More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0393 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  100 
 
 		 403 aa  836    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  68.56 
 
 		 405 aa  577  1.0000000000000001e-163  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  62.38 
 
 		 404 aa  521  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04051  site-specific recombinase, phage integrase family protein  58.55 
 
 		 415 aa  471  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  54.06 
 
 		 404 aa  437  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  53.02 
 
 		 432 aa  424  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0550  phage integrase family protein  43.51 
 
 		 413 aa  313  1.9999999999999998e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0350  phage integrase family protein  41.97 
 
 		 427 aa  311  1e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.73479 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  40.29 
 
 		 420 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  42 
 
 		 439 aa  276  4e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4258  phage integrase family site specific recombinase  51.43 
 
 		 293 aa  275  9e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  41.67 
 
 		 422 aa  272  8.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  40.96 
 
 		 422 aa  269  5.9999999999999995e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4160  phage integrase family protein  40.05 
 
 		 419 aa  265  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0690268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  40.19 
 
 		 425 aa  261  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  39.38 
 
 		 419 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  41.46 
 
 		 418 aa  255  9e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  40.38 
 
 		 420 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0318  hypothetical protein  36.76 
 
 		 515 aa  236  6e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4275.1  prophage Sf6-like integrase  80.53 
 
 		 144 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  31.95 
 
 		 414 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  31.69 
 
 		 409 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  31.95 
 
 		 409 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  31.85 
 
 		 403 aa  160  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  31.12 
 
 		 409 aa  160  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  28.03 
 
 		 414 aa  155  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  29.09 
 
 		 413 aa  153  5e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  27.53 
 
 		 414 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  29.46 
 
 		 410 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  30.54 
 
 		 440 aa  150  6e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5642  Phage integrase  29.68 
 
 		 403 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  30.23 
 
 		 402 aa  147  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  29.58 
 
 		 394 aa  147  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2668  phage integrase family site specific recombinase  30.12 
 
 		 411 aa  147  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  31.38 
 
 		 410 aa  146  8.000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  27.34 
 
 		 449 aa  143  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  28.92 
 
 		 400 aa  140  6e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  30.32 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  28.03 
 
 		 414 aa  137  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2336  Phage integrase  28.61 
 
 		 426 aa  136  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  28.79 
 
 		 399 aa  137  5e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  28.57 
 
 		 413 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  26.84 
 
 		 406 aa  136  7.000000000000001e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  30.34 
 
 		 413 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  29.33 
 
 		 402 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  29.87 
 
 		 395 aa  134  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  27.66 
 
 		 396 aa  133  6.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  28.91 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1967  integrase family protein  28.86 
 
 		 429 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.0364461 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  28.87 
 
 		 397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  28.36 
 
 		 433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  29.18 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2142  phage integrase  29.31 
 
 		 418 aa  131  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1262  integrase family protein  29.38 
 
 		 418 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  28.54 
 
 		 412 aa  130  6e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  26.75 
 
 		 404 aa  129  6e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1709  putative phage integrase  30.14 
 
 		 446 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  28.53 
 
 		 398 aa  129  9.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  27.79 
 
 		 402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  27.12 
 
 		 395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3983  integrase family protein  29.2 
 
 		 404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  28.09 
 
 		 414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  29.12 
 
 		 398 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  29.2 
 
 		 367 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  28.27 
 
 		 395 aa  126  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  27.23 
 
 		 413 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6547  integrase family protein  29.47 
 
 		 455 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352142  normal  0.0182485 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  26.5 
 
 		 389 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  27.96 
 
 		 396 aa  125  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4470  putative phage integrase  29.76 
 
 		 399 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.052147 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  25.76 
 
 		 389 aa  124  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2845  phage integrase family protein  27.02 
 
 		 409 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  0.121401 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3112  integrase family protein  28.9 
 
 		 418 aa  124  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3232  integrase family protein  28.1 
 
 		 434 aa  123  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.462781 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3062  phage integrase  28.57 
 
 		 418 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361431  normal  0.0996208 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  27.14 
 
 		 404 aa  122  8e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3095  integrase family protein  29.97 
 
 		 392 aa  122  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000033184 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3366  phage integrase family protein  29.95 
 
 		 394 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  27.62 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  28.53 
 
 		 418 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  27.47 
 
 		 410 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  26.89 
 
 		 404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  26.89 
 
 		 404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1370  prophage CP4-57 integrase  28.92 
 
 		 399 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000288538  normal  0.0147519 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  26.45 
 
 		 401 aa  121  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  28.71 
 
 		 411 aa  120  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3563  integrase family protein  29.2 
 
 		 418 aa  121  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3540  phage integrase family protein  25.94 
 
 		 420 aa  121  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.216413  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1172  integrase family protein  29.2 
 
 		 418 aa  121  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  26.58 
 
 		 404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  27.62 
 
 		 404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3273  phage integrase family protein  29.02 
 
 		 401 aa  120  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0956673  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  26.8 
 
 		 397 aa  119  7e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  25.25 
 
 		 387 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  26.93 
 
 		 408 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  25.06 
 
 		 394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  27.9 
 
 		 402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  25.06 
 
 		 394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2217  integrase family protein  27.99 
 
 		 418 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.664863  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  26.07 
 
 		 402 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>