More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2823 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  100 
 
 		 440 aa  900    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  48.39 
 
 		 414 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  48.16 
 
 		 409 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  48.16 
 
 		 409 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  48.97 
 
 		 410 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  46.53 
 
 		 409 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  43.32 
 
 		 403 aa  341  2e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  43.97 
 
 		 410 aa  326  4.0000000000000003e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4470  putative phage integrase  40.9 
 
 		 399 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.052147 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3983  integrase family protein  41.23 
 
 		 404 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  39.39 
 
 		 399 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  39.76 
 
 		 402 aa  271  1e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  39.53 
 
 		 400 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  39.29 
 
 		 400 aa  265  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6547  integrase family protein  37 
 
 		 455 aa  263  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352142  normal  0.0182485 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  38.66 
 
 		 402 aa  263  4e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  35.78 
 
 		 404 aa  262  6.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  38.12 
 
 		 398 aa  262  8.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  37.82 
 
 		 418 aa  257  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  37.41 
 
 		 395 aa  255  8e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1709  putative phage integrase  36.21 
 
 		 446 aa  255  9e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  37.65 
 
 		 395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1262  integrase family protein  36.78 
 
 		 418 aa  254  3e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2336  Phage integrase  35.32 
 
 		 426 aa  251  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  35.24 
 
 		 404 aa  250  3e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  35 
 
 		 396 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  35.01 
 
 		 404 aa  249  6e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3095  integrase family protein  38.23 
 
 		 392 aa  249  6e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000033184 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  35.01 
 
 		 404 aa  249  6e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  34.32 
 
 		 404 aa  248  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  34.76 
 
 		 394 aa  247  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  34.76 
 
 		 394 aa  247  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  34.8 
 
 		 395 aa  245  9e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  33.96 
 
 		 404 aa  245  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  33.33 
 
 		 404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  34.76 
 
 		 402 aa  244  3e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3484  phage integrase family protein  37.24 
 
 		 418 aa  243  7e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0496  phage integrase  35.55 
 
 		 418 aa  242  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3366  phage integrase family protein  36.89 
 
 		 394 aa  241  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1172  integrase family protein  34.51 
 
 		 418 aa  240  2.9999999999999997e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3563  integrase family protein  34.51 
 
 		 418 aa  240  2.9999999999999997e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  35 
 
 		 396 aa  240  4e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  35.08 
 
 		 396 aa  239  5.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3232  integrase family protein  35.81 
 
 		 434 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.462781 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1465  phage integrase  35.68 
 
 		 418 aa  239  6.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0137829  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2142  phage integrase  35.43 
 
 		 418 aa  238  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3112  integrase family protein  35.45 
 
 		 418 aa  237  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  34.61 
 
 		 394 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  34.61 
 
 		 394 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  34.53 
 
 		 394 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  34.52 
 
 		 396 aa  236  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  34.84 
 
 		 417 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  33.41 
 
 		 394 aa  233  6e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3062  phage integrase  34.91 
 
 		 418 aa  232  9e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361431  normal  0.0996208 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  33.89 
 
 		 402 aa  230  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1130  integrase family protein  36.09 
 
 		 418 aa  229  6e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  33.33 
 
 		 402 aa  229  7e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  34.04 
 
 		 406 aa  228  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0628  phage integrase  35.6 
 
 		 405 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.173679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  34.77 
 
 		 397 aa  226  8e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  35 
 
 		 389 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  33.65 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  33.33 
 
 		 397 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  32.31 
 
 		 410 aa  220  5e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  32.94 
 
 		 401 aa  219  7.999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  33.18 
 
 		 404 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1557  integrase family protein  32.87 
 
 		 403 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  32.61 
 
 		 389 aa  216  5e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  32.94 
 
 		 391 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  35.24 
 
 		 400 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  34.12 
 
 		 409 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  31.75 
 
 		 391 aa  216  7e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  34.28 
 
 		 367 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  32.29 
 
 		 387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  32.46 
 
 		 411 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  33.1 
 
 		 419 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  33.81 
 
 		 445 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  32.17 
 
 		 414 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  33.8 
 
 		 429 aa  212  7.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3878  integrase family protein  30.36 
 
 		 421 aa  211  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4051  phage integrase family site specific recombinase  30.8 
 
 		 419 aa  210  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0463  phage integrase family protein  30.6 
 
 		 420 aa  209  8e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0356989 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3314  site-specific recombinase, phage integrase family protein  30.36 
 
 		 420 aa  209  8e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.426306  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0747  integrase family protein  30.36 
 
 		 420 aa  209  9e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0631504 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  31.35 
 
 		 403 aa  209  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  32.94 
 
 		 398 aa  209  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  31.23 
 
 		 402 aa  209  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  32.71 
 
 		 393 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3676  integrase family protein  31.04 
 
 		 421 aa  207  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329272  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  32.65 
 
 		 404 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4347  integrase family protein  32.94 
 
 		 402 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1766  integrase family protein  33.33 
 
 		 425 aa  207  4e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0264741  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  32.64 
 
 		 428 aa  206  5e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0757  integrase family protein  30.47 
 
 		 419 aa  206  5e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.731198  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  30.23 
 
 		 418 aa  206  6e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  32.15 
 
 		 404 aa  206  8e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  31.67 
 
 		 401 aa  206  9e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4272  site-specific recombinase, phage integrase family protein  29.91 
 
 		 421 aa  205  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.451693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  32.03 
 
 		 420 aa  205  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2217  integrase family protein  33.17 
 
 		 418 aa  205  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.664863  normal  0.427624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>