More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0805 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  100 
 
 		 433 aa  897    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  49.66 
 
 		 449 aa  409  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  42.92 
 
 		 439 aa  345  1e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  40.42 
 
 		 427 aa  310  4e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1371  phage integrase family protein  39.82 
 
 		 453 aa  309  5e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  37.61 
 
 		 437 aa  294  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  36.65 
 
 		 439 aa  276  7e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2119  integrative genetic element Gsu56, integrase  33.62 
 
 		 453 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2416  integrase family protein  34.82 
 
 		 443 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2279  Phage integrase  34.72 
 
 		 414 aa  234  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0066545  normal  0.0551798 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0813  integrase family protein  33.1 
 
 		 427 aa  229  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000471518 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  32.75 
 
 		 413 aa  197  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  31.87 
 
 		 413 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  31.35 
 
 		 413 aa  174  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  30.3 
 
 		 414 aa  173  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  32.17 
 
 		 413 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  30.5 
 
 		 414 aa  166  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  30.5 
 
 		 414 aa  165  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  33.23 
 
 		 361 aa  163  6e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  30.29 
 
 		 406 aa  160  3e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  27.49 
 
 		 400 aa  157  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  29.13 
 
 		 417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3683  phage integrase family protein  30.51 
 
 		 444 aa  151  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  27.27 
 
 		 410 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  25.87 
 
 		 414 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  26.7 
 
 		 409 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  25.87 
 
 		 409 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  25.87 
 
 		 409 aa  146  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  27.92 
 
 		 426 aa  145  9e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3306  Phage integrase  27.65 
 
 		 450 aa  144  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889733  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1709  putative phage integrase  27.15 
 
 		 446 aa  143  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  27.04 
 
 		 422 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  26.99 
 
 		 395 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  28.37 
 
 		 398 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  27.73 
 
 		 402 aa  140  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2211  phage integrase  27.02 
 
 		 423 aa  141  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684899  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1028  Phage integrase  27.72 
 
 		 424 aa  139  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214982  normal  0.0128497 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  27.19 
 
 		 439 aa  139  8.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  25.3 
 
 		 415 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  27.17 
 
 		 420 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  27.51 
 
 		 395 aa  139  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  26.75 
 
 		 400 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5552  integrase family protein  27.97 
 
 		 424 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  30.07 
 
 		 405 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  29.73 
 
 		 432 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  26.99 
 
 		 400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  28.74 
 
 		 401 aa  137  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  27.13 
 
 		 422 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  27.11 
 
 		 422 aa  137  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  27.6 
 
 		 399 aa  136  7.000000000000001e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  28.05 
 
 		 408 aa  134  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2900  phage integrase  27.92 
 
 		 391 aa  133  5e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  28.17 
 
 		 404 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  28.36 
 
 		 403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  24.47 
 
 		 417 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  27.23 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  27.88 
 
 		 412 aa  131  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  27.01 
 
 		 414 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1623  integrase or site-specific recombinase  27.47 
 
 		 466 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2142  phage integrase  27.08 
 
 		 418 aa  127  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  26.56 
 
 		 415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6547  integrase family protein  26.46 
 
 		 455 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352142  normal  0.0182485 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1878  putative integrase  26.83 
 
 		 425 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.184819 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  25.95 
 
 		 419 aa  127  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0496  phage integrase  26.32 
 
 		 418 aa  127  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 418 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2336  Phage integrase  25.45 
 
 		 426 aa  126  7e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1914  integrative genetic element Gsu32, integrase, putative  25.67 
 
 		 433 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.409637  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  25.86 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  27.49 
 
 		 418 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  28.16 
 
 		 413 aa  124  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2917  phage integrase family site specific recombinase  26.56 
 
 		 415 aa  124  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3232  integrase family protein  24.77 
 
 		 434 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.462781 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  26.88 
 
 		 403 aa  124  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  26.11 
 
 		 414 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  25.53 
 
 		 396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3867  phage integrase  27.63 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  27.2 
 
 		 400 aa  120  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  26.65 
 
 		 389 aa  120  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3239  integrase family protein  26.96 
 
 		 424 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0978515  normal  0.26506 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  27 
 
 		 420 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  26.67 
 
 		 390 aa  120  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1262  integrase family protein  26.38 
 
 		 418 aa  120  6e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3062  phage integrase  26.76 
 
 		 418 aa  120  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361431  normal  0.0996208 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1172  integrase family protein  26.08 
 
 		 418 aa  119  7.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3563  integrase family protein  26.08 
 
 		 418 aa  119  7.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  27.29 
 
 		 391 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2942  phage integrase family protein  24.1 
 
 		 392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000983731 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5324  integrase  26.43 
 
 		 395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  28.12 
 
 		 404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  26.56 
 
 		 397 aa  117  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  25.43 
 
 		 410 aa  117  5e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3112  integrase family protein  25.84 
 
 		 418 aa  116  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  26.92 
 
 		 425 aa  117  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  25.69 
 
 		 402 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2845  phage integrase family protein  25.19 
 
 		 409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  0.121401 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  26.82 
 
 		 404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  25.53 
 
 		 410 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  23.99 
 
 		 440 aa  114  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0444  integrase family protein  25.51 
 
 		 461 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.737271 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>