More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0357 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  100 
 
 		 389 aa  803    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  38.17 
 
 		 414 aa  202  9e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  31.75 
 
 		 426 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2211  phage integrase  30.49 
 
 		 423 aa  176  6e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684899  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  31.03 
 
 		 417 aa  173  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3867  phage integrase  35.32 
 
 		 400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  30.71 
 
 		 413 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2900  phage integrase  30.42 
 
 		 391 aa  158  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  32.19 
 
 		 413 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  29.95 
 
 		 413 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  30.31 
 
 		 412 aa  146  7.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  28.54 
 
 		 400 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2460  integrase family protein  31.06 
 
 		 415 aa  142  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  27.74 
 
 		 449 aa  140  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4935  putative phage-like integrase  31.36 
 
 		 434 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3683  phage integrase family protein  31.03 
 
 		 444 aa  133  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  30.21 
 
 		 361 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  28.01 
 
 		 413 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  26.65 
 
 		 433 aa  120  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  27.74 
 
 		 427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  26.7 
 
 		 414 aa  116  6e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  27.42 
 
 		 439 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  26.15 
 
 		 387 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  25.46 
 
 		 414 aa  113  5e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  26.94 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1371  phage integrase family protein  26.95 
 
 		 453 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  26.46 
 
 		 402 aa  107  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2015  phage integrase family site specific recombinase  28.08 
 
 		 390 aa  107  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  26.76 
 
 		 400 aa  107  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  26.46 
 
 		 406 aa  106  7e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  25.98 
 
 		 439 aa  103  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2119  integrative genetic element Gsu56, integrase  25.61 
 
 		 453 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  27.91 
 
 		 406 aa  102  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3306  Phage integrase  25.11 
 
 		 450 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889733  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  25.63 
 
 		 400 aa  100  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  25.63 
 
 		 400 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  27.79 
 
 		 432 aa  100  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  25.89 
 
 		 467 aa  99.8  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  27.46 
 
 		 388 aa  99.8  8e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3579  integrase  27.39 
 
 		 389 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000745226 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  25.67 
 
 		 400 aa  98.2  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  24.58 
 
 		 437 aa  97.8  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  27.07 
 
 		 409 aa  97.4  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  26.94 
 
 		 411 aa  97.1  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  25.64 
 
 		 463 aa  97.4  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  26.67 
 
 		 417 aa  97.1  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0813  integrase family protein  25.57 
 
 		 427 aa  97.1  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000471518 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  25.76 
 
 		 412 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  26.96 
 
 		 397 aa  95.9  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2142  phage integrase  27.68 
 
 		 418 aa  95.5  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3540  integrase family protein  26.35 
 
 		 399 aa  95.1  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2292  phage integrase family protein  25 
 
 		 393 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.919949  normal  0.20238 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2745  integrase family protein  26.35 
 
 		 415 aa  94.4  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.99512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2601  integrase family protein  26.35 
 
 		 399 aa  94.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3045  phage integrase  26.35 
 
 		 415 aa  94.4  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  27.82 
 
 		 439 aa  93.2  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2942  phage integrase family protein  25.62 
 
 		 392 aa  93.2  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000983731 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  24.57 
 
 		 400 aa  93.2  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  27.49 
 
 		 403 aa  92.4  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2668  phage integrase family site specific recombinase  28.35 
 
 		 411 aa  92.4  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  27.27 
 
 		 422 aa  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2626  phage integrase family protein  25 
 
 		 393 aa  91.7  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000269871  normal  0.0831358 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  27.4 
 
 		 420 aa  91.3  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1236  phage integrase  25 
 
 		 399 aa  90.9  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449507  normal  0.10874 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  27.17 
 
 		 425 aa  91.3  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2279  Phage integrase  25.75 
 
 		 414 aa  90.5  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0066545  normal  0.0551798 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  26.1 
 
 		 405 aa  90.1  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  25.31 
 
 		 399 aa  90.5  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  27 
 
 		 422 aa  90.1  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  25.73 
 
 		 410 aa  89.4  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3747  integrase  24.07 
 
 		 399 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1085  hypothetical protein  26.13 
 
 		 413 aa  87.8  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  23.59 
 
 		 401 aa  87.8  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  25.42 
 
 		 409 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3112  integrase family protein  25.44 
 
 		 418 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  25.25 
 
 		 414 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  26.17 
 
 		 403 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  25.54 
 
 		 451 aa  87.4  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  28.22 
 
 		 418 aa  87.4  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  25.25 
 
 		 409 aa  86.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1639  phage integrase family protein  26.99 
 
 		 403 aa  86.7  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0427266  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  26.63 
 
 		 418 aa  86.3  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1262  integrase family protein  25.81 
 
 		 418 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  26.89 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  26.17 
 
 		 419 aa  84.3  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  27.63 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  26.67 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3239  integrase family protein  33.66 
 
 		 424 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0978515  normal  0.26506 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0497  integrase family protein  23.56 
 
 		 412 aa  82.4  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0318  hypothetical protein  34.1 
 
 		 515 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1172  integrase family protein  25.37 
 
 		 418 aa  82  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3563  integrase family protein  25.37 
 
 		 418 aa  82  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  27.59 
 
 		 384 aa  80.9  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3273  phage integrase family protein  26.61 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0956673  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  25.4 
 
 		 384 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1878  putative integrase  29.91 
 
 		 425 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.184819 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0496  phage integrase  26.28 
 
 		 418 aa  80.1  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  24.56 
 
 		 443 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1028  Phage integrase  33.49 
 
 		 424 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214982  normal  0.0128497 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  24.07 
 
 		 444 aa  79.7  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>