More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1371 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1371  phage integrase family protein  100 
 
 		 453 aa  930    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  38.19 
 
 		 439 aa  318  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  39.04 
 
 		 449 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  39.82 
 
 		 433 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  36.85 
 
 		 437 aa  280  5e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  36.38 
 
 		 439 aa  266  4e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  35.14 
 
 		 427 aa  260  3e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2279  Phage integrase  32.82 
 
 		 414 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0066545  normal  0.0551798 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2119  integrative genetic element Gsu56, integrase  29.89 
 
 		 453 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2416  integrase family protein  32.77 
 
 		 443 aa  194  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0813  integrase family protein  31.54 
 
 		 427 aa  189  7e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000471518 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  30.93 
 
 		 413 aa  169  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  29.2 
 
 		 406 aa  162  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  28.17 
 
 		 413 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  28.67 
 
 		 414 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  28.51 
 
 		 414 aa  149  8e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  31.48 
 
 		 361 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  27.57 
 
 		 410 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  26.36 
 
 		 413 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  25.8 
 
 		 415 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  28 
 
 		 413 aa  134  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  28.48 
 
 		 420 aa  129  9.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3112  integrase family protein  26.2 
 
 		 418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  26.01 
 
 		 409 aa  127  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  26.46 
 
 		 414 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  27.23 
 
 		 399 aa  126  6e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  26.46 
 
 		 409 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  24.94 
 
 		 408 aa  126  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  23.82 
 
 		 403 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  26.46 
 
 		 409 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  23.93 
 
 		 410 aa  124  4e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  26 
 
 		 400 aa  123  6e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3683  phage integrase family protein  26.24 
 
 		 444 aa  123  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  26.55 
 
 		 397 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  26.55 
 
 		 439 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  25.35 
 
 		 402 aa  121  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  26 
 
 		 400 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  26.5 
 
 		 426 aa  120  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  24.78 
 
 		 401 aa  119  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1053  integrase family protein  25.32 
 
 		 413 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  25.11 
 
 		 395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  25.17 
 
 		 398 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  24.94 
 
 		 395 aa  117  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  24.43 
 
 		 417 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  23.65 
 
 		 440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  24.94 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  27.33 
 
 		 432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  25.27 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  23.23 
 
 		 418 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3563  integrase family protein  23.4 
 
 		 418 aa  111  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  25.33 
 
 		 402 aa  111  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1172  integrase family protein  23.4 
 
 		 418 aa  111  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  26.95 
 
 		 389 aa  111  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1262  integrase family protein  24.05 
 
 		 418 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  24.56 
 
 		 419 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  23.44 
 
 		 402 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  26.55 
 
 		 422 aa  109  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  26.57 
 
 		 422 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  24.94 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  26.23 
 
 		 403 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  23.84 
 
 		 414 aa  107  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  25.06 
 
 		 390 aa  107  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  23.79 
 
 		 420 aa  106  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  25.7 
 
 		 419 aa  106  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  26.11 
 
 		 400 aa  106  8e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  24.1 
 
 		 404 aa  106  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  24.89 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  26.37 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  25.53 
 
 		 415 aa  105  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  26.07 
 
 		 418 aa  105  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3540  phage integrase family protein  23.16 
 
 		 420 aa  104  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.216413  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  23.52 
 
 		 412 aa  104  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1709  putative phage integrase  23.93 
 
 		 446 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2072  integrase family protein  25.11 
 
 		 407 aa  103  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.841134  normal  0.685608 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0063  DNA integration/recombination/inversion protein  24.89 
 
 		 396 aa  103  7e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  25.38 
 
 		 404 aa  103  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2184  Phage integrase  25.05 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.264722  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3062  phage integrase  25.43 
 
 		 418 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361431  normal  0.0996208 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0496  phage integrase  23.67 
 
 		 418 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  25.05 
 
 		 405 aa  102  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  27.11 
 
 		 406 aa  102  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2675  hypothetical protein  24.95 
 
 		 443 aa  102  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2142  phage integrase  24.02 
 
 		 418 aa  102  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  23.46 
 
 		 418 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  24.68 
 
 		 445 aa  101  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  24.42 
 
 		 418 aa  101  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  24.95 
 
 		 410 aa  101  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  23.74 
 
 		 394 aa  101  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  23.75 
 
 		 404 aa  101  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  25.17 
 
 		 416 aa  101  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  25.51 
 
 		 393 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  24.22 
 
 		 400 aa  100  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  27.55 
 
 		 405 aa  100  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3223  integrase  24.24 
 
 		 413 aa  100  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  24.49 
 
 		 402 aa  100  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2900  phage integrase  26.18 
 
 		 391 aa  100  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211341  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  24.62 
 
 		 391 aa  100  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3013  phage integrase family site specific recombinase  25.34 
 
 		 419 aa  99.8  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  24.95 
 
 		 411 aa  99.4  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  25.47 
 
 		 425 aa  99.4  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>