More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3867 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3867  phage integrase  100 
 
 		 400 aa  810    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2460  integrase family protein  41.19 
 
 		 415 aa  233  5e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  36.74 
 
 		 417 aa  219  7e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  35.42 
 
 		 412 aa  183  6e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  34.22 
 
 		 413 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  36.36 
 
 		 414 aa  178  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  32.39 
 
 		 426 aa  178  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  35.32 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2211  phage integrase  34.04 
 
 		 423 aa  164  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684899  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  34.46 
 
 		 413 aa  159  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4935  putative phage-like integrase  42.68 
 
 		 434 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  30 
 
 		 400 aa  151  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  32.63 
 
 		 413 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2900  phage integrase  36.48 
 
 		 391 aa  140  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3683  phage integrase family protein  32.53 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  32.84 
 
 		 420 aa  132  9e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  27.79 
 
 		 427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  33.55 
 
 		 361 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  27.63 
 
 		 433 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  26.7 
 
 		 449 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  27.86 
 
 		 437 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  25.74 
 
 		 413 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  26.8 
 
 		 396 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2279  Phage integrase  27.51 
 
 		 414 aa  110  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0066545  normal  0.0551798 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  29.95 
 
 		 403 aa  111  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  28.34 
 
 		 439 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  29.66 
 
 		 410 aa  106  7e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  30.87 
 
 		 420 aa  105  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  29.79 
 
 		 425 aa  105  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  27.5 
 
 		 395 aa  103  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  31.32 
 
 		 388 aa  103  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2416  integrase family protein  28.87 
 
 		 443 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  28.12 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  31.05 
 
 		 393 aa  101  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  29.07 
 
 		 410 aa  100  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  28.06 
 
 		 400 aa  100  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3112  integrase family protein  27.32 
 
 		 418 aa  100  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  27.85 
 
 		 400 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  26.21 
 
 		 402 aa  99  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  28.71 
 
 		 400 aa  99.4  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  26.72 
 
 		 399 aa  99.4  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  25.79 
 
 		 402 aa  99.4  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4160  phage integrase family protein  30.21 
 
 		 419 aa  99  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0690268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  27.45 
 
 		 398 aa  99.4  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2142  phage integrase  27.25 
 
 		 418 aa  98.6  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  29.41 
 
 		 406 aa  98.6  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  29.8 
 
 		 452 aa  97.4  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  29.32 
 
 		 432 aa  97.4  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1085  hypothetical protein  26.76 
 
 		 413 aa  96.7  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  29.02 
 
 		 420 aa  96.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  29.8 
 
 		 439 aa  96.7  7e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3062  phage integrase  27.03 
 
 		 418 aa  96.3  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361431  normal  0.0996208 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1262  integrase family protein  26.76 
 
 		 418 aa  94.7  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  25.72 
 
 		 395 aa  95.5  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  27.67 
 
 		 418 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  30.1 
 
 		 418 aa  95.1  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  28.19 
 
 		 439 aa  93.6  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3306  Phage integrase  30 
 
 		 450 aa  93.6  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889733  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2668  phage integrase family site specific recombinase  25.98 
 
 		 411 aa  92.8  9e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3366  phage integrase family protein  28.18 
 
 		 394 aa  92  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0318  hypothetical protein  25.45 
 
 		 515 aa  92.8  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  24.68 
 
 		 414 aa  91.3  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0496  phage integrase  27.34 
 
 		 418 aa  91.3  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  26.42 
 
 		 402 aa  90.9  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1172  integrase family protein  24.69 
 
 		 418 aa  90.1  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  30.89 
 
 		 411 aa  90.1  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3563  integrase family protein  24.69 
 
 		 418 aa  90.1  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  24.68 
 
 		 414 aa  89.7  7e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1709  putative phage integrase  24.88 
 
 		 446 aa  89.4  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  28.38 
 
 		 403 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  28.95 
 
 		 452 aa  88.6  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2845  phage integrase family protein  25.13 
 
 		 409 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  0.121401 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  25.8 
 
 		 405 aa  88.2  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1686  phage integrase family protein  26.28 
 
 		 411 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.034435  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2119  integrative genetic element Gsu56, integrase  28.76 
 
 		 453 aa  87.8  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0813  integrase family protein  30.52 
 
 		 427 aa  87.8  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000471518 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  25.83 
 
 		 417 aa  88.2  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  29.16 
 
 		 387 aa  87.8  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  27.25 
 
 		 419 aa  87.4  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  27.64 
 
 		 410 aa  87  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1791  phage integrase family protein  25.98 
 
 		 411 aa  86.7  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.275952  normal  0.224939 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  28.06 
 
 		 422 aa  86.7  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  25.65 
 
 		 410 aa  86.7  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  24.21 
 
 		 411 aa  86.7  7e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1761  phage integrase family protein  25.98 
 
 		 411 aa  86.3  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0148676  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  24.66 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  26.46 
 
 		 443 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  27.87 
 
 		 422 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  26.85 
 
 		 432 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  28.07 
 
 		 409 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2309  phage integrase family protein  23.65 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733964  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  28.07 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6547  integrase family protein  25.06 
 
 		 455 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352142  normal  0.0182485 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2217  integrase family protein  26.91 
 
 		 418 aa  84.7  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.664863  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1130  integrase family protein  29.19 
 
 		 418 aa  84.3  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2336  Phage integrase  25.69 
 
 		 426 aa  84  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  27.79 
 
 		 409 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  28.72 
 
 		 451 aa  84  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  29.58 
 
 		 409 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2743  phage integrase  24.49 
 
 		 417 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0469991  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>