More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1272 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1272  phage integrase family protein  100 
 
 
425 aa  884    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000707551  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1370  phage integrase  68.16 
 
 
423 aa  606  9.999999999999999e-173  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000628694  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  30.79 
 
 
406 aa  189  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  29.93 
 
 
424 aa  180  4e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3498  integrase family protein  28.45 
 
 
486 aa  178  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  28.4 
 
 
417 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  28.94 
 
 
410 aa  151  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0614  integrase family protein  25.93 
 
 
476 aa  150  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1085  hypothetical protein  28.6 
 
 
413 aa  144  3e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3493  integrase family protein  25.9 
 
 
409 aa  123  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.247982  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2136  phage integrase family protein  25.48 
 
 
389 aa  109  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0404563  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  27.09 
 
 
412 aa  106  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2956  integrase family protein  25.23 
 
 
487 aa  98.6  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3028  putative phage integrase family protein  24.55 
 
 
486 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0919  integrase family protein  27.05 
 
 
448 aa  90.9  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.295922  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  24.16 
 
 
400 aa  87.8  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  22.99 
 
 
384 aa  87.4  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2401  phage integrase  31.02 
 
 
242 aa  86.7  8e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340015  normal  0.0277032 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  24.94 
 
 
387 aa  85.1  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  22.06 
 
 
384 aa  85.1  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  24.05 
 
 
434 aa  82.4  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0596  integrase family protein  23.83 
 
 
515 aa  80.9  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  25.21 
 
 
420 aa  79.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  24.71 
 
 
451 aa  77.8  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3752  phage integrase family protein  31.18 
 
 
422 aa  77  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.538338  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0292  phage integrase family protein  25 
 
 
440 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  23.93 
 
 
393 aa  76.6  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0402  hypothetical protein  23.82 
 
 
505 aa  75.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.124303  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0606  hypothetical protein  23.82 
 
 
505 aa  75.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175699  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  26.17 
 
 
430 aa  74.3  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  24.49 
 
 
451 aa  74.3  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0845  phage integrase  23.57 
 
 
457 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1326  phage integrase family protein  23.57 
 
 
457 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.558955  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  25.75 
 
 
452 aa  73.6  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  23.46 
 
 
463 aa  73.6  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  24.55 
 
 
452 aa  72  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  22.98 
 
 
413 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  24.12 
 
 
421 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  27.84 
 
 
402 aa  71.2  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0474  integrase family protein  22.19 
 
 
442 aa  70.9  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  28.16 
 
 
415 aa  70.1  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  24.07 
 
 
451 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3295  hypothetical protein  29.02 
 
 
255 aa  68.9  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.435139 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  28.27 
 
 
376 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  28.27 
 
 
376 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  28.27 
 
 
376 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  23.6 
 
 
397 aa  68.2  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0686  integrase family protein  22.46 
 
 
472 aa  67.4  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  29.17 
 
 
381 aa  67.4  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  24.07 
 
 
456 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  28.27 
 
 
376 aa  67  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  28.23 
 
 
420 aa  67  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  23.24 
 
 
411 aa  67  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  23.7 
 
 
444 aa  67  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  25.96 
 
 
388 aa  66.6  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  29.45 
 
 
367 aa  67  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  23.65 
 
 
451 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  23.91 
 
 
413 aa  63.9  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  25.18 
 
 
451 aa  63.9  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2529  phage integrase  26.2 
 
 
375 aa  63.9  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153189  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  23.7 
 
 
451 aa  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0094  Phage integrase  22.45 
 
 
449 aa  62  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000297047  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  25.49 
 
 
425 aa  62  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  27.49 
 
 
398 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  23.61 
 
 
300 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  26.32 
 
 
400 aa  60.5  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3461  integrase family protein  21.6 
 
 
435 aa  60.1  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538189  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  31.21 
 
 
286 aa  59.7  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1905  hypothetical protein  30.57 
 
 
366 aa  59.3  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.397006  hitchhiker  0.00000424663 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3340  phage integrase family protein  22.84 
 
 
452 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.58116  normal  0.0453376 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  25.58 
 
 
406 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2682  integrase family protein  26.35 
 
 
193 aa  58.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  25 
 
 
361 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  21.99 
 
 
413 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  29.71 
 
 
429 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0318  hypothetical protein  23.68 
 
 
515 aa  58.2  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  25.71 
 
 
432 aa  57.8  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  23.95 
 
 
432 aa  57.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  30.53 
 
 
291 aa  57.4  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  23.32 
 
 
467 aa  57  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0710  Integrase protein  27.65 
 
 
343 aa  56.2  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1297  phage integrase family protein  30.88 
 
 
295 aa  56.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2526  Phage integrase  28.25 
 
 
481 aa  55.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000237436  normal  0.0434699 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2717  Phage integrase  26.11 
 
 
479 aa  55.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  24.66 
 
 
275 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0574  integrase family protein  30.88 
 
 
295 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0949  phage integrase family protein  25 
 
 
275 aa  55.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.427827  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  23.93 
 
 
404 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  26.7 
 
 
440 aa  54.7  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  31.41 
 
 
159 aa  54.7  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4274  phage integrase  30.2 
 
 
407 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3853  integrase family protein  30.26 
 
 
500 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  22.17 
 
 
443 aa  54.7  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  25.53 
 
 
401 aa  55.1  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4935  putative phage-like integrase  29.69 
 
 
434 aa  54.3  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3867  phage integrase  23.2 
 
 
400 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  23.08 
 
 
410 aa  53.9  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  28.63 
 
 
414 aa  53.9  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  23.97 
 
 
426 aa  53.5  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  29.29 
 
 
404 aa  53.5  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>