More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001829 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_001829  integrase  100 
 
 
405 aa  844    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  68.56 
 
 
403 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  62.41 
 
 
404 aa  504  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  54.27 
 
 
404 aa  436  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04051  site-specific recombinase, phage integrase family protein  55.78 
 
 
415 aa  434  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  49.75 
 
 
432 aa  404  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0550  phage integrase family protein  41.45 
 
 
413 aa  300  3e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  40.68 
 
 
420 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  41.52 
 
 
422 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0350  phage integrase family protein  40.24 
 
 
427 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.73479 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  41.12 
 
 
439 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  42.13 
 
 
420 aa  287  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  40.39 
 
 
422 aa  279  6e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  39.66 
 
 
419 aa  276  3e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  39.23 
 
 
425 aa  266  7e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4160  phage integrase family protein  40.97 
 
 
419 aa  265  8.999999999999999e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0690268  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  40.82 
 
 
418 aa  263  6e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4258  phage integrase family site specific recombinase  46.23 
 
 
293 aa  258  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0318  hypothetical protein  36.23 
 
 
515 aa  248  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  32.74 
 
 
409 aa  179  9e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  32.12 
 
 
409 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  32.12 
 
 
414 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  32.37 
 
 
403 aa  177  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  32.12 
 
 
409 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  32.23 
 
 
410 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  32.1 
 
 
406 aa  169  7e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  32.02 
 
 
410 aa  166  8e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  31 
 
 
413 aa  163  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  30.77 
 
 
440 aa  162  9e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  28.78 
 
 
414 aa  157  4e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2668  phage integrase family site specific recombinase  30.02 
 
 
411 aa  156  5.0000000000000005e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  30 
 
 
414 aa  156  7e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1709  putative phage integrase  31.89 
 
 
446 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558135  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  30.18 
 
 
402 aa  153  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  29.92 
 
 
394 aa  152  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2336  Phage integrase  29.63 
 
 
426 aa  149  9e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  29.72 
 
 
414 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5642  Phage integrase  30.51 
 
 
403 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000734  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  29.35 
 
 
398 aa  146  6e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  29.69 
 
 
397 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1967  integrase family protein  28.92 
 
 
429 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.0364461 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  30.05 
 
 
395 aa  145  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  30 
 
 
413 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  29.04 
 
 
402 aa  143  6e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  28.5 
 
 
402 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  28.68 
 
 
400 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  28.68 
 
 
400 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6547  integrase family protein  30.24 
 
 
455 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352142  normal  0.0182485 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4470  putative phage integrase  30.85 
 
 
399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.052147 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  28.75 
 
 
398 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  28.75 
 
 
414 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2142  phage integrase  30.36 
 
 
418 aa  140  6e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306676  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  28.93 
 
 
399 aa  139  6e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  28.12 
 
 
395 aa  139  6e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  28.35 
 
 
396 aa  139  6e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  28.61 
 
 
395 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2217  integrase family protein  30.57 
 
 
418 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.664863  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  30.07 
 
 
433 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1262  integrase family protein  30.03 
 
 
418 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  28.06 
 
 
404 aa  136  7.000000000000001e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3983  integrase family protein  29.97 
 
 
404 aa  135  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  28.06 
 
 
404 aa  135  9e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  28.75 
 
 
404 aa  135  9e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  28.79 
 
 
404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3232  integrase family protein  28.46 
 
 
434 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.462781 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  27.97 
 
 
413 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3062  phage integrase  30.26 
 
 
418 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361431  normal  0.0996208 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  29.16 
 
 
402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  26.67 
 
 
402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  27.16 
 
 
404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  26.72 
 
 
389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3112  integrase family protein  29.4 
 
 
418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  27.16 
 
 
412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  28.61 
 
 
418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  26.56 
 
 
413 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  26.96 
 
 
396 aa  130  6e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3366  phage integrase family protein  30.08 
 
 
394 aa  129  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  28.5 
 
 
396 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  26.08 
 
 
449 aa  129  9.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1370  prophage CP4-57 integrase  27.82 
 
 
399 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000288538  normal  0.0147519 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4275.1  prophage Sf6-like integrase  56.03 
 
 
144 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1172  integrase family protein  27.58 
 
 
418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69238  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  27.82 
 
 
401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1571  site-specific recombinase, phage integrase family  26.29 
 
 
409 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0359454  decreased coverage  0.000000698249 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3563  integrase family protein  27.58 
 
 
418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2845  phage integrase family protein  26.74 
 
 
409 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  0.121401 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0234  phage integrase family protein  29.04 
 
 
416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  28.53 
 
 
411 aa  127  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  29.46 
 
 
412 aa  127  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  30.1 
 
 
415 aa  126  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3754  integrase family protein  24.88 
 
 
407 aa  126  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.290204  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0496  phage integrase  29.66 
 
 
418 aa  125  9e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  27.27 
 
 
410 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  27.01 
 
 
387 aa  125  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  28.57 
 
 
422 aa  125  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1465  phage integrase  29.08 
 
 
418 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0137829  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  27.85 
 
 
367 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3095  integrase family protein  30.36 
 
 
392 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000033184 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  27.13 
 
 
408 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  27.61 
 
 
389 aa  124  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>