More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0633 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0633  phage integrase family protein  100 
 
 		 333 aa  680    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.191689  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0021  phage integrase family protein  49.04 
 
 		 324 aa  301  9e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.135699  hitchhiker  0.00129232 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0036  integrase family protein  48.73 
 
 		 324 aa  301  1e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.95657  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0110  integrase family protein  47.6 
 
 		 324 aa  294  1e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126491  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0436  integrase family protein  43.56 
 
 		 323 aa  260  2e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.788545  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0135  integrase family protein  42.54 
 
 		 322 aa  255  8e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0689406  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1647  phage integrase family protein  43.12 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0765801  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1508  phage integrase family protein  43.95 
 
 		 322 aa  246  3e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000321752 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0418  integrase family protein  43.61 
 
 		 328 aa  246  6e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0307048  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1634  phage integrase family protein  41.54 
 
 		 322 aa  241  1e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00686439  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1842  integrase family protein  41.95 
 
 		 340 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00549349  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0060  phage integrase family protein  41.95 
 
 		 340 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.106477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0262  phage integrase family protein  39.51 
 
 		 326 aa  223  3e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0634  phage integrase family protein  39.73 
 
 		 321 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.650036  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1225  phage integrase family protein  35.13 
 
 		 324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009136  MmarC5_1846  putative integrase/recombinase  37.71 
 
 		 304 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1484  phage integrase family protein  33.23 
 
 		 341 aa  173  5e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.269781  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0630  phage integrase family protein  34.2 
 
 		 347 aa  170  4e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.7962  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1179  phage integrase family protein  32.69 
 
 		 398 aa  154  1e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0294292  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0261  putative integrase/recombinase  97.83 
 
 		 46 aa  94  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  27.6 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 304 aa  85.5  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  25 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  25 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  25 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  25 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  26.72 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  24.57 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1682  integron integrase  27.24 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  28.15 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  24.41 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3360  integron integrase  26.93 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00956  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.35 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2132  integron integrase  26.23 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290373 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2037  phage integrase family site specific recombinase  26.01 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  24.81 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  26.81 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004441  site-specific recombinase XerD  26.35 
 
 		 305 aa  79  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  25.97 
 
 		 309 aa  79  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  29.17 
 
 		 300 aa  79  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  24.65 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  25.71 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1720  integron integrase  26.93 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.945826  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  27.21 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.1 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  25.67 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.46 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3661  integrase family protein  25.73 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.311976  decreased coverage  0.00000149049 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.46 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.46 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3629  integrase family protein  25.73 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.46 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.07 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  26.79 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.07 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.46 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  25.18 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  29.34 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0222  integrase/recombinase XerC  23.99 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  27.68 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  29.39 
 
 		 295 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  26.02 
 
 		 292 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.11 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0421  integrase family protein  24.34 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.56 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.11 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.94 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.11 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  26.75 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  26.43 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2022  tyrosine recombinase XerD subunit  26.87 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  25.29 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  26.29 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2692  tyrosine recombinase XerD  25.91 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.457784  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  27.04 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0577  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.89 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0855221  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.76 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.2 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  26.2 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.2 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0815  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.2 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.624778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.2 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  26.2 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0319  tyrosine recombinase XerD  28.31 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.944891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.2 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.2 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  28.42 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.2 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  25.09 
 
 		 314 aa  72.8  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0569  integrase family protein  30.27 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0286562 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003169  integron integrase IntI4  30.53 
 
 		 320 aa  72.8  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2440  tyrosine recombinase XerD  25.53 
 
 		 332 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  31.95 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  24.67 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2169  tyrosine recombinase XerD  25.09 
 
 		 298 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0292  tyrosine recombinase XerD  28.31 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  32.14 
 
 		 295 aa  72.4  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  31.4 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  26.72 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0611  integrase family protein  22.56 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>