More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1131 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009999  Sbal195_4643  integron integrase  99.06 
 
 		 319 aa  657    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1131  integron integrase  100 
 
 		 319 aa  664    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2645  integron integrase  84.33 
 
 		 319 aa  574  1.0000000000000001e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3204  integron integrase  53.29 
 
 		 322 aa  356  1.9999999999999998e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0410  integron integrase  46.35 
 
 		 334 aa  292  6e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.761535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1799  integron integrase  46.52 
 
 		 462 aa  288  6e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.174616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1215  integron integrase  47.92 
 
 		 326 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2249  putative transcriptional regulator, TetR family  43.81 
 
 		 325 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3006  integron integrase  45.71 
 
 		 334 aa  280  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.976928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0257  integron integrase  44.44 
 
 		 338 aa  280  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0364142  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1355  phage integrase family site specific recombinase  45.14 
 
 		 318 aa  279  4e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2703  integron integrase  44.79 
 
 		 323 aa  277  1e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3427  integron integrase  45.69 
 
 		 327 aa  276  4e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2714  integron integrase  43.81 
 
 		 332 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3366  integron integrase  43.81 
 
 		 332 aa  273  3e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.341619 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1377  site-specific recombinase XerD  43.26 
 
 		 333 aa  269  5e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000056918  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0977  integron integrase  43.13 
 
 		 329 aa  269  5.9999999999999995e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0534  site-specific recombinase IntIA  43.27 
 
 		 327 aa  265  7e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2037  phage integrase family site specific recombinase  44.27 
 
 		 319 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3360  integron integrase  44.9 
 
 		 319 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0779  integron integrase  43.17 
 
 		 320 aa  261  8e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000312296  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1682  integron integrase  44.59 
 
 		 319 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0542  integrase  43.12 
 
 		 330 aa  259  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2132  integron integrase  43.95 
 
 		 319 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290373 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1720  integron integrase  44.59 
 
 		 319 aa  258  8e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.945826  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4307  integron integrase  42.36 
 
 		 319 aa  258  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5342  integrase/recombinase  42.68 
 
 		 337 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0120  integrase/recombinase  42.36 
 
 		 337 aa  250  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.400978 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0696  phage integrase  43.04 
 
 		 338 aa  249  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0067  integrase/recombinase  42.36 
 
 		 337 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.325485 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0143  integrase IntI1 for transposon Tn21  42.36 
 
 		 337 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1844  DNA integrase  41.32 
 
 		 335 aa  248  1e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1145  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 408 aa  247  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.239655 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0425  XerC/CodV family integrase/recombinase  39.37 
 
 		 373 aa  243  3e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4396  integron integrase  43.75 
 
 		 318 aa  239  4e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.970236  normal  0.0224938 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0938  site-specific recombinase IntI4  38.29 
 
 		 320 aa  231  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000827497  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03940  site-specific recombinase  48.15 
 
 		 291 aa  229  4e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.781769  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03738  putative integrase  37.97 
 
 		 322 aa  224  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2869  integron integrase  42.33 
 
 		 452 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000684574  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2616  integron integrase  42.52 
 
 		 468 aa  222  7e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2467  bifunctional hypothetical protein/integrase  41.33 
 
 		 457 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2803  integron integrase  41.21 
 
 		 449 aa  217  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000270824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003169  integron integrase IntI4  38.61 
 
 		 320 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2866  integron integrase  43.28 
 
 		 276 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2576  integron integrase  41.67 
 
 		 453 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00600674  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1393  integron integrase  38.17 
 
 		 324 aa  203  4e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1633  phage integrase family site specific recombinase  42.59 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180477  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02003  integrase  36.71 
 
 		 318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0840  integron integrase  38.61 
 
 		 319 aa  196  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.623931  hitchhiker  0.00150822 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3075  integron integrase  40.19 
 
 		 232 aa  161  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1843  integron integrase  34.59 
 
 		 279 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0383  integron integrase  45.21 
 
 		 694 aa  150  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241301 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  32.87 
 
 		 295 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0039  integrase/recombinase  43.42 
 
 		 159 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  30.84 
 
 		 292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  30.19 
 
 		 292 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  30.19 
 
 		 292 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  30.19 
 
 		 292 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  31.25 
 
 		 270 aa  124  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  28.66 
 
 		 283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4502  integrase family protein  30.74 
 
 		 290 aa  116  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3066  integrase family protein  29.97 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0221886  normal  0.652565 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  28.67 
 
 		 284 aa  114  3e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2629  integron integrase  62.35 
 
 		 90 aa  112  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4142  integron integrase  42.14 
 
 		 156 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4806  phage integrase  29.68 
 
 		 291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1786  phage integrase family site specific recombinase  41.18 
 
 		 150 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  34.22 
 
 		 301 aa  106  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3629  integrase family protein  31.51 
 
 		 290 aa  106  7e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3661  integrase family protein  31.51 
 
 		 290 aa  106  7e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.311976  decreased coverage  0.00000149049 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0262  integrase family protein  28.71 
 
 		 291 aa  105  9e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0978  phage integrase family protein  26.98 
 
 		 283 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2872  phage integrase family protein  29.29 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000984905  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1196  phage integrase  33.48 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6657  integrase family protein  28.25 
 
 		 291 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.358251 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1077  integrase family protein  28.25 
 
 		 291 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8452  integrase family protein  34.7 
 
 		 286 aa  102  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.032039  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3700  integrase family protein  27.1 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0822  putative phage integrase  28.06 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.341397 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  30.66 
 
 		 304 aa  100  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3470  phage integrase family protein  28.53 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0068  phage integrase  32.89 
 
 		 302 aa  97.4  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5165  integrase family protein  28.23 
 
 		 291 aa  97.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3998  phage integrase family site specific recombinase  61.11 
 
 		 74 aa  96.3  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00426277  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1585  phage integrase  28.77 
 
 		 286 aa  95.1  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.791115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  26.64 
 
 		 290 aa  95.1  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  28.66 
 
 		 299 aa  94.7  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3109  phage integrase family protein  31.58 
 
 		 290 aa  94  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  26.49 
 
 		 282 aa  93.6  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2276  tyrosine recombinase XerD  29.61 
 
 		 301 aa  92.8  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235275  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.53 
 
 		 299 aa  92.4  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  26.06 
 
 		 307 aa  91.7  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0858  phage integrase  25.97 
 
 		 289 aa  90.5  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  27.27 
 
 		 296 aa  90.1  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2959  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 283 aa  89  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.164424 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1787  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 283 aa  89  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  28.31 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  23.84 
 
 		 295 aa  89  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.12 
 
 		 298 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0826  putative phage integrase  26.92 
 
 		 266 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.225694 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>