More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1859 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  100 
 
 		 427 aa  886    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  43.85 
 
 		 439 aa  383  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  43.84 
 
 		 449 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  40.42 
 
 		 433 aa  310  4e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  39 
 
 		 439 aa  301  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  40.42 
 
 		 437 aa  299  6e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1371  phage integrase family protein  35.14 
 
 		 453 aa  260  3e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2119  integrative genetic element Gsu56, integrase  34.85 
 
 		 453 aa  226  6e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2279  Phage integrase  35.27 
 
 		 414 aa  226  6e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0066545  normal  0.0551798 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2416  integrase family protein  34.19 
 
 		 443 aa  223  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0813  integrase family protein  32.42 
 
 		 427 aa  207  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000471518 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  32.91 
 
 		 413 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  35.28 
 
 		 361 aa  187  4e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3683  phage integrase family protein  32.87 
 
 		 444 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  31.87 
 
 		 413 aa  176  7e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  31.69 
 
 		 406 aa  175  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  29.31 
 
 		 414 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  31.33 
 
 		 414 aa  169  7e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  31.33 
 
 		 414 aa  169  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  29.52 
 
 		 400 aa  168  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  30.26 
 
 		 413 aa  166  9e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  29.64 
 
 		 413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  28.81 
 
 		 426 aa  162  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  28.09 
 
 		 410 aa  150  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  27.98 
 
 		 403 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  27.93 
 
 		 410 aa  139  8.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  26.7 
 
 		 417 aa  139  8.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  28.43 
 
 		 395 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  28.3 
 
 		 412 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  27.83 
 
 		 395 aa  139  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  26.88 
 
 		 409 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  27.05 
 
 		 409 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  27.05 
 
 		 414 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  27.01 
 
 		 400 aa  137  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  27.59 
 
 		 398 aa  136  6.0000000000000005e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  27.34 
 
 		 400 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  27.05 
 
 		 409 aa  136  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  29.18 
 
 		 420 aa  136  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  27.83 
 
 		 399 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4935  putative phage-like integrase  27.49 
 
 		 434 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  26.91 
 
 		 440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  28.19 
 
 		 402 aa  134  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2526  Phage integrase  27.05 
 
 		 481 aa  133  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000237436  normal  0.0434699 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  28.44 
 
 		 432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3306  Phage integrase  28.09 
 
 		 450 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889733  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2900  phage integrase  27.92 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3867  phage integrase  27.79 
 
 		 400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  26.43 
 
 		 404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  27.52 
 
 		 402 aa  127  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  27.59 
 
 		 439 aa  125  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  28.6 
 
 		 418 aa  125  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  25.7 
 
 		 396 aa  124  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  26.84 
 
 		 422 aa  124  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  29.38 
 
 		 391 aa  124  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  27.12 
 
 		 422 aa  123  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  27.05 
 
 		 425 aa  122  9e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  27.53 
 
 		 419 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  31.85 
 
 		 387 aa  121  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2217  integrase family protein  27.81 
 
 		 418 aa  121  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.664863  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  29.9 
 
 		 404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  27.05 
 
 		 404 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  24.94 
 
 		 415 aa  119  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  28.17 
 
 		 420 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  25.42 
 
 		 402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  27.88 
 
 		 412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  27.74 
 
 		 389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  27.86 
 
 		 400 aa  117  5e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  24.66 
 
 		 417 aa  117  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2142  phage integrase  26.57 
 
 		 418 aa  116  7.999999999999999e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  27.8 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1172  integrase family protein  25.06 
 
 		 418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3563  integrase family protein  25.06 
 
 		 418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2767  phage integrase family protein  27.38 
 
 		 421 aa  114  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  26.73 
 
 		 402 aa  113  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  25.06 
 
 		 418 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  24.71 
 
 		 402 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  26.62 
 
 		 406 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1465  phage integrase  27.16 
 
 		 418 aa  112  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0137829  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2650  integrase family protein  25.81 
 
 		 410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0205154  hitchhiker  0.00000395125 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  27 
 
 		 419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4160  phage integrase family protein  26.41 
 
 		 419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0690268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  29.43 
 
 		 397 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  32.37 
 
 		 402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  26.65 
 
 		 405 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1262  integrase family protein  25.18 
 
 		 418 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  32.37 
 
 		 394 aa  110  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  28.11 
 
 		 387 aa  110  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6547  integrase family protein  27 
 
 		 455 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352142  normal  0.0182485 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  27.48 
 
 		 403 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  25.18 
 
 		 411 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0496  phage integrase  25.78 
 
 		 418 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3366  phage integrase family protein  25.19 
 
 		 394 aa  109  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  26.2 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  24.38 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2015  phage integrase family site specific recombinase  22.4 
 
 		 390 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  28.84 
 
 		 404 aa  108  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  26.15 
 
 		 421 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  27.47 
 
 		 404 aa  107  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  26.44 
 
 		 394 aa  107  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  26.92 
 
 		 406 aa  107  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>