More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1639 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1639  phage integrase family protein  100 
 
 		 403 aa  827    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0427266  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3579  integrase  40.51 
 
 		 389 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000745226 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2942  phage integrase family protein  40.98 
 
 		 392 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000983731 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1719  phage integrase family protein  65.89 
 
 		 231 aa  299  7e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.592046 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2626  phage integrase family protein  38.92 
 
 		 393 aa  285  9e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000269871  normal  0.0831358 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2292  phage integrase family protein  38.66 
 
 		 393 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.919949  normal  0.20238 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2015  phage integrase family site specific recombinase  38.23 
 
 		 390 aa  267  2.9999999999999995e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3013  phage integrase family site specific recombinase  32.2 
 
 		 419 aa  191  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3410  integrase family protein  32.25 
 
 		 401 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134022  hitchhiker  0.000868318 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2845  phage integrase family protein  30.08 
 
 		 409 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  0.121401 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3273  phage integrase family protein  32.5 
 
 		 401 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0956673  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1571  site-specific recombinase, phage integrase family  31.84 
 
 		 409 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0359454  decreased coverage  0.000000698249 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2650  integrase family protein  31.07 
 
 		 410 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0205154  hitchhiker  0.00000395125 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2668  phage integrase family site specific recombinase  30.25 
 
 		 411 aa  173  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3754  integrase family protein  28.75 
 
 		 407 aa  162  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.290204  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  27.32 
 
 		 406 aa  152  7e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0948  putative integrase  30.38 
 
 		 385 aa  143  6e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0939  phage integrase family site specific recombinase  27.18 
 
 		 406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.456123  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  26.85 
 
 		 413 aa  138  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  25.91 
 
 		 414 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  25.91 
 
 		 409 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  25.91 
 
 		 409 aa  133  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  28.78 
 
 		 425 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  24.43 
 
 		 414 aa  129  9.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  27.02 
 
 		 410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0388  phage integrase family site specific recombinase  25.87 
 
 		 429 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  23.92 
 
 		 414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  24.94 
 
 		 409 aa  124  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  26.43 
 
 		 439 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  25.24 
 
 		 419 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  24.18 
 
 		 393 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  27.65 
 
 		 410 aa  117  5e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3540  phage integrase family protein  27.03 
 
 		 420 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.216413  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  26.11 
 
 		 422 aa  113  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  28.24 
 
 		 396 aa  113  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  25.47 
 
 		 422 aa  113  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  24.59 
 
 		 420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  25.96 
 
 		 403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  24.75 
 
 		 409 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  23.16 
 
 		 400 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  25 
 
 		 398 aa  109  9.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  24 
 
 		 433 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  26.01 
 
 		 414 aa  109  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  27.41 
 
 		 402 aa  107  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  24.88 
 
 		 395 aa  106  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  24.07 
 
 		 418 aa  106  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  24.76 
 
 		 420 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1262  integrase family protein  26.32 
 
 		 418 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  23.88 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  25.31 
 
 		 402 aa  105  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  24.87 
 
 		 403 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  25.54 
 
 		 413 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  25.33 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  24.5 
 
 		 418 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  23.37 
 
 		 427 aa  103  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2704  Phage integrase  25.69 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143842  hitchhiker  0.00000139825 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  26.37 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  24.75 
 
 		 396 aa  102  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  24.32 
 
 		 415 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  25.41 
 
 		 404 aa  101  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  25.87 
 
 		 414 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2675  hypothetical protein  23.47 
 
 		 443 aa  100  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  26.61 
 
 		 413 aa  100  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2864  phage integrase family protein  25.13 
 
 		 385 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.988255 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1465  phage integrase  27.63 
 
 		 418 aa  100  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0137829  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2900  phage integrase  24.26 
 
 		 391 aa  100  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  25 
 
 		 404 aa  100  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0697  integrase family protein  23.74 
 
 		 618 aa  99.4  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  24.5 
 
 		 398 aa  99.4  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  22.74 
 
 		 402 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  24.69 
 
 		 404 aa  98.6  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  22.42 
 
 		 437 aa  98.2  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3683  phage integrase family protein  24.4 
 
 		 444 aa  98.2  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  24.26 
 
 		 399 aa  97.8  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  24.39 
 
 		 404 aa  97.8  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  24.09 
 
 		 394 aa  97.4  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  24.88 
 
 		 415 aa  97.1  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  24.25 
 
 		 409 aa  96.7  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  26.39 
 
 		 418 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  24.32 
 
 		 400 aa  96.7  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  24.03 
 
 		 412 aa  96.3  9e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  24.68 
 
 		 404 aa  95.9  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  24.62 
 
 		 404 aa  95.5  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  24.26 
 
 		 402 aa  95.5  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1977  phage integrase family protein  25.36 
 
 		 617 aa  95.5  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.602154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  25.06 
 
 		 389 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  25.36 
 
 		 418 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  22.6 
 
 		 439 aa  95.1  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2211  phage integrase  23.49 
 
 		 423 aa  94.7  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684899  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1709  putative phage integrase  23.92 
 
 		 446 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2408  integrase (int)  25.6 
 
 		 617 aa  95.5  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.71715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  24.11 
 
 		 401 aa  94.7  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  25.39 
 
 		 413 aa  94.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1130  integrase family protein  24.24 
 
 		 418 aa  94  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  22.25 
 
 		 402 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  23.89 
 
 		 422 aa  94  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3669  prophage CP4-like integrase  24.07 
 
 		 462 aa  94  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18314  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3232  integrase family protein  23.44 
 
 		 434 aa  93.6  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.462781 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4470  putative phage integrase  24.59 
 
 		 399 aa  93.2  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.052147 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  21.25 
 
 		 449 aa  93.6  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>