More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3747 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2622  integrase protein  78.12 
 
 		 400 aa  661    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3540  integrase family protein  80.15 
 
 		 399 aa  662    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3747  integrase  100 
 
 		 399 aa  830    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2601  integrase family protein  79.9 
 
 		 399 aa  662    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2745  integrase family protein  79.65 
 
 		 415 aa  659    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.99512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1236  phage integrase  84.92 
 
 		 399 aa  714    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449507  normal  0.10874 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  77.06 
 
 		 401 aa  652    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3045  phage integrase  79.65 
 
 		 415 aa  659    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0497  integrase family protein  78.89 
 
 		 412 aa  652    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  91.82 
 
 		 400 aa  753    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  76.94 
 
 		 399 aa  654    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  74.17 
 
 		 400 aa  620  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  74.17 
 
 		 400 aa  620  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  62.56 
 
 		 467 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  63.68 
 
 		 444 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1865  integrase family protein  64.05 
 
 		 401 aa  504  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.94549  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31280  putative integrase  64.05 
 
 		 401 aa  504  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000488668  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2625  phage integrase family protein  63.87 
 
 		 400 aa  500  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  40.41 
 
 		 411 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0807  integrase protein  66.85 
 
 		 181 aa  251  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  39.47 
 
 		 397 aa  250  4e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  39.01 
 
 		 384 aa  233  6e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  38.42 
 
 		 384 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  35.03 
 
 		 393 aa  216  7e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3724  putative integrase protein  80.49 
 
 		 143 aa  210  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  31.3 
 
 		 388 aa  186  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  27.09 
 
 		 434 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  28.39 
 
 		 400 aa  133  6e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  28.88 
 
 		 429 aa  130  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  25.54 
 
 		 463 aa  129  8.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  27.91 
 
 		 451 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  26.52 
 
 		 451 aa  123  6e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  26.1 
 
 		 452 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  26.76 
 
 		 432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  25.07 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  26.1 
 
 		 452 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  24.8 
 
 		 376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  25.07 
 
 		 376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  24.8 
 
 		 376 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  23.97 
 
 		 379 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  25.96 
 
 		 387 aa  109  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  24.49 
 
 		 402 aa  109  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  26.39 
 
 		 430 aa  104  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3752  phage integrase family protein  25.58 
 
 		 422 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.538338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  26.59 
 
 		 404 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  24.62 
 
 		 412 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  25 
 
 		 451 aa  101  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  25.73 
 
 		 420 aa  96.7  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  27.85 
 
 		 426 aa  96.3  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  27.12 
 
 		 401 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  24.22 
 
 		 412 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3853  integrase family protein  23.74 
 
 		 500 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  28.53 
 
 		 403 aa  94.4  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  25.83 
 
 		 397 aa  90.9  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  27.81 
 
 		 410 aa  90.5  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  33.89 
 
 		 439 aa  89  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  27.54 
 
 		 410 aa  88.6  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2136  phage integrase family protein  25.81 
 
 		 389 aa  88.6  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0404563  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  24.07 
 
 		 389 aa  87.8  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  23.97 
 
 		 417 aa  87.4  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  29.66 
 
 		 449 aa  86.3  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0919  integrase family protein  27.24 
 
 		 448 aa  85.5  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.295922  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  26.65 
 
 		 394 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1085  hypothetical protein  24.28 
 
 		 413 aa  84.3  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2399  hypothetical protein  42.99 
 
 		 137 aa  84  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229698  normal  0.0250128 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  25.31 
 
 		 396 aa  83.6  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  27.19 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  24.16 
 
 		 451 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  29.85 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.1 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  27.2 
 
 		 404 aa  80.1  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  24.42 
 
 		 456 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  24.17 
 
 		 402 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  23.72 
 
 		 443 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  31.44 
 
 		 328 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  26.33 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  26.46 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  24.16 
 
 		 451 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  25.19 
 
 		 482 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  23.91 
 
 		 451 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  23.41 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  23.27 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  21.77 
 
 		 401 aa  76.3  0.0000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  26.58 
 
 		 367 aa  76.3  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  27.6 
 
 		 404 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  22.74 
 
 		 429 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  27.32 
 
 		 404 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  28.24 
 
 		 417 aa  75.9  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  22.82 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  29.61 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  21.98 
 
 		 421 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  27.91 
 
 		 425 aa  73.9  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  22.97 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  31.58 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  24.69 
 
 		 337 aa  73.2  0.000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  24.51 
 
 		 420 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0637  phage integrase family protein  25.84 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102856 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  27.9 
 
 		 381 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  23.17 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  25.85 
 
 		 413 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>