More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1484 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1484  phage integrase family protein  100 
 
 		 341 aa  704    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.269781  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0036  integrase family protein  35.78 
 
 		 324 aa  200  3e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.95657  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0021  phage integrase family protein  34.82 
 
 		 324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.135699  hitchhiker  0.00129232 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0110  integrase family protein  34.5 
 
 		 324 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126491  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0633  phage integrase family protein  33.23 
 
 		 333 aa  173  5e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.191689  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1634  phage integrase family protein  32.14 
 
 		 322 aa  169  7e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00686439  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0418  integrase family protein  33.96 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0307048  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0135  integrase family protein  31.85 
 
 		 322 aa  165  9e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0689406  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1647  phage integrase family protein  33.53 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0765801  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1508  phage integrase family protein  31.63 
 
 		 322 aa  151  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000321752 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0060  phage integrase family protein  31.11 
 
 		 340 aa  149  6e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.106477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0262  phage integrase family protein  31.82 
 
 		 326 aa  149  6e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1842  integrase family protein  31.11 
 
 		 340 aa  149  6e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00549349  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0436  integrase family protein  32.51 
 
 		 323 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.788545  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0634  phage integrase family protein  31.04 
 
 		 321 aa  146  5e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.650036  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1225  phage integrase family protein  28.71 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0630  phage integrase family protein  31.29 
 
 		 347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.7962  n/a   
 
 
-
 
NC_009136  MmarC5_1846  putative integrase/recombinase  29.39 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1179  phage integrase family protein  29.88 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0294292  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5294  integrase family protein  34 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0370  phage integrase family protein  25.17 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3360  integron integrase  23.26 
 
 		 319 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1682  integron integrase  23.26 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  28.41 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1720  integron integrase  23.26 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.945826  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4897  integrase family protein  23.75 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2037  phage integrase family site specific recombinase  23.88 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2124  phage integrase family protein  24.72 
 
 		 301 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.308322  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  32.47 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  29.28 
 
 		 367 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2585  integrase family protein  24.43 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4728  integrase family protein  24.43 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2670  integrase family protein  24.43 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3066  integrase family protein  26.42 
 
 		 390 aa  66.2  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0221886  normal  0.652565 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0143  integrase IntI1 for transposon Tn21  22.53 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  25.63 
 
 		 305 aa  65.9  0.000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  24.68 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0120  integrase/recombinase  22.53 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.400978 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0067  integrase/recombinase  22.53 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.325485 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5541  integrase family protein  23.92 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0614894 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2132  integron integrase  22.84 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290373 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  27.39 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0011  phage integrase family protein  25.25 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  26.43 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5342  integrase/recombinase  21.84 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  31.07 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  30.34 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0907  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.28 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1148  phage integrase family site specific recombinase  23.24 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0281308  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2512  tyrosine recombinase XerD  22.59 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234856 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  28.73 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2844  integrase family protein  24.74 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2735  tyrosine recombinase XerD  22.3 
 
 		 328 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.206607 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3458  tyrosine recombinase XerD  28.39 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0323  phage integrase family site specific recombinase  25.2 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.158931  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0386  phage integrase family site specific recombinase  28.57 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  29.45 
 
 		 482 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  26.78 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0235  integrase domain protein SAM domain protein  22.32 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1465  integrase family protein  30.19 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.890522 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1807  integrase family protein  31.16 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.73649  hitchhiker  0.0000891918 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2484  phage integrase  26.95 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72317  normal  0.0269236 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2440  tyrosine recombinase XerD  22.59 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0585  integrase family protein  28.19 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  29.38 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3398  integrase  25.4 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.292469  normal  0.438437 
 
 
-
 
NC_004310  BR2031  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.72 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1953  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.72 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  26.46 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  29.19 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  29.38 
 
 		 402 aa  59.3  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  28.49 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  24.18 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5577  phage integrase  26.78 
 
 		 344 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1799  integron integrase  22.7 
 
 		 462 aa  58.9  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.174616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5980  phage integrase family protein  26.78 
 
 		 364 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1704  phage integrase family protein  26.78 
 
 		 364 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.91638 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  30.52 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  28.49 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  27.74 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3654  Phage integrase  26.62 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000207497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6461  phage integrase family protein  27.39 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624578 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  30.5 
 
 		 396 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0978  phage integrase family protein  22.66 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  28.76 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1554  integrase family protein  25.98 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.86595  decreased coverage  0.00111318 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  27.45 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0768  integrase family protein  20.54 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000101801 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.38 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0569  integrase family protein  27.52 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0286562 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.48 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  29.24 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  26.6 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  25.84 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0631  phage integrase family site specific recombinase  26.18 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  26.99 
 
 		 295 aa  57  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0993  phage integrase family protein  24.26 
 
 		 400 aa  57  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0264  site-specific tyrosine recombinase XerC  23 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1209  phage integrase family site specific recombinase  29.52 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.764611  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0636  phage integrase family site specific recombinase  26.18 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>