More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7820 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  77.75 
 
 		 452 aa  717    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  100 
 
 		 451 aa  917    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  79.37 
 
 		 452 aa  739    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  74.44 
 
 		 451 aa  701    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  77.63 
 
 		 451 aa  726    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  51.96 
 
 		 432 aa  432  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  47.94 
 
 		 429 aa  351  2e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  41.77 
 
 		 420 aa  298  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  35.05 
 
 		 463 aa  239  8e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3752  phage integrase family protein  36.65 
 
 		 422 aa  233  5e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.538338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  34.9 
 
 		 384 aa  216  5.9999999999999996e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  33.91 
 
 		 384 aa  212  9e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  34.7 
 
 		 393 aa  198  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  33.33 
 
 		 430 aa  197  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  33.96 
 
 		 397 aa  187  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  30.92 
 
 		 411 aa  177  5e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  30.86 
 
 		 434 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3853  integrase family protein  30.09 
 
 		 500 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  29.34 
 
 		 467 aa  150  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  29.38 
 
 		 400 aa  147  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  27.56 
 
 		 444 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  27.49 
 
 		 388 aa  141  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2401  phage integrase  34.06 
 
 		 242 aa  132  9e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340015  normal  0.0277032 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1236  phage integrase  28.64 
 
 		 399 aa  131  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449507  normal  0.10874 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  28.91 
 
 		 400 aa  129  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  28.26 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  27.95 
 
 		 400 aa  127  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  27.95 
 
 		 400 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3747  integrase  27.91 
 
 		 399 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  27.23 
 
 		 401 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  27.36 
 
 		 399 aa  120  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3540  integrase family protein  28.85 
 
 		 399 aa  116  8.999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2601  integrase family protein  28.19 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2745  integrase family protein  28.19 
 
 		 415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.99512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3045  phage integrase  28.19 
 
 		 415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0497  integrase family protein  28.64 
 
 		 412 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  25.85 
 
 		 376 aa  113  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  27.32 
 
 		 410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  27.01 
 
 		 451 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  26.96 
 
 		 451 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  25 
 
 		 376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  25.6 
 
 		 376 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  25.6 
 
 		 376 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  26.72 
 
 		 451 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  26.23 
 
 		 456 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  28.99 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  29.57 
 
 		 424 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2625  phage integrase family protein  25.43 
 
 		 400 aa  105  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  28.06 
 
 		 402 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1865  integrase family protein  25.3 
 
 		 401 aa  104  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.94549  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31280  putative integrase  25.3 
 
 		 401 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000488668  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3954  hypothetical protein  74.24 
 
 		 79 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  24.87 
 
 		 412 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  23.98 
 
 		 482 aa  100  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  25.46 
 
 		 387 aa  99.8  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  26.07 
 
 		 417 aa  97.1  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  24.43 
 
 		 396 aa  96.3  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0807  integrase protein  36.65 
 
 		 181 aa  95.9  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2399  hypothetical protein  44.54 
 
 		 137 aa  95.5  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229698  normal  0.0250128 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2136  phage integrase family protein  25.71 
 
 		 389 aa  93.6  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0404563  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  26.85 
 
 		 337 aa  91.7  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  22.9 
 
 		 379 aa  90.9  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3493  integrase family protein  26.02 
 
 		 409 aa  90.1  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.247982  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1370  phage integrase  24.65 
 
 		 423 aa  89  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000628694  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  26.42 
 
 		 417 aa  88.6  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5073  hypothetical protein  36.88 
 
 		 159 aa  88.6  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2460  integrase family protein  28.98 
 
 		 415 aa  87  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  25.72 
 
 		 439 aa  86.3  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  25.89 
 
 		 412 aa  85.9  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  24.75 
 
 		 403 aa  85.5  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0919  integrase family protein  26.05 
 
 		 448 aa  84.7  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.295922  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  28.57 
 
 		 420 aa  84.3  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  26.6 
 
 		 426 aa  84.3  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  25.58 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  29.12 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2351  phage integrase  23.99 
 
 		 452 aa  83.2  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0439669  hitchhiker  0.00873644 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  24.49 
 
 		 449 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3867  phage integrase  26.29 
 
 		 400 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  27.05 
 
 		 413 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1272  phage integrase family protein  25.58 
 
 		 425 aa  78.6  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000707551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  25.24 
 
 		 443 aa  77  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1085  hypothetical protein  26.58 
 
 		 413 aa  76.3  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  25.45 
 
 		 404 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  24.48 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  24.59 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  24.35 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1118  integrase family protein  28.82 
 
 		 384 aa  73.9  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.868732  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3498  integrase family protein  24.73 
 
 		 486 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  23.45 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  23.19 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  30.7 
 
 		 395 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  25.12 
 
 		 433 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  23.24 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  28.15 
 
 		 334 aa  72  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  23.75 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  24.67 
 
 		 413 aa  72  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3540  phage integrase family protein  23.92 
 
 		 420 aa  72  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.216413  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0094  Phage integrase  23.17 
 
 		 449 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000297047  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  24.06 
 
 		 395 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1262  integrase family protein  24.66 
 
 		 418 aa  72  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>