More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1088 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  848    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  98.55 
 
 		 414 aa  838    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  60.51 
 
 		 413 aa  509  1e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  60.21 
 
 		 406 aa  478  1e-133  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  32.84 
 
 		 420 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  30.17 
 
 		 420 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  28.67 
 
 		 439 aa  187  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  28.64 
 
 		 425 aa  187  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  29.16 
 
 		 419 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  29.16 
 
 		 422 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  29.68 
 
 		 422 aa  181  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2015  phage integrase family site specific recombinase  31.19 
 
 		 390 aa  175  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  30.89 
 
 		 403 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  31.16 
 
 		 404 aa  174  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  30.98 
 
 		 418 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  30.22 
 
 		 432 aa  172  9e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  32.07 
 
 		 399 aa  171  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  30.88 
 
 		 437 aa  170  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  31.33 
 
 		 427 aa  170  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  31.51 
 
 		 410 aa  169  9e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1571  site-specific recombinase, phage integrase family  27.61 
 
 		 409 aa  168  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0359454  decreased coverage  0.000000698249 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  31.57 
 
 		 400 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  31.82 
 
 		 400 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  30.23 
 
 		 433 aa  167  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  28.83 
 
 		 439 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2668  phage integrase family site specific recombinase  27.43 
 
 		 411 aa  166  9e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  28.32 
 
 		 396 aa  164  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  27.49 
 
 		 410 aa  164  4.0000000000000004e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  30.81 
 
 		 395 aa  162  9e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  27.29 
 
 		 449 aa  161  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  30.08 
 
 		 395 aa  160  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  30.15 
 
 		 409 aa  160  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  30.83 
 
 		 402 aa  158  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  30.81 
 
 		 402 aa  158  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  31.42 
 
 		 394 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  29.43 
 
 		 406 aa  157  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  31.42 
 
 		 394 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  32.07 
 
 		 387 aa  157  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3273  phage integrase family protein  29.41 
 
 		 401 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0956673  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  30 
 
 		 405 aa  155  8e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  29.5 
 
 		 398 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  30.85 
 
 		 410 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0939  phage integrase family site specific recombinase  25.69 
 
 		 406 aa  154  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.456123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2650  integrase family protein  28.09 
 
 		 410 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0205154  hitchhiker  0.00000395125 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2942  phage integrase family protein  27.53 
 
 		 392 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000983731 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3410  integrase family protein  29.17 
 
 		 401 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134022  hitchhiker  0.000868318 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  28.16 
 
 		 439 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  29.18 
 
 		 403 aa  153  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1262  integrase family protein  29.72 
 
 		 418 aa  153  5e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3579  integrase  28.61 
 
 		 389 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000745226 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  27.75 
 
 		 404 aa  152  8e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  27.53 
 
 		 403 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  29.55 
 
 		 440 aa  151  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1371  phage integrase family protein  28.35 
 
 		 453 aa  151  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  28.72 
 
 		 406 aa  151  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  30.53 
 
 		 404 aa  150  5e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  29.26 
 
 		 396 aa  150  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2845  phage integrase family protein  27.34 
 
 		 409 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  0.121401 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  28.75 
 
 		 402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  29.68 
 
 		 417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  29.06 
 
 		 396 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  28.43 
 
 		 414 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  30.28 
 
 		 404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  28.43 
 
 		 409 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  28.43 
 
 		 409 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  30.28 
 
 		 404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  28.68 
 
 		 418 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  30.32 
 
 		 361 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  27.27 
 
 		 404 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3754  integrase family protein  26.46 
 
 		 407 aa  147  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.290204  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  27.1 
 
 		 413 aa  147  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  28.39 
 
 		 395 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  26.78 
 
 		 413 aa  146  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  27.8 
 
 		 404 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2279  Phage integrase  28.05 
 
 		 414 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0066545  normal  0.0551798 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  29.56 
 
 		 401 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  26.63 
 
 		 420 aa  145  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  26.9 
 
 		 429 aa  145  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0388  phage integrase family site specific recombinase  28.84 
 
 		 429 aa  144  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2184  Phage integrase  29.31 
 
 		 403 aa  144  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.264722  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  30.08 
 
 		 404 aa  144  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2292  phage integrase family protein  27.13 
 
 		 393 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.919949  normal  0.20238 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  27.8 
 
 		 404 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2526  Phage integrase  26.97 
 
 		 481 aa  143  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000237436  normal  0.0434699 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  27.38 
 
 		 421 aa  143  6e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  29.57 
 
 		 404 aa  142  9e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2119  integrative genetic element Gsu56, integrase  27.67 
 
 		 453 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1967  integrase family protein  27.3 
 
 		 429 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.0364461 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  28.82 
 
 		 409 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0496  phage integrase  28.68 
 
 		 418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3112  integrase family protein  29.53 
 
 		 418 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1216  phage integrase family protein  29.43 
 
 		 402 aa  140  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.190832  normal  0.145773 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2626  phage integrase family protein  26.74 
 
 		 393 aa  140  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000269871  normal  0.0831358 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04051  site-specific recombinase, phage integrase family protein  28.35 
 
 		 415 aa  140  4.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3366  phage integrase family protein  29.3 
 
 		 394 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1172  integrase family protein  27.93 
 
 		 418 aa  140  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3563  integrase family protein  27.93 
 
 		 418 aa  140  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2704  Phage integrase  28.82 
 
 		 404 aa  139  7e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143842  hitchhiker  0.00000139825 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  29.57 
 
 		 404 aa  139  7e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  26.6 
 
 		 389 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>