More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0255 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  100 
 
 		 430 aa  865    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  53.01 
 
 		 463 aa  441  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3853  integrase family protein  41.87 
 
 		 500 aa  287  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  37.56 
 
 		 432 aa  229  5e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  35.99 
 
 		 452 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  34.87 
 
 		 451 aa  219  7e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  34.55 
 
 		 452 aa  216  8e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  36.21 
 
 		 429 aa  211  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  32.6 
 
 		 451 aa  204  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  33.33 
 
 		 451 aa  203  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  38.11 
 
 		 420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  32.71 
 
 		 434 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  31.59 
 
 		 384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  31.59 
 
 		 384 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  33.09 
 
 		 388 aa  171  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3752  phage integrase family protein  31.4 
 
 		 422 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.538338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  32.39 
 
 		 411 aa  160  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  29.37 
 
 		 393 aa  152  8.999999999999999e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  31.53 
 
 		 400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  31.6 
 
 		 397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  27.47 
 
 		 444 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  27.44 
 
 		 467 aa  127  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  27.03 
 
 		 400 aa  123  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  25.85 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  26.81 
 
 		 376 aa  120  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  26.57 
 
 		 376 aa  119  9e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  26.81 
 
 		 376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  26.81 
 
 		 376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3747  integrase  26.39 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  28.5 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  26.27 
 
 		 400 aa  115  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  28.5 
 
 		 451 aa  113  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  28.5 
 
 		 451 aa  113  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  25.83 
 
 		 402 aa  112  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  26.86 
 
 		 451 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2401  phage integrase  32.55 
 
 		 242 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340015  normal  0.0277032 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1236  phage integrase  26.32 
 
 		 399 aa  111  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449507  normal  0.10874 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  24.94 
 
 		 400 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  26.99 
 
 		 401 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  24.94 
 
 		 400 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  27.78 
 
 		 456 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3540  integrase family protein  27.07 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2745  integrase family protein  27.09 
 
 		 415 aa  107  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.99512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3045  phage integrase  27.09 
 
 		 415 aa  107  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2601  integrase family protein  27.07 
 
 		 399 aa  107  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1865  integrase family protein  26.14 
 
 		 401 aa  97.8  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.94549  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31280  putative integrase  26.14 
 
 		 401 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000488668  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0497  integrase family protein  26.63 
 
 		 412 aa  97.4  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2625  phage integrase family protein  25.36 
 
 		 400 aa  94  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  25.93 
 
 		 417 aa  92.4  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  25.23 
 
 		 412 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  24.87 
 
 		 412 aa  90.1  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  27.65 
 
 		 404 aa  90.5  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  26.69 
 
 		 396 aa  89.7  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  23.04 
 
 		 379 aa  89.7  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  24.88 
 
 		 406 aa  88.6  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  24.13 
 
 		 482 aa  89  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  24.77 
 
 		 404 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  24.94 
 
 		 415 aa  86.7  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  24.48 
 
 		 427 aa  86.3  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  26.85 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  27.81 
 
 		 367 aa  84.7  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  23.25 
 
 		 413 aa  83.6  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.28 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.28 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  30.51 
 
 		 397 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  24.25 
 
 		 414 aa  82.8  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2460  integrase family protein  29.79 
 
 		 415 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  28 
 
 		 381 aa  82.8  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.93 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.93 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.23 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.93 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  24.48 
 
 		 414 aa  81.3  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.87 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  30.07 
 
 		 397 aa  81.6  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.23 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.58 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  26.06 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0089  phage integrase family protein  30.2 
 
 		 400 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  23.06 
 
 		 421 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  24.26 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3669  prophage CP4-like integrase  26.49 
 
 		 462 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18314  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.23 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  24.84 
 
 		 439 aa  77  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  29.36 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  25.45 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  30.5 
 
 		 372 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  27.46 
 
 		 353 aa  75.1  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  29.33 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  24.24 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.82 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.7 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1272  phage integrase family protein  25.39 
 
 		 425 aa  74.3  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000707551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  30.88 
 
 		 334 aa  73.9  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  26.95 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  26.55 
 
 		 413 aa  73.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  30.58 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  28.83 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  23.83 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>