More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_15350 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  97 
 
 
400 aa  801    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  89.28 
 
 
402 aa  747    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  87.06 
 
 
399 aa  728    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  86.8 
 
 
398 aa  726    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  92.68 
 
 
402 aa  762    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  100 
 
 
400 aa  823    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  87.82 
 
 
395 aa  732    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  89.85 
 
 
395 aa  748    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0496  phage integrase  58.79 
 
 
418 aa  478  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  57.72 
 
 
418 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1262  integrase family protein  58.12 
 
 
418 aa  476  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1172  integrase family protein  56.2 
 
 
418 aa  473  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69238  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3563  integrase family protein  56.2 
 
 
418 aa  473  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2142  phage integrase  58.48 
 
 
418 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306676  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3112  integrase family protein  56.46 
 
 
418 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3484  phage integrase family protein  59.9 
 
 
418 aa  462  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1130  integrase family protein  57.11 
 
 
418 aa  450  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3062  phage integrase  57.22 
 
 
418 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361431  normal  0.0996208 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1709  putative phage integrase  52.4 
 
 
446 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558135  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1465  phage integrase  56.85 
 
 
418 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0137829  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3366  phage integrase family protein  57.84 
 
 
394 aa  442  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6547  integrase family protein  53.37 
 
 
455 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352142  normal  0.0182485 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2336  Phage integrase  52.81 
 
 
426 aa  437  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3232  integrase family protein  52.3 
 
 
434 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.462781 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2217  integrase family protein  55.19 
 
 
418 aa  421  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.664863  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0444  integrase family protein  45.93 
 
 
461 aa  365  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1623  integrase or site-specific recombinase  46.52 
 
 
466 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2106  integrase  54.78 
 
 
272 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  39.69 
 
 
403 aa  264  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  40.31 
 
 
410 aa  260  3e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  37.18 
 
 
440 aa  257  3e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0554  CP4-like integrase  49.26 
 
 
274 aa  252  7e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  36.96 
 
 
410 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  38.07 
 
 
409 aa  240  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  35.11 
 
 
409 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  35.11 
 
 
414 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  35.11 
 
 
409 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  35.61 
 
 
390 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  37.78 
 
 
404 aa  225  8e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  36.82 
 
 
404 aa  224  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  37.62 
 
 
404 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  37.03 
 
 
401 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  35.41 
 
 
394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  35.61 
 
 
396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  35.16 
 
 
394 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  33.75 
 
 
415 aa  216  7e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  33.67 
 
 
417 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  33.92 
 
 
402 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1100  site-specific recombinase, phage integrase family  34.09 
 
 
395 aa  209  7e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  34.33 
 
 
404 aa  208  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  34.65 
 
 
396 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  35.93 
 
 
402 aa  206  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  32.84 
 
 
404 aa  204  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  36.08 
 
 
402 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  33.25 
 
 
396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  33.33 
 
 
389 aa  199  6e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  33.33 
 
 
394 aa  199  6e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  35.92 
 
 
394 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  34.33 
 
 
397 aa  198  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  35.52 
 
 
393 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  32.59 
 
 
409 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  34.24 
 
 
387 aa  195  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  33.83 
 
 
404 aa  193  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  33.08 
 
 
395 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  33.83 
 
 
404 aa  193  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  33.83 
 
 
404 aa  193  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  33.67 
 
 
396 aa  192  8e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  30.46 
 
 
391 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4347  integrase family protein  35.43 
 
 
402 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  32.83 
 
 
410 aa  189  7e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  30.46 
 
 
387 aa  188  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  31.76 
 
 
397 aa  189  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0126025 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  33.25 
 
 
394 aa  187  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  36.16 
 
 
401 aa  187  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  33.25 
 
 
394 aa  187  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  32.2 
 
 
401 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0628  phage integrase  33.5 
 
 
405 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.173679  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  32.49 
 
 
417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  32.41 
 
 
413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  35.91 
 
 
407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5324  integrase  32.32 
 
 
395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3385  site-specific recombinase, phage integrase family  32.58 
 
 
391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059991  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  32.41 
 
 
398 aa  184  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  31.5 
 
 
402 aa  182  7e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3983  integrase family protein  31.98 
 
 
404 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  34.16 
 
 
401 aa  182  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  32.83 
 
 
391 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0463  phage integrase family protein  32.43 
 
 
420 aa  180  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0356989 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  32.41 
 
 
404 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  33.33 
 
 
419 aa  179  4.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  32.35 
 
 
422 aa  179  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4470  putative phage integrase  32.23 
 
 
399 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.052147 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  31.71 
 
 
418 aa  178  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4753  phage integrase family site specific recombinase  33.66 
 
 
421 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3412  integrase family protein  31.16 
 
 
424 aa  175  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0501  integrase family protein  30.68 
 
 
419 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0294  phage integrase  33.42 
 
 
399 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  32.58 
 
 
404 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  32.58 
 
 
404 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0718  integrase family protein  30.41 
 
 
419 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>