More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_4550 on replicon NC_011723
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011723  PCC8801_4550  integrase family protein  100 
 
 
362 aa  739    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal  0.798479 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4572  integrase family protein  55.8 
 
 
373 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5541  integrase family protein  54.81 
 
 
329 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0614894 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0229  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  32.58 
 
 
362 aa  169  7e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0287  integrase domain protein SAM domain protein  32.29 
 
 
362 aa  169  9e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3696  integrase domain protein SAM domain protein  32.1 
 
 
337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.851802  normal  0.785312 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  25.53 
 
 
300 aa  107  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  28.44 
 
 
305 aa  107  4e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  29.97 
 
 
309 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  29.31 
 
 
307 aa  102  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  29 
 
 
307 aa  100  5e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  29.38 
 
 
309 aa  99.8  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  29.25 
 
 
302 aa  99  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  30.28 
 
 
294 aa  97.8  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  27.58 
 
 
307 aa  97.4  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  29.65 
 
 
313 aa  97.8  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  28.4 
 
 
294 aa  97.1  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  28.66 
 
 
295 aa  97.1  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0404  integrase family protein  26.75 
 
 
320 aa  97.1  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000863146  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  27.74 
 
 
302 aa  96.3  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  26.27 
 
 
297 aa  95.5  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  28.1 
 
 
294 aa  94.4  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  29.17 
 
 
300 aa  94  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4760  integrase family protein  25.16 
 
 
354 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2276  tyrosine recombinase XerD  30.35 
 
 
301 aa  92.4  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235275  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  27.93 
 
 
293 aa  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  23.01 
 
 
295 aa  91.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.55 
 
 
298 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.49 
 
 
298 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4646  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  27.69 
 
 
317 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.14 
 
 
298 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00307  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.38 
 
 
313 aa  88.2  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  27.63 
 
 
293 aa  88.6  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  26.22 
 
 
295 aa  88.2  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  27.64 
 
 
308 aa  88.6  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2492  integrase family protein  29.26 
 
 
332 aa  88.2  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2178  phage integrase family protein  28.3 
 
 
303 aa  88.2  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5625  integrase family protein  28.12 
 
 
273 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.36 
 
 
298 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0519  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.4 
 
 
302 aa  87  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0998774  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  29.36 
 
 
307 aa  87  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2022  tyrosine recombinase XerD subunit  26.98 
 
 
309 aa  86.7  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  26.38 
 
 
310 aa  86.7  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  25 
 
 
284 aa  86.7  7e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5613  hypothetical protein  28.43 
 
 
273 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1117  phage integrase  27.05 
 
 
369 aa  85.9  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.343038  decreased coverage  0.00190839 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.38 
 
 
298 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3312  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.63 
 
 
298 aa  85.1  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  27.84 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  28.21 
 
 
342 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.38 
 
 
298 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2391  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.05 
 
 
311 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0924  phage integrase family protein  26.21 
 
 
294 aa  84  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.852644  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  27.58 
 
 
343 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  23.2 
 
 
299 aa  84  0.000000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2347  phage integrase family protein  27.86 
 
 
332 aa  84  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.01871 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  27.58 
 
 
343 aa  83.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1554  integrase family protein  27.24 
 
 
339 aa  83.6  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.86595  decreased coverage  0.00111318 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1073  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.38 
 
 
298 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344511  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3300  tyrosine recombinase XerD  26.16 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.36 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.01 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  24.78 
 
 
295 aa  82.8  0.000000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  27.08 
 
 
302 aa  82.8  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0577  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.22 
 
 
305 aa  82.8  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0855221  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  26.03 
 
 
277 aa  82  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0747  tyrosine recombinase XerD  26.58 
 
 
303 aa  82  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000635712  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0815  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.98 
 
 
298 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.624778  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.98 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  25.98 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  25.98 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.98 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.92 
 
 
322 aa  81.6  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1286  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.41 
 
 
298 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0511461  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  28.18 
 
 
302 aa  81.6  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.98 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.98 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.98 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.32 
 
 
328 aa  82  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  25.62 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  27.3 
 
 
303 aa  82  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.98 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.92 
 
 
299 aa  81.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.4 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  25.76 
 
 
313 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.92 
 
 
299 aa  81.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  26.22 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  23.12 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3847  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.92 
 
 
299 aa  81.3  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.349121 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.33 
 
 
311 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  30.09 
 
 
346 aa  81.3  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3796  phage integrase family protein  29.3 
 
 
304 aa  80.9  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3275  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.98 
 
 
298 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004441  site-specific recombinase XerD  24.35 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  25.97 
 
 
300 aa  80.5  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1428  phage integrase  27.3 
 
 
317 aa  80.5  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.473602  normal  0.0585003 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  23.85 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3380  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.98 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4151  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.69 
 
 
298 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3200  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.98 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>