More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2770 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  76.19 
 
 		 451 aa  699    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  100 
 
 		 452 aa  917    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  77.35 
 
 		 452 aa  705    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  78.64 
 
 		 451 aa  733    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  79.37 
 
 		 451 aa  726    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  51.2 
 
 		 432 aa  412  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  45.88 
 
 		 429 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  42.22 
 
 		 420 aa  291  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  35.56 
 
 		 463 aa  253  5.000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3752  phage integrase family protein  36.34 
 
 		 422 aa  228  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.538338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  34.78 
 
 		 430 aa  209  6e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  34.07 
 
 		 384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  33.42 
 
 		 384 aa  200  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  34.6 
 
 		 393 aa  199  7e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  32.68 
 
 		 397 aa  177  4e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  30.9 
 
 		 411 aa  168  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3853  integrase family protein  31.02 
 
 		 500 aa  160  6e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  29.1 
 
 		 444 aa  150  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  30.37 
 
 		 434 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  28.75 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  27.9 
 
 		 467 aa  138  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  28.78 
 
 		 388 aa  132  9e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  28.19 
 
 		 400 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  28.19 
 
 		 400 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1236  phage integrase  26.65 
 
 		 399 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449507  normal  0.10874 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2401  phage integrase  32.03 
 
 		 242 aa  122  9e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340015  normal  0.0277032 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  27.04 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  29.71 
 
 		 424 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  26.47 
 
 		 400 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  25.49 
 
 		 401 aa  120  6e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  27.34 
 
 		 400 aa  120  7e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3954  hypothetical protein  76.25 
 
 		 79 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  25.74 
 
 		 376 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3747  integrase  26.1 
 
 		 399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  24.88 
 
 		 376 aa  113  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2601  integrase family protein  26.47 
 
 		 399 aa  113  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2745  integrase family protein  26.47 
 
 		 415 aa  113  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.99512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3045  phage integrase  26.47 
 
 		 415 aa  113  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3540  integrase family protein  26.23 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0497  integrase family protein  27.34 
 
 		 412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  25.49 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  25.49 
 
 		 376 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  27.92 
 
 		 410 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  26.7 
 
 		 402 aa  106  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31280  putative integrase  26.04 
 
 		 401 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000488668  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1865  integrase family protein  26.04 
 
 		 401 aa  103  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.94549  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  28.75 
 
 		 406 aa  103  8e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2625  phage integrase family protein  25.49 
 
 		 400 aa  101  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  25.12 
 
 		 451 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  24.82 
 
 		 451 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  25 
 
 		 451 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  26.02 
 
 		 396 aa  100  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  23.97 
 
 		 456 aa  97.8  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0807  integrase protein  37.27 
 
 		 181 aa  97.8  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  26.02 
 
 		 482 aa  97.1  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  26.63 
 
 		 412 aa  97.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  26.49 
 
 		 417 aa  96.7  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  23.56 
 
 		 379 aa  96.3  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2399  hypothetical protein  46.09 
 
 		 137 aa  95.1  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229698  normal  0.0250128 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2136  phage integrase family protein  25.58 
 
 		 389 aa  90.1  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0404563  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3867  phage integrase  28.95 
 
 		 400 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  25.86 
 
 		 412 aa  88.6  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  25.33 
 
 		 387 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2460  integrase family protein  29.97 
 
 		 415 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  25.89 
 
 		 415 aa  83.6  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5073  hypothetical protein  38.22 
 
 		 159 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  27.05 
 
 		 426 aa  82  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  27.48 
 
 		 439 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  25 
 
 		 417 aa  81.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  24.32 
 
 		 337 aa  79.7  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0919  integrase family protein  23.78 
 
 		 448 aa  78.2  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.295922  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  26.2 
 
 		 443 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  24.88 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  24.71 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  26 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3424  integrase family protein  24.94 
 
 		 437 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728899 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  25.79 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  25.89 
 
 		 439 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  24.24 
 
 		 393 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  27.67 
 
 		 413 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1370  phage integrase  23.78 
 
 		 423 aa  75.9  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000628694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  25.75 
 
 		 378 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  26.02 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  24.04 
 
 		 400 aa  74.3  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3493  integrase family protein  25.12 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.247982  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  29.28 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  28.3 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  25.52 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  27.96 
 
 		 420 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1272  phage integrase family protein  24.55 
 
 		 425 aa  72  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000707551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3498  integrase family protein  24.17 
 
 		 486 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  25.69 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  25.89 
 
 		 416 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0686  integrase family protein  25.18 
 
 		 472 aa  72.4  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  26.37 
 
 		 433 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  24.21 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  24.3 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2900  phage integrase  24.02 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  26.61 
 
 		 359 aa  69.7  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2351  phage integrase  24.41 
 
 		 452 aa  69.7  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0439669  hitchhiker  0.00873644 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>