
 
389 aa  263  6e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  39.54 
 
 
404 aa  263  6e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  37.63 
 
 
396 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  38.85 
 
 
406 aa  259  4e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3676  integrase family protein  38.37 
 
 
421 aa  259  5.0000000000000005e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329272  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  36.71 
 
 
417 aa  259  6e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4836  integrase  38.33 
 
 
421 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.712135 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4347  integrase family protein  39.35 
 
 
402 aa  259  9e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  34.97 
 
 
391 aa  258  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0718  integrase family protein  38.07 
 
 
419 aa  257  3e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  36.17 
 
 
387 aa  256  5e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4051  phage integrase family site specific recombinase  37.62 
 
 
419 aa  255  1.0000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102635  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  37.03 
 
 
391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  38.17 
 
 
405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  38.14 
 
 
367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  39.34 
 
 
406 aa  252  7e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4773  integrase  36.52 
 
 
449 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.368119  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  37.08 
 
 
419 aa  251  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3540  phage integrase family site specific recombinase  36.97 
 
 
411 aa  249  5e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000292707  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  37.79 
 
 
438 aa  249  7e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  37.28 
 
 
404 aa  249  7e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  38.5 
 
 
445 aa  248  1e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5324  integrase  36.75 
 
 
395 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  36.39 
 
 
422 aa  248  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  37.89 
 
 
429 aa  248  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3314  site-specific recombinase, phage integrase family protein  36.12 
 
 
420 aa  247  3e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.426306  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3878  integrase family protein  36.61 
 
 
421 aa  246  6e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  38.18 
 
 
401 aa  246  8e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1514  integrase family protein  35.47 
 
 
423 aa  245  9e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  37.24 
 
 
404 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0747  integrase family protein  36.67 
 
 
420 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0631504 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2072  integrase family protein  36.9 
 
 
407 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.841134  normal  0.685608 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1766  integrase family protein  34.98 
 
 
425 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0264741  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1669  integrase family protein  36.61 
 
 
421 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  34.96 
 
 
418 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0447  integrase family protein  35.7 
 
 
419 aa  243  6e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3541  integrase family protein  35.21 
 
 
418 aa  242  9e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2459  integrase family protein  34.67 
 
 
428 aa  242  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  39.49 
 
 
404 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  38.12 
 
 
407 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1693  integrase family protein  34.16 
 
 
423 aa  241  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  40 
 
 
402 aa  241  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1100  site-specific recombinase, phage integrase family  33.51 
 
 
395 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  36.13 
 
 
428 aa  239  5e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1586  integrase family protein  33.96 
 
 
425 aa  239  6.999999999999999e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.97396  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1727  integrase family protein  34.55 
 
 
425 aa  239  6.999999999999999e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4272  site-specific recombinase, phage integrase family protein  35.87 
 
 
421 aa  238  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.451693  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  35.57 
 
 
420 aa  238  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  38.15 
 
 
413 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  35.44 
 
 
411 aa  238  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  37.88 
 
 
404 aa  235  9e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  36.06 
 
 
410 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  37.22 
 
 
403 aa  233  6e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  36 
 
 
401 aa  233  7.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0979  site-specific recombinase, phage integrase family protein  34.48 
 
 
420 aa  233  7.000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000444866  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3537  integrase family protein  33.74 
 
 
419 aa  232  8.000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0463  phage integrase family protein  35.4 
 
 
420 aa  231  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0356989 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3034  integrase family protein  33.98 
 
 
419 aa  231  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2305  integrase  35.37 
 
 
424 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000673705  hitchhiker  1.06104e-16 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2068  integrase  34.99 
 
 
424 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000306631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>