More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5541 on replicon NC_011737
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011737  PCC7424_5541  integrase family protein  100 
 
 		 329 aa  680    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0614894 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4550  integrase family protein  54.81 
 
 		 362 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.798479 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4572  integrase family protein  52.73 
 
 		 373 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0229  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  33.44 
 
 		 362 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0287  integrase domain protein SAM domain protein  33.12 
 
 		 362 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3696  integrase domain protein SAM domain protein  33.77 
 
 		 337 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.851802  normal  0.785312 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0404  integrase family protein  29.62 
 
 		 320 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000863146  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  29.41 
 
 		 295 aa  116  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  33.22 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  28.95 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  28 
 
 		 328 aa  102  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4760  integrase family protein  27.99 
 
 		 354 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  29.93 
 
 		 305 aa  102  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  29.35 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.86 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  31.08 
 
 		 294 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  31.07 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.79 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2022  tyrosine recombinase XerD subunit  31.03 
 
 		 309 aa  99.4  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  25.93 
 
 		 300 aa  99.4  8e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  26.98 
 
 		 296 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  28.33 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  27.95 
 
 		 294 aa  98.2  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1117  phage integrase  28.67 
 
 		 369 aa  98.2  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.343038  decreased coverage  0.00190839 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  26.74 
 
 		 297 aa  98.2  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2492  integrase family protein  29.29 
 
 		 332 aa  97.4  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2347  phage integrase family protein  28.76 
 
 		 332 aa  97.1  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.01871 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  30.14 
 
 		 302 aa  97.1  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5117  tyrosine recombinase XerD  31.06 
 
 		 327 aa  96.7  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.46 
 
 		 299 aa  95.9  8e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.41 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  31.42 
 
 		 293 aa  95.5  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  30.54 
 
 		 310 aa  94.7  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0924  phage integrase family protein  28.52 
 
 		 294 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.852644  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  26.19 
 
 		 295 aa  94.7  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  28.52 
 
 		 283 aa  94  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2739  integrase/recombinase XerD  30.94 
 
 		 321 aa  94  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.76 
 
 		 296 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.76 
 
 		 296 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.69 
 
 		 330 aa  93.6  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  32.05 
 
 		 310 aa  93.6  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1478  integrase/recombinase XerD  30.58 
 
 		 298 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0755097  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.57 
 
 		 298 aa  92.8  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02665  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.91 
 
 		 336 aa  92.8  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0750  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.47 
 
 		 311 aa  92.8  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.43 
 
 		 302 aa  92.4  9e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3312  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.92 
 
 		 298 aa  92.4  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.75 
 
 		 296 aa  92.4  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1189  integrase family protein  27.91 
 
 		 297 aa  92.4  9e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203109  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  25.25 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  30.07 
 
 		 307 aa  92  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1286  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.22 
 
 		 298 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0511461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  30.67 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0562  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.81 
 
 		 300 aa  91.7  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0726  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.91 
 
 		 333 aa  92.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218987  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1481  phage integrase family protein  30.1 
 
 		 311 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0281722  normal  0.205606 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2391  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.77 
 
 		 311 aa  91.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.42 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.42 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0626  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.4 
 
 		 315 aa  91.7  2e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.42 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  29.25 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  28.95 
 
 		 311 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3738  tyrosine recombinase XerD subunit  27.59 
 
 		 328 aa  91.3  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  25.99 
 
 		 302 aa  91.3  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.42 
 
 		 296 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.42 
 
 		 296 aa  90.9  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.42 
 
 		 296 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.42 
 
 		 296 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  26.28 
 
 		 310 aa  90.5  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0519  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.19 
 
 		 302 aa  90.9  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0998774  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.42 
 
 		 296 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  31.08 
 
 		 293 aa  90.9  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  29.74 
 
 		 307 aa  90.5  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  26.49 
 
 		 295 aa  90.5  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  26.49 
 
 		 295 aa  90.5  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  26.74 
 
 		 295 aa  90.1  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3012  tyrosine recombinase XerD subunit  32.63 
 
 		 295 aa  90.1  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146868  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00307  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.52 
 
 		 313 aa  90.5  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0747  tyrosine recombinase XerD  28.62 
 
 		 303 aa  90.1  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000635712  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.75 
 
 		 311 aa  89.7  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  25.85 
 
 		 296 aa  89.7  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  27.63 
 
 		 295 aa  89.4  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5625  integrase family protein  30.88 
 
 		 273 aa  89.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  23.95 
 
 		 301 aa  89.4  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1432  tyrosine recombinase XerD  31.78 
 
 		 321 aa  89.7  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0895087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  26.37 
 
 		 299 aa  89.7  7e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  29.8 
 
 		 315 aa  89.4  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2178  phage integrase family protein  28.1 
 
 		 303 aa  89.4  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  27.15 
 
 		 307 aa  89.4  8e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0861  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.83 
 
 		 299 aa  89  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2012  Phage integrase  29.75 
 
 		 329 aa  89  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  27.31 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  28.37 
 
 		 303 aa  88.6  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  26 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0903  tyrosine recombinase XerD  32.14 
 
 		 303 aa  88.2  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0815  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.15 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.624778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3426  tyrosine recombinase XerD  29.21 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0023  integrase family protein  27.64 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0988  tyrosine recombinase XerD  32.14 
 
 		 303 aa  88.2  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252447  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>