More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1709 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6547  integrase family protein  79.01 
 
 		 455 aa  724    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352142  normal  0.0182485 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2336  Phage integrase  80.54 
 
 		 426 aa  696    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3232  integrase family protein  75.67 
 
 		 434 aa  654    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.462781 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1709  putative phage integrase  100 
 
 		 446 aa  925    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1623  integrase or site-specific recombinase  57.28 
 
 		 466 aa  476  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0444  integrase family protein  53.44 
 
 		 461 aa  476  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  53.66 
 
 		 395 aa  449  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  52.4 
 
 		 400 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  52.54 
 
 		 398 aa  442  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  52.64 
 
 		 400 aa  443  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  53.55 
 
 		 395 aa  444  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  53.27 
 
 		 399 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  52.67 
 
 		 402 aa  434  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3112  integrase family protein  50.85 
 
 		 418 aa  429  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1172  integrase family protein  50.36 
 
 		 418 aa  427  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69238  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  50.84 
 
 		 402 aa  425  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3563  integrase family protein  50.36 
 
 		 418 aa  427  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0496  phage integrase  52.18 
 
 		 418 aa  425  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1262  integrase family protein  52.07 
 
 		 418 aa  421  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2142  phage integrase  52.07 
 
 		 418 aa  419  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  50.97 
 
 		 418 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3062  phage integrase  50.84 
 
 		 418 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361431  normal  0.0996208 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3484  phage integrase family protein  53.04 
 
 		 418 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2217  integrase family protein  50.24 
 
 		 418 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.664863  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1130  integrase family protein  51.34 
 
 		 418 aa  393  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3366  phage integrase family protein  52.71 
 
 		 394 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1465  phage integrase  50.24 
 
 		 418 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0137829  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  35.78 
 
 		 403 aa  257  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  36.5 
 
 		 410 aa  258  2e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2106  integrase  46.18 
 
 		 272 aa  252  8.000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  34.83 
 
 		 440 aa  251  2e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  36.13 
 
 		 410 aa  237  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  34.54 
 
 		 409 aa  237  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  34.54 
 
 		 414 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  35.49 
 
 		 409 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  35.18 
 
 		 409 aa  233  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0554  CP4-like integrase  44.52 
 
 		 274 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  32.23 
 
 		 404 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  32.7 
 
 		 404 aa  213  7e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  32.23 
 
 		 404 aa  212  7.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  32.64 
 
 		 402 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  34.75 
 
 		 394 aa  212  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  33.82 
 
 		 396 aa  211  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  34.83 
 
 		 402 aa  209  6e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  33.33 
 
 		 394 aa  209  7e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  33.5 
 
 		 390 aa  209  8e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  33.82 
 
 		 394 aa  209  9e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  35.15 
 
 		 401 aa  209  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  31.59 
 
 		 402 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  31.31 
 
 		 404 aa  196  8.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  32.93 
 
 		 397 aa  195  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  32.85 
 
 		 404 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  32.85 
 
 		 404 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  32.85 
 
 		 404 aa  194  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  32.7 
 
 		 395 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  33.25 
 
 		 404 aa  192  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  32.05 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  31.05 
 
 		 415 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  33.5 
 
 		 387 aa  189  9e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  32.37 
 
 		 389 aa  188  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  31.34 
 
 		 417 aa  187  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  32.05 
 
 		 394 aa  187  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  32.05 
 
 		 394 aa  187  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4347  integrase family protein  33.1 
 
 		 402 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  31.89 
 
 		 396 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  31.4 
 
 		 409 aa  186  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  31.64 
 
 		 396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5324  integrase  31.97 
 
 		 395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  32.52 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  32.13 
 
 		 417 aa  184  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1100  site-specific recombinase, phage integrase family  30.4 
 
 		 395 aa  183  6e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  30.99 
 
 		 393 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0628  phage integrase  33.57 
 
 		 405 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.173679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4470  putative phage integrase  30.92 
 
 		 399 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.052147 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  30.75 
 
 		 410 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  31.14 
 
 		 396 aa  179  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  30.49 
 
 		 387 aa  179  9e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  30.17 
 
 		 402 aa  177  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  30.1 
 
 		 391 aa  177  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  32.98 
 
 		 367 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2005  cp4-like integrase protein  33.33 
 
 		 425 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  29.37 
 
 		 394 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  29.67 
 
 		 401 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3983  integrase family protein  29.83 
 
 		 404 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  30.43 
 
 		 397 aa  170  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  31.01 
 
 		 398 aa  171  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  29.22 
 
 		 414 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  31.08 
 
 		 401 aa  170  6e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  30.31 
 
 		 419 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  31 
 
 		 429 aa  166  5.9999999999999996e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  30.4 
 
 		 400 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  29.72 
 
 		 421 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  28.86 
 
 		 414 aa  162  9e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4051  phage integrase family site specific recombinase  30.02 
 
 		 419 aa  162  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  31.25 
 
 		 401 aa  160  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  28.74 
 
 		 403 aa  160  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0484  phage integrase family protein  28.47 
 
 		 421 aa  160  6e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3676  integrase family protein  30.39 
 
 		 421 aa  159  8e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329272  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0747  integrase family protein  31.09 
 
 		 420 aa  158  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0631504 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3878  integrase family protein  31.11 
 
 		 421 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>