More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0395 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  100 
 
 
396 aa  816    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0292  phage integrase family protein  34.02 
 
 
440 aa  193  5e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  30.53 
 
 
406 aa  173  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  28.32 
 
 
414 aa  163  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  28.57 
 
 
414 aa  164  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  30.81 
 
 
413 aa  157  3e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  28.35 
 
 
413 aa  146  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  26.4 
 
 
414 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  26.4 
 
 
409 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  28.21 
 
 
402 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  26.14 
 
 
409 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  28.35 
 
 
405 aa  139  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  27.87 
 
 
432 aa  138  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  29.4 
 
 
439 aa  139  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  27.32 
 
 
421 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  25.95 
 
 
394 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1675  Phage integrase  29.35 
 
 
419 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  28.28 
 
 
414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  26.67 
 
 
401 aa  135  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2463  phage integrase family protein  28.68 
 
 
414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384114  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2845  phage integrase family protein  27.99 
 
 
409 aa  133  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  0.121401 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  28.04 
 
 
437 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  25.6 
 
 
440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  27.78 
 
 
404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2892  phage integrase family protein  27.71 
 
 
423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  26.22 
 
 
404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  26.61 
 
 
402 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  25.63 
 
 
409 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  27.78 
 
 
404 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  27.81 
 
 
402 aa  130  6e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02509  Fels-2 prophage protein  27.75 
 
 
409 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2905  phage integrase family protein  27.75 
 
 
436 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02473  hypothetical protein  27.75 
 
 
409 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.36664  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  26.88 
 
 
394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  26.88 
 
 
394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  25.74 
 
 
410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  27.18 
 
 
397 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3112  integrase family protein  27.99 
 
 
412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.053252  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  29.06 
 
 
449 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  26.89 
 
 
439 aa  127  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  27.74 
 
 
402 aa  126  6e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  26.21 
 
 
402 aa  126  8.000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  26.22 
 
 
402 aa  126  9e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  27.34 
 
 
419 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0662  phage integrase family protein  26.08 
 
 
417 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421315  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1557  integrase family protein  25.96 
 
 
403 aa  125  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  25 
 
 
409 aa  125  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  26.92 
 
 
393 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  28.04 
 
 
420 aa  124  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  26.3 
 
 
422 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  25.96 
 
 
400 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  25.84 
 
 
406 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  25.31 
 
 
398 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  27.96 
 
 
403 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  25.7 
 
 
427 aa  124  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  26.09 
 
 
415 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  27.07 
 
 
410 aa  123  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  26.46 
 
 
413 aa  123  6e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  27.92 
 
 
414 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  27.04 
 
 
395 aa  123  7e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  25.71 
 
 
400 aa  122  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1053  integrase family protein  27.54 
 
 
413 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  25.92 
 
 
417 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2015  phage integrase family site specific recombinase  27.09 
 
 
390 aa  122  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  26.45 
 
 
418 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  26.92 
 
 
389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  26.53 
 
 
406 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  27.09 
 
 
413 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  25.53 
 
 
433 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  26.63 
 
 
417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2942  phage integrase family protein  27.78 
 
 
392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000983731 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  26.93 
 
 
410 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4147  integrase family protein  26.65 
 
 
447 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.737436 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  25.56 
 
 
397 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1967  integrase family protein  25.56 
 
 
429 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.0364461 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  25.96 
 
 
395 aa  120  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3410  integrase family protein  28.68 
 
 
401 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134022  hitchhiker  0.000868318 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  25.57 
 
 
410 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  27.39 
 
 
415 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3273  phage integrase family protein  28.42 
 
 
401 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0956673  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  25.71 
 
 
398 aa  119  7e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.92 
 
 
402 aa  119  9e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  24.94 
 
 
403 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  26.26 
 
 
416 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  26.79 
 
 
409 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2142  phage integrase  26.1 
 
 
418 aa  117  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306676  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2279  Phage integrase  26.25 
 
 
414 aa  117  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0066545  normal  0.0551798 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0628  phage integrase  25.57 
 
 
405 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.173679  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  26.33 
 
 
416 aa  117  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1623  integrase or site-specific recombinase  26.24 
 
 
466 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  25.76 
 
 
411 aa  116  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0444  integrase family protein  26.42 
 
 
461 aa  117  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  24.68 
 
 
399 aa  116  6e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  25.81 
 
 
395 aa  116  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  29.35 
 
 
394 aa  116  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3579  integrase  28.8 
 
 
389 aa  116  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000745226 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  25.69 
 
 
403 aa  116  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  26.28 
 
 
396 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  25.96 
 
 
400 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  26.9 
 
 
410 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.644103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>