More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0495 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  100 
 
 
328 aa  680    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3921  phage integrase family protein  46.5 
 
 
327 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  hitchhiker  0.00183347 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  48.33 
 
 
330 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  39.82 
 
 
338 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3654  Phage integrase  37.18 
 
 
340 aa  228  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000207497  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  38.62 
 
 
339 aa  222  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1522  phage integrase family site specific recombinase  38.79 
 
 
339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  38.86 
 
 
334 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  39.29 
 
 
340 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0807  phage integrase family protein  38.39 
 
 
323 aa  207  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  36.06 
 
 
332 aa  205  9e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  35.14 
 
 
337 aa  203  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0969  integrase family protein  36.08 
 
 
348 aa  199  7.999999999999999e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.23183  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  34.99 
 
 
354 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  35.54 
 
 
347 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  40.66 
 
 
356 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1808  phage integrase family site specific recombinase  35.34 
 
 
352 aa  178  9e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.595703  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  42.48 
 
 
222 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1655  integrase/recombinase protein  34.71 
 
 
334 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  35.06 
 
 
347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  35.06 
 
 
347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  33.43 
 
 
413 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3039  phage integrase  36.78 
 
 
339 aa  169  7e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1571  site-specific integrase/recombinase  34.24 
 
 
381 aa  169  8e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  36.26 
 
 
375 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7113  integrase family protein  32.28 
 
 
347 aa  165  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00596865 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  32.47 
 
 
351 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0242  integrase family protein  32.2 
 
 
373 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  37.46 
 
 
374 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  37.5 
 
 
395 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  37.32 
 
 
374 aa  162  6e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  32.18 
 
 
351 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  36.82 
 
 
374 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  35.77 
 
 
380 aa  160  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2847  phage integrase  36.88 
 
 
366 aa  155  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  30.09 
 
 
353 aa  149  7e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1220  integrase  34.96 
 
 
286 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3178  phage integrase family protein  28.87 
 
 
339 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0368902  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2659  integrase family protein  28.25 
 
 
531 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04371  hypothetical protein  29.48 
 
 
321 aa  129  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1794  integrase family protein  29.02 
 
 
343 aa  126  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0543031  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3125  Phage integrase  32.19 
 
 
364 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1049  integrase family protein  31.21 
 
 
380 aa  122  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1421  phage integrase family protein  28.9 
 
 
351 aa  115  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3193  integrase family protein  29.75 
 
 
365 aa  115  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175664  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  32.88 
 
 
359 aa  115  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  34.74 
 
 
251 aa  112  9e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3493  integrase  27.89 
 
 
571 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2234  integrase family protein  28.24 
 
 
341 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.533752  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2121  integrase family protein  28.9 
 
 
405 aa  106  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  32.1 
 
 
354 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  32.1 
 
 
354 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  28.87 
 
 
367 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2576  integrase family protein  27.51 
 
 
338 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.478177  hitchhiker  0.000378812 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2610  integrase family protein  27.51 
 
 
338 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0241311  unclonable  5.16639e-16 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1711  integrase family protein  25.8 
 
 
380 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213299  hitchhiker  0.00000987295 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01212  site-specific recombinase, resolvase family protein  24.85 
 
 
336 aa  102  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03811  site-specific recombinase XerD  26.44 
 
 
327 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2435  integrase family protein  27.35 
 
 
389 aa  102  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.061585  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1152  integrase family protein  23.76 
 
 
365 aa  99  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.379304  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0382  putative site-specific integrase/recombinase  32.02 
 
 
204 aa  97.1  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2030  phage integrase family protein  25.69 
 
 
365 aa  96.7  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.755048  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  28.74 
 
 
386 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2363  phage integrase family site specific recombinase  26.38 
 
 
368 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  32.22 
 
 
337 aa  94  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1807  integrase family protein  29.27 
 
 
278 aa  92.4  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.73649  hitchhiker  0.0000891918 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03598  site-specific recombinase, phage integrase family protein  21.94 
 
 
380 aa  92.4  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.951563  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  30 
 
 
402 aa  92.4  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0471  integrase family protein  25.97 
 
 
398 aa  90.9  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116709  hitchhiker  0.000616461 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  23.12 
 
 
337 aa  91.3  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  29.75 
 
 
429 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0398  shufflon-specific DNA recombinase  22.77 
 
 
356 aa  90.5  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  28.95 
 
 
384 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3005  phage integrase family site specific recombinase  31.65 
 
 
369 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3130  integrase, putative  36.29 
 
 
147 aa  88.2  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.986552  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3070  prophage DLP12 integrase  31.65 
 
 
369 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1532  phage integrase family site specific recombinase  31.65 
 
 
369 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3300  phage integrase family site specific recombinase  31.65 
 
 
369 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248425  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  29.53 
 
 
384 aa  87  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  29.71 
 
 
482 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3278  phage integrase family site specific recombinase  40.16 
 
 
146 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2042  integrase family protein  32.37 
 
 
350 aa  81.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0960893  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  33.01 
 
 
334 aa  80.9  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  24.44 
 
 
387 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4490  phage integrase family protein  23.46 
 
 
365 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6537  normal  0.0343494 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  36.36 
 
 
159 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5550  phage integrase family protein  23.46 
 
 
365 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  33.51 
 
 
397 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  31.03 
 
 
393 aa  79.7  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  27.19 
 
 
387 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  27.19 
 
 
387 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0745  phage integrase family protein  23.15 
 
 
357 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.107824 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3455  putative integrase/recombinase  24.77 
 
 
362 aa  79.3  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375642  normal  0.439237 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3747  integrase  31.44 
 
 
399 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  28.26 
 
 
387 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  29.45 
 
 
396 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  28.57 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0165  integrase family protein  30.97 
 
 
369 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  27.39 
 
 
387 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  28.81 
 
 
401 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>