More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0626 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0626  site-specific tyrosine recombinase XerC  100 
 
 
315 aa  654    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  42.04 
 
 
302 aa  245  6e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  38.93 
 
 
290 aa  216  4e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  39.37 
 
 
332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  38.22 
 
 
342 aa  209  6e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  37.95 
 
 
294 aa  208  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  38.51 
 
 
311 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  37.29 
 
 
294 aa  205  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  38.39 
 
 
343 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  37.29 
 
 
310 aa  204  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  38.39 
 
 
343 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  34.54 
 
 
295 aa  199  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  37.62 
 
 
293 aa  199  5e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  37.78 
 
 
293 aa  199  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  33.55 
 
 
313 aa  199  7e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  38.06 
 
 
302 aa  198  9e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  38.06 
 
 
301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  34.74 
 
 
305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1432  tyrosine recombinase XerD  35.31 
 
 
321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0895087  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  35.18 
 
 
302 aa  196  5.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  35.5 
 
 
302 aa  196  6e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  34.43 
 
 
306 aa  195  9e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  33.99 
 
 
301 aa  195  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  35.53 
 
 
309 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  37.17 
 
 
298 aa  193  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  36.1 
 
 
294 aa  193  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  34.21 
 
 
295 aa  193  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2739  integrase/recombinase XerD  33.97 
 
 
321 aa  193  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  34.85 
 
 
302 aa  193  3e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  37.67 
 
 
298 aa  193  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  35.18 
 
 
302 aa  192  5e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  35.51 
 
 
317 aa  192  5e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  36.42 
 
 
307 aa  191  1e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  36.1 
 
 
307 aa  191  1e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  36.42 
 
 
307 aa  191  1e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  37.25 
 
 
298 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  33.99 
 
 
312 aa  191  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  35.28 
 
 
309 aa  189  4e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  35.74 
 
 
295 aa  189  4e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  34.43 
 
 
308 aa  189  5e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  35.05 
 
 
317 aa  188  8e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  35.86 
 
 
294 aa  188  8e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  33.22 
 
 
296 aa  188  8e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  38.21 
 
 
299 aa  188  1e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0359  tyrosine recombinase XerD  38.62 
 
 
290 aa  188  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00723526 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  37.01 
 
 
304 aa  188  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1659  tyrosine recombinase XerD  37.05 
 
 
254 aa  187  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  36.55 
 
 
295 aa  187  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  36.55 
 
 
295 aa  187  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  33.99 
 
 
291 aa  187  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  32.69 
 
 
308 aa  185  8e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  33.55 
 
 
300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  34.24 
 
 
308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  33.44 
 
 
296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  32.37 
 
 
295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  33.01 
 
 
296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.19 
 
 
298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0117  tyrosine recombinase XerC  36.83 
 
 
316 aa  183  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  36 
 
 
295 aa  183  3e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0651  tyrosine recombinase XerD  33.11 
 
 
297 aa  183  3e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0950079  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  33.22 
 
 
292 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  31.37 
 
 
302 aa  182  6e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  33.44 
 
 
304 aa  182  7e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  33.44 
 
 
296 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1299  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.32 
 
 
291 aa  182  9.000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  33.76 
 
 
295 aa  181  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  34.21 
 
 
298 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6023  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.16 
 
 
303 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09860  tyrosine recombinase XerC subunit  32.36 
 
 
329 aa  180  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  37.55 
 
 
306 aa  181  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.87 
 
 
303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.279091  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4009  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.87 
 
 
303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  33.55 
 
 
300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0543  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.87 
 
 
303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2127  tyrosine recombinase XerD  33.22 
 
 
308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.57 
 
 
296 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.57 
 
 
296 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.57 
 
 
296 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.57 
 
 
296 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.57 
 
 
296 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0562  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 
300 aa  179  7e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  33.44 
 
 
304 aa  179  7e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03687  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.67 
 
 
298 aa  179  8e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.446663  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4168  tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 
298 aa  179  8e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4271  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 
298 aa  179  8e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 
298 aa  179  8e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0208532 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69710  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.16 
 
 
303 aa  178  8e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.737312  normal  0.478185 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03636  hypothetical protein  32.67 
 
 
298 aa  179  8e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.487194  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  38.31 
 
 
304 aa  179  8e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4196  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 
298 aa  179  8e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0689633  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4036  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 
298 aa  179  8e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4330  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 
298 aa  178  9e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4229  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.67 
 
 
300 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3200  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.31 
 
 
298 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.31 
 
 
298 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3981  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.23 
 
 
300 aa  178  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.105897  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4159  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.67 
 
 
300 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.937296  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5250  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.34 
 
 
298 aa  178  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3380  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.31 
 
 
298 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4277  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.67 
 
 
300 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>