More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1046 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  100 
 
 		 410 aa  843    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  71.46 
 
 		 403 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  43.74 
 
 		 440 aa  322  9.999999999999999e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  46.75 
 
 		 410 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  44.1 
 
 		 409 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  44.1 
 
 		 414 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  44.1 
 
 		 409 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  43.59 
 
 		 409 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1262  integrase family protein  40.05 
 
 		 418 aa  266  5.999999999999999e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3112  integrase family protein  40.31 
 
 		 418 aa  263  4e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  40.05 
 
 		 399 aa  263  4e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  39.54 
 
 		 402 aa  261  1e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  41.16 
 
 		 418 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  40.31 
 
 		 400 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  40.91 
 
 		 402 aa  260  4e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1172  integrase family protein  38.78 
 
 		 418 aa  258  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1709  putative phage integrase  36.5 
 
 		 446 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3563  integrase family protein  38.78 
 
 		 418 aa  258  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  40.05 
 
 		 400 aa  258  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6547  integrase family protein  37.23 
 
 		 455 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352142  normal  0.0182485 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3232  integrase family protein  37.59 
 
 		 434 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.462781 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2336  Phage integrase  37.2 
 
 		 426 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  38.52 
 
 		 398 aa  253  4.0000000000000004e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  38.78 
 
 		 395 aa  251  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3484  phage integrase family protein  41.16 
 
 		 418 aa  247  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  39.14 
 
 		 395 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0496  phage integrase  38.83 
 
 		 418 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1130  integrase family protein  41.07 
 
 		 418 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1465  phage integrase  40.82 
 
 		 418 aa  242  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0137829  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3366  phage integrase family protein  39.95 
 
 		 394 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2142  phage integrase  38.01 
 
 		 418 aa  237  3e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3062  phage integrase  40.05 
 
 		 418 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361431  normal  0.0996208 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  33.33 
 
 		 402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3983  integrase family protein  38.01 
 
 		 404 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4470  putative phage integrase  38.78 
 
 		 399 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.052147 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  33.25 
 
 		 394 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4347  integrase family protein  35.64 
 
 		 402 aa  213  7e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  32.24 
 
 		 404 aa  212  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2217  integrase family protein  38.78 
 
 		 418 aa  211  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.664863  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  33.25 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  32.74 
 
 		 404 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  33.16 
 
 		 404 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  32.74 
 
 		 404 aa  207  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  33.93 
 
 		 401 aa  206  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  33.25 
 
 		 396 aa  206  8e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  34.62 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1623  integrase or site-specific recombinase  34.77 
 
 		 466 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  33.25 
 
 		 419 aa  200  5e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  32.59 
 
 		 414 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  32.07 
 
 		 396 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3314  site-specific recombinase, phage integrase family protein  31.76 
 
 		 420 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.426306  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  31.98 
 
 		 402 aa  198  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3878  integrase family protein  32.26 
 
 		 421 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  32.83 
 
 		 409 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0747  integrase family protein  31.38 
 
 		 420 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0631504 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  32.07 
 
 		 394 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  32.07 
 
 		 394 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  32.67 
 
 		 410 aa  196  6e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  32.75 
 
 		 391 aa  196  8.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  30.81 
 
 		 391 aa  196  9e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0444  integrase family protein  33.25 
 
 		 461 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  32.59 
 
 		 397 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  31.74 
 
 		 394 aa  194  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4272  site-specific recombinase, phage integrase family protein  31.76 
 
 		 421 aa  194  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.451693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  31.74 
 
 		 394 aa  194  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  31.23 
 
 		 396 aa  194  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  33.5 
 
 		 406 aa  193  4e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  33.25 
 
 		 404 aa  193  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  32.41 
 
 		 415 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  31.19 
 
 		 418 aa  189  8e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3095  integrase family protein  36.29 
 
 		 392 aa  189  9e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000033184 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  31.9 
 
 		 404 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  30.85 
 
 		 387 aa  188  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  35.82 
 
 		 439 aa  188  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  31.97 
 
 		 393 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2463  phage integrase family protein  31.16 
 
 		 414 aa  188  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384114  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3541  integrase family protein  30.94 
 
 		 418 aa  188  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  31.65 
 
 		 404 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  30.98 
 
 		 417 aa  187  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  31.65 
 
 		 404 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1425  integrase  31.9 
 
 		 413 aa  187  4e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.468676  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  31.63 
 
 		 397 aa  187  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  32.91 
 
 		 404 aa  186  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  33.42 
 
 		 404 aa  186  8e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0809  phage integrase family site specific recombinase  32.01 
 
 		 419 aa  186  9e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1100  site-specific recombinase, phage integrase family  31.46 
 
 		 395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  30.9 
 
 		 402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3412  integrase family protein  29.85 
 
 		 424 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  31.28 
 
 		 420 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  30.36 
 
 		 409 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  32.25 
 
 		 417 aa  184  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  30.71 
 
 		 406 aa  184  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0871  integrase family protein  30.47 
 
 		 419 aa  184  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  33.25 
 
 		 411 aa  183  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0447  integrase family protein  31.44 
 
 		 419 aa  183  6e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0718  integrase family protein  30.54 
 
 		 419 aa  183  6e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  31.54 
 
 		 429 aa  183  6e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  31.33 
 
 		 396 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2704  Phage integrase  33.25 
 
 		 404 aa  182  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143842  hitchhiker  0.00000139825 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5324  integrase  31.22 
 
 		 395 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>