More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1633 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  100 
 
 
368 aa  760    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  28.53 
 
 
372 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  27.08 
 
 
407 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  26.07 
 
 
379 aa  124  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2954  integrase family protein  27.92 
 
 
409 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  28.73 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  25.32 
 
 
397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0241  Phage integrase  27.55 
 
 
377 aa  113  6e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  28.13 
 
 
402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0930  site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.63 
 
 
385 aa  106  8e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  24.37 
 
 
415 aa  106  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2865  site-specific recombinase XerD-like  25.91 
 
 
417 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.11888  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2427  phage integrase family protein  25.09 
 
 
414 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  24.57 
 
 
381 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  27.8 
 
 
396 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  27.48 
 
 
482 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  24.43 
 
 
359 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  25 
 
 
351 aa  97.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  28.22 
 
 
337 aa  96.7  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  25 
 
 
351 aa  96.3  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  24.55 
 
 
347 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  24.55 
 
 
347 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0089  phage integrase family protein  25.6 
 
 
400 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  24.73 
 
 
392 aa  93.2  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  31.79 
 
 
337 aa  92.8  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  24.66 
 
 
397 aa  92.4  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  25.72 
 
 
385 aa  90.9  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  24.43 
 
 
398 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  25 
 
 
412 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  30.63 
 
 
421 aa  87.8  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  24.94 
 
 
401 aa  87.8  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  28.69 
 
 
251 aa  87.8  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  28.93 
 
 
367 aa  87  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3047  phage integrase  27.69 
 
 
381 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.182322  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0382  putative site-specific integrase/recombinase  29.86 
 
 
204 aa  84  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  23.38 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  24.57 
 
 
412 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  26.76 
 
 
381 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  23.43 
 
 
411 aa  83.6  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53570  putative integrase  25.88 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000326616  decreased coverage  0.0000890956 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  28.4 
 
 
334 aa  83.2  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  26.47 
 
 
386 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2564  phage integrase family protein  23.32 
 
 
417 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.326638  hitchhiker  0.000921348 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1465  integrase family protein  23.32 
 
 
334 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.890522 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  23.18 
 
 
429 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  24.1 
 
 
404 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1527  integrase family protein  23.84 
 
 
357 aa  81.6  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.115316 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  26.69 
 
 
381 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  23.31 
 
 
397 aa  81.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  27.78 
 
 
353 aa  80.9  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  25.35 
 
 
380 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  26.28 
 
 
356 aa  80.5  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  22.63 
 
 
414 aa  80.5  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  25.98 
 
 
381 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  25.47 
 
 
390 aa  79.7  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0447  phage integrase  28.46 
 
 
381 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0926  phage integrase family protein  28.46 
 
 
381 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  28.8 
 
 
270 aa  79  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0633  phage integrase family protein  24.65 
 
 
333 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.191689  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5364  integrase  28.44 
 
 
332 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  27.65 
 
 
338 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48880  putative bacteriophage integrase  31.5 
 
 
338 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000942528  hitchhiker  0.000000101575 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  21.83 
 
 
377 aa  79  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  21.24 
 
 
380 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  27.06 
 
 
413 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  27.31 
 
 
282 aa  77.4  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1208  phage integrase  28.73 
 
 
476 aa  77.4  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  25.77 
 
 
384 aa  77.8  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  24.69 
 
 
347 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  24.16 
 
 
390 aa  77  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  24.83 
 
 
374 aa  77  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04371  hypothetical protein  28.11 
 
 
321 aa  77  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  24.53 
 
 
387 aa  76.3  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0669  phage integrase family protein  32.94 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  24.84 
 
 
393 aa  76.3  0.0000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  24.91 
 
 
354 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  24.91 
 
 
354 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  24.53 
 
 
387 aa  76.3  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  24.9 
 
 
378 aa  75.9  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  23.63 
 
 
374 aa  75.5  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  27.53 
 
 
284 aa  75.1  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  30.86 
 
 
384 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  21.31 
 
 
365 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  25.26 
 
 
304 aa  74.7  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  23.53 
 
 
387 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2157  phage integrase  28.42 
 
 
363 aa  74.3  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0421336  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  28.48 
 
 
159 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  26.95 
 
 
430 aa  73.9  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  27.44 
 
 
362 aa  73.9  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  27.35 
 
 
339 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2932  integrase family protein  30.89 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  27.71 
 
 
172 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  24.55 
 
 
393 aa  73.9  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4828  phage integrase  24.83 
 
 
433 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  22.68 
 
 
377 aa  73.2  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0900  phage integrase family site specific recombinase  29.41 
 
 
334 aa  72.8  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.198351  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  22.95 
 
 
374 aa  72.8  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0636  phage integrase family site specific recombinase  30.27 
 
 
308 aa  72.4  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1571  site-specific integrase/recombinase  22.19 
 
 
381 aa  72.8  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  28.93 
 
 
387 aa  72  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>