More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4029 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  100 
 
 		 467 aa  963    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  59.48 
 
 		 444 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2625  phage integrase family protein  65.82 
 
 		 400 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  65.13 
 
 		 400 aa  538  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  65.13 
 
 		 400 aa  538  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  63.54 
 
 		 400 aa  533  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1865  integrase family protein  65.9 
 
 		 401 aa  533  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.94549  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31280  putative integrase  65.9 
 
 		 401 aa  533  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000488668  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  63.73 
 
 		 400 aa  525  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  64.54 
 
 		 401 aa  521  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  64.36 
 
 		 399 aa  520  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3747  integrase  62.56 
 
 		 399 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3540  integrase family protein  65.49 
 
 		 399 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2601  integrase family protein  64.99 
 
 		 399 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3045  phage integrase  65.06 
 
 		 415 aa  514  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2745  integrase family protein  65.06 
 
 		 415 aa  514  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.99512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1236  phage integrase  63.33 
 
 		 399 aa  514  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449507  normal  0.10874 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0497  integrase family protein  65.05 
 
 		 412 aa  510  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  38.6 
 
 		 411 aa  278  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  40.41 
 
 		 384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  38.86 
 
 		 384 aa  261  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  38.13 
 
 		 397 aa  261  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0807  integrase protein  62.98 
 
 		 181 aa  237  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  35.04 
 
 		 393 aa  228  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  33.17 
 
 		 388 aa  206  6e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3724  putative integrase protein  64.17 
 
 		 143 aa  171  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  31.4 
 
 		 434 aa  170  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  28.41 
 
 		 463 aa  153  7e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  29.98 
 
 		 451 aa  152  8.999999999999999e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  29.31 
 
 		 429 aa  150  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  29.14 
 
 		 451 aa  150  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  28.89 
 
 		 400 aa  139  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  27.9 
 
 		 452 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  28.75 
 
 		 432 aa  135  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  26.8 
 
 		 376 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  27.11 
 
 		 376 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  26.48 
 
 		 452 aa  134  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  26.8 
 
 		 376 aa  134  5e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  26.8 
 
 		 376 aa  133  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  28.54 
 
 		 387 aa  129  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  25.87 
 
 		 451 aa  127  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  26.57 
 
 		 412 aa  124  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  26.51 
 
 		 379 aa  124  5e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3752  phage integrase family protein  26.63 
 
 		 422 aa  121  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.538338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  27.31 
 
 		 430 aa  117  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  25.25 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  26.42 
 
 		 420 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  26.57 
 
 		 456 aa  110  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  26.76 
 
 		 451 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  27.16 
 
 		 451 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  26.46 
 
 		 451 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  26.22 
 
 		 426 aa  106  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  24.11 
 
 		 404 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  28.79 
 
 		 413 aa  101  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0919  integrase family protein  26.95 
 
 		 448 aa  101  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.295922  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  30.94 
 
 		 449 aa  100  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  25.89 
 
 		 389 aa  99.4  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  25.18 
 
 		 412 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  31.31 
 
 		 361 aa  95.9  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  24.79 
 
 		 397 aa  94.4  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  24.48 
 
 		 439 aa  94.4  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  26.29 
 
 		 415 aa  93.6  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  27.1 
 
 		 367 aa  91.3  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  25.47 
 
 		 429 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  25.07 
 
 		 401 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  26.15 
 
 		 413 aa  90.1  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4708  integrase family protein  26.71 
 
 		 342 aa  89.4  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.014031  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  26.85 
 
 		 414 aa  89  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  25.84 
 
 		 413 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  23.66 
 
 		 443 aa  88.6  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  26.54 
 
 		 418 aa  87.4  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  26.09 
 
 		 414 aa  87  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  26.56 
 
 		 412 aa  87  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  25.45 
 
 		 406 aa  86.7  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  23.93 
 
 		 396 aa  86.7  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  27.48 
 
 		 433 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  25 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  24.28 
 
 		 410 aa  85.1  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  23.19 
 
 		 482 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  24.88 
 
 		 444 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  24.24 
 
 		 421 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  25.8 
 
 		 347 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  25.8 
 
 		 347 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  25.99 
 
 		 439 aa  83.6  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1262  integrase family protein  26.89 
 
 		 418 aa  83.2  0.000000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  25.63 
 
 		 353 aa  82  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3112  integrase family protein  25.83 
 
 		 418 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2211  phage integrase  24.94 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684899  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  23.31 
 
 		 401 aa  81.3  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  24.19 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3366  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 394 aa  80.5  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  22.72 
 
 		 417 aa  79.7  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  28.82 
 
 		 251 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3114  phage integrase family protein  26.04 
 
 		 284 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  24.52 
 
 		 394 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  26.86 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  27.54 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  24.08 
 
 		 413 aa  77  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0241  Phage integrase  21.62 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  25.83 
 
 		 351 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>