More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_pSN254_0143 on replicon NC_009140
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009140  SNSL254_pSN254_0143  integrase IntI1 for transposon Tn21  100 
 
 		 337 aa  684    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0120  integrase/recombinase  99.7 
 
 		 337 aa  681    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.400978 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0067  integrase/recombinase  99.7 
 
 		 337 aa  681    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.325485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5342  integrase/recombinase  97.92 
 
 		 337 aa  670    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3366  integron integrase  60.44 
 
 		 332 aa  369  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.341619 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2714  integron integrase  60.44 
 
 		 332 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3006  integron integrase  57.14 
 
 		 334 aa  359  3e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.976928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3427  integron integrase  55.08 
 
 		 327 aa  358  6e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0410  integron integrase  55.8 
 
 		 334 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.761535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0696  phage integrase  59.31 
 
 		 338 aa  348  7e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2249  putative transcriptional regulator, TetR family  54.11 
 
 		 325 aa  348  7e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1215  integron integrase  57.28 
 
 		 326 aa  345  6e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2703  integron integrase  54.09 
 
 		 323 aa  332  7.000000000000001e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0039  integrase/recombinase  100 
 
 		 159 aa  326  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0977  integron integrase  52.32 
 
 		 329 aa  326  3e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0257  integron integrase  51.9 
 
 		 338 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0364142  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1145  putative transcriptional regulator, TetR family  48.46 
 
 		 408 aa  297  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.239655 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0542  integrase  47.88 
 
 		 330 aa  295  6e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1377  site-specific recombinase XerD  45.65 
 
 		 333 aa  290  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000056918  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0938  site-specific recombinase IntI4  45.11 
 
 		 320 aa  282  6.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000827497  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0779  integron integrase  44.3 
 
 		 320 aa  281  8.000000000000001e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000312296  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3360  integron integrase  46.18 
 
 		 319 aa  281  9e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1682  integron integrase  45.86 
 
 		 319 aa  279  4e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1799  integron integrase  50.17 
 
 		 462 aa  279  6e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.174616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1720  integron integrase  45.54 
 
 		 319 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.945826  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1844  DNA integrase  44.94 
 
 		 335 aa  276  4e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03940  site-specific recombinase  54.87 
 
 		 291 aa  275  6e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.781769  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2037  phage integrase family site specific recombinase  44.9 
 
 		 319 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2132  integron integrase  44.9 
 
 		 319 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290373 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3204  integron integrase  45.08 
 
 		 322 aa  265  7e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0425  XerC/CodV family integrase/recombinase  43.26 
 
 		 373 aa  264  2e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003169  integron integrase IntI4  43.22 
 
 		 320 aa  264  2e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1355  phage integrase family site specific recombinase  44.27 
 
 		 318 aa  259  4e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4307  integron integrase  41.72 
 
 		 319 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03738  putative integrase  44.34 
 
 		 322 aa  253  5.000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1131  integron integrase  42.36 
 
 		 319 aa  249  6e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4396  integron integrase  48.79 
 
 		 318 aa  248  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.970236  normal  0.0224938 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4643  integron integrase  42.36 
 
 		 319 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1393  integron integrase  41.59 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2645  integron integrase  40.76 
 
 		 319 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0534  site-specific recombinase IntIA  39.87 
 
 		 327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02003  integrase  42.26 
 
 		 318 aa  243  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2467  bifunctional hypothetical protein/integrase  42.22 
 
 		 457 aa  240  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2616  integron integrase  42.04 
 
 		 468 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2866  integron integrase  47.57 
 
 		 276 aa  232  6e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2803  integron integrase  40.63 
 
 		 449 aa  231  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000270824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2869  integron integrase  40.76 
 
 		 452 aa  229  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000684574  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0840  integron integrase  43.22 
 
 		 319 aa  226  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.623931  hitchhiker  0.00150822 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2576  integron integrase  40.76 
 
 		 453 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00600674  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1633  phage integrase family site specific recombinase  43.45 
 
 		 304 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180477  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3075  integron integrase  54.42 
 
 		 232 aa  222  9e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1843  integron integrase  39.54 
 
 		 279 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0383  integron integrase  49.72 
 
 		 694 aa  169  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241301 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4142  integron integrase  59.15 
 
 		 156 aa  162  6e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3066  integrase family protein  33.44 
 
 		 390 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0221886  normal  0.652565 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  32.08 
 
 		 295 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4806  phage integrase  33.43 
 
 		 291 aa  132  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  32.79 
 
 		 292 aa  132  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3661  integrase family protein  34.05 
 
 		 290 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.311976  decreased coverage  0.00000149049 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3629  integrase family protein  34.05 
 
 		 290 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3470  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 302 aa  129  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  32.67 
 
 		 292 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  32.67 
 
 		 292 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  32.67 
 
 		 292 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  33.23 
 
 		 270 aa  129  9.000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2872  phage integrase family protein  31.23 
 
 		 279 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000984905  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  34.65 
 
 		 301 aa  126  7e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  26.35 
 
 		 283 aa  125  8.000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3700  integrase family protein  31.21 
 
 		 295 aa  125  9e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6657  integrase family protein  34.23 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.358251 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1077  integrase family protein  34.23 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0068  phage integrase  33.03 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5165  integrase family protein  32.9 
 
 		 291 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0262  integrase family protein  33.53 
 
 		 291 aa  124  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  29.17 
 
 		 295 aa  123  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0822  putative phage integrase  35.22 
 
 		 291 aa  123  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.341397 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1786  phage integrase family site specific recombinase  40.26 
 
 		 150 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  35.31 
 
 		 311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4502  integrase family protein  32.93 
 
 		 290 aa  120  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1196  phage integrase  31.83 
 
 		 291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  29.14 
 
 		 284 aa  119  7e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3109  phage integrase family protein  32.53 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  32.99 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  32.74 
 
 		 295 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  33.82 
 
 		 302 aa  116  6e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  35.82 
 
 		 296 aa  115  7.999999999999999e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1787  phage integrase family protein  30.94 
 
 		 283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2959  phage integrase family protein  30.94 
 
 		 283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.164424 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  29.37 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  32.03 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  29.1 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4832  phage integrase  32.64 
 
 		 291 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  31.05 
 
 		 292 aa  113  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2567  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.55 
 
 		 313 aa  113  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0858  phage integrase  30.41 
 
 		 289 aa  112  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  29.49 
 
 		 297 aa  113  6e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.6 
 
 		 318 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.6 
 
 		 318 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0978  phage integrase family protein  27.58 
 
 		 283 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.26 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>