More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1633 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1633  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 304 aa  632  1e-180  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180477  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1682  integron integrase  69.49 
 
 		 319 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2037  phage integrase family site specific recombinase  70.22 
 
 		 319 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3360  integron integrase  69.49 
 
 		 319 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1720  integron integrase  69.12 
 
 		 319 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.945826  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2132  integron integrase  67.75 
 
 		 319 aa  395  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290373 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4307  integron integrase  55.15 
 
 		 319 aa  342  4e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1355  phage integrase family site specific recombinase  58.46 
 
 		 318 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0977  integron integrase  43.45 
 
 		 329 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3204  integron integrase  43.33 
 
 		 322 aa  227  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0067  integrase/recombinase  43.45 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.325485 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0120  integrase/recombinase  43.45 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.400978 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0143  integrase IntI1 for transposon Tn21  43.45 
 
 		 337 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5342  integrase/recombinase  43.45 
 
 		 337 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0425  XerC/CodV family integrase/recombinase  41.95 
 
 		 373 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0257  integron integrase  43.38 
 
 		 338 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0364142  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0410  integron integrase  42.16 
 
 		 334 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.761535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2714  integron integrase  44.93 
 
 		 332 aa  219  5e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2703  integron integrase  42.96 
 
 		 323 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3366  integron integrase  44.57 
 
 		 332 aa  217  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.341619 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0938  site-specific recombinase IntI4  41.54 
 
 		 320 aa  215  5.9999999999999996e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000827497  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1393  integron integrase  43.43 
 
 		 324 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3427  integron integrase  42.81 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1377  site-specific recombinase XerD  40.52 
 
 		 333 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000056918  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0542  integrase  42.01 
 
 		 330 aa  212  7e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1799  integron integrase  42.49 
 
 		 462 aa  211  9e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.174616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3006  integron integrase  41.18 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.976928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2249  putative transcriptional regulator, TetR family  40.67 
 
 		 325 aa  206  5e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1215  integron integrase  41.45 
 
 		 326 aa  205  7e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0779  integron integrase  38.24 
 
 		 320 aa  204  1e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000312296  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02003  integrase  39.71 
 
 		 318 aa  203  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1131  integron integrase  42.59 
 
 		 319 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2866  integron integrase  41.2 
 
 		 276 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4643  integron integrase  41.85 
 
 		 319 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003169  integron integrase IntI4  38.6 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4396  integron integrase  41.42 
 
 		 318 aa  196  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.970236  normal  0.0224938 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0534  site-specific recombinase IntIA  37.45 
 
 		 327 aa  196  4.0000000000000005e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2645  integron integrase  40.37 
 
 		 319 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1145  putative transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 408 aa  190  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.239655 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1843  integron integrase  40.74 
 
 		 279 aa  189  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03738  putative integrase  37.5 
 
 		 322 aa  183  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2803  integron integrase  40.23 
 
 		 449 aa  180  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000270824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0840  integron integrase  42.05 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.623931  hitchhiker  0.00150822 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1786  phage integrase family site specific recombinase  57.43 
 
 		 150 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0696  phage integrase  40.29 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3075  integron integrase  44.34 
 
 		 232 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0383  integron integrase  50 
 
 		 694 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241301 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2467  bifunctional hypothetical protein/integrase  39.85 
 
 		 457 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1844  DNA integrase  34.94 
 
 		 335 aa  167  1e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2869  integron integrase  38.2 
 
 		 452 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000684574  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2616  integron integrase  38.06 
 
 		 468 aa  166  5e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03940  site-specific recombinase  41.3 
 
 		 291 aa  160  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.781769  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2576  integron integrase  36.7 
 
 		 453 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00600674  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4142  integron integrase  46.43 
 
 		 156 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  28.25 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1787  phage integrase family protein  27.14 
 
 		 283 aa  106  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  27.14 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  27.14 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  27.14 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2959  phage integrase family protein  26.77 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.164424 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2872  phage integrase family protein  27.59 
 
 		 279 aa  96.3  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000984905  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  30.38 
 
 		 295 aa  91.7  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0978  phage integrase family protein  25.65 
 
 		 283 aa  91.3  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  27.47 
 
 		 301 aa  91.7  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0068  phage integrase  27.27 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5165  integrase family protein  25.91 
 
 		 291 aa  87  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0822  putative phage integrase  26.09 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.341397 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2048  integrase domain-containing protein  33.33 
 
 		 187 aa  85.1  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.212868  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4502  integrase family protein  27.14 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1624  phage integrase family protein  24.44 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0826  putative phage integrase  25.74 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.225694 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1077  integrase family protein  25.36 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6657  integrase family protein  25.36 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.358251 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3661  integrase family protein  27.76 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.311976  decreased coverage  0.00000149049 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3629  integrase family protein  27.76 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1565  phage integrase  40.19 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4806  phage integrase  24.46 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  25.29 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3470  phage integrase family protein  26.07 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3066  integrase family protein  24.07 
 
 		 390 aa  76.3  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0221886  normal  0.652565 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  25.09 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0039  integrase/recombinase  37.14 
 
 		 159 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3700  integrase family protein  25.83 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  26.05 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1821  integrase family protein  25.09 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0364742  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1196  phage integrase  26.37 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0466  Fis family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 362 aa  72  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2036  phage integrase family site specific recombinase  24.81 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2528  phage integrase family site specific recombinase  24.81 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0262  integrase family protein  27.5 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1585  phage integrase  27.37 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.791115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2736  integrase family protein  24.81 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0269003  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2013  integrase family protein  24.81 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000617639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1683  phage integrase family protein  24.81 
 
 		 287 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2164  phage integrase family site specific recombinase  24.44 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2211  phage integrase family site specific recombinase  24.44 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1162  integrase family protein  24.81 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4832  phage integrase  27.6 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1189  integrase family protein  24.81 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00933678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1647  phage integrase family protein  28.99 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0765801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>