More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0262 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0262  integrase family protein  100 
 
 		 291 aa  593  1e-169  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0373  integrase domain protein SAM domain protein  98.74 
 
 		 259 aa  483  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1196  phage integrase  74.91 
 
 		 291 aa  462  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4806  phage integrase  73.96 
 
 		 291 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0822  putative phage integrase  73.79 
 
 		 291 aa  431  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.341397 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4502  integrase family protein  72.22 
 
 		 290 aa  424  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1077  integrase family protein  75.44 
 
 		 291 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6657  integrase family protein  75.44 
 
 		 291 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.358251 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0826  putative phage integrase  76.28 
 
 		 266 aa  384  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.225694 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  57.89 
 
 		 301 aa  324  1e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8452  integrase family protein  58.66 
 
 		 286 aa  316  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.032039  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0858  phage integrase  56.58 
 
 		 289 aa  317  2e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3700  integrase family protein  53.71 
 
 		 295 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3470  phage integrase family protein  53.52 
 
 		 302 aa  299  4e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0068  phage integrase  53.19 
 
 		 302 aa  288  5.0000000000000004e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3661  integrase family protein  50.88 
 
 		 290 aa  278  6e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.311976  decreased coverage  0.00000149049 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3629  integrase family protein  50.88 
 
 		 290 aa  278  6e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  44.68 
 
 		 292 aa  226  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  44.68 
 
 		 292 aa  226  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  44.68 
 
 		 292 aa  226  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  44.68 
 
 		 292 aa  225  7e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4832  phage integrase  43.55 
 
 		 291 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5165  integrase family protein  40.07 
 
 		 291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  36.65 
 
 		 283 aa  181  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1585  phage integrase  40.36 
 
 		 286 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.791115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0978  phage integrase family protein  36.23 
 
 		 283 aa  168  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2872  phage integrase family protein  36.84 
 
 		 279 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000984905  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3066  integrase family protein  37.5 
 
 		 390 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0221886  normal  0.652565 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2241  integrase family protein  36.5 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000667129 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1683  phage integrase family protein  34.51 
 
 		 287 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1162  integrase family protein  34.51 
 
 		 287 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1189  integrase family protein  34.51 
 
 		 287 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00933678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1695  phage integrase family protein  36.13 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.363626  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  34.57 
 
 		 270 aa  145  7.0000000000000006e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1145  putative transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 408 aa  143  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.239655 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2528  phage integrase family site specific recombinase  33.1 
 
 		 287 aa  142  5e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2036  phage integrase family site specific recombinase  33.1 
 
 		 287 aa  142  6e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2164  phage integrase family site specific recombinase  33.1 
 
 		 287 aa  142  6e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2211  phage integrase family site specific recombinase  33.1 
 
 		 287 aa  142  6e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2013  integrase family protein  33.1 
 
 		 287 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000617639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2736  integrase family protein  33.1 
 
 		 287 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0269003  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3427  integron integrase  34.17 
 
 		 327 aa  142  9e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0466  Fis family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 362 aa  142  9e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1137  phage integrase  33.33 
 
 		 296 aa  142  9e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00230  putative tyrosine recombinase  36.26 
 
 		 265 aa  140  3.9999999999999997e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1624  phage integrase family protein  34.71 
 
 		 235 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1799  integron integrase  35.29 
 
 		 462 aa  138  8.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.174616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  36.68 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3204  integron integrase  31.56 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1787  phage integrase family protein  33.21 
 
 		 283 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3109  phage integrase family protein  34.19 
 
 		 290 aa  136  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2959  phage integrase family protein  33.21 
 
 		 283 aa  136  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.164424 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2703  integron integrase  34.69 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2714  integron integrase  33.93 
 
 		 332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3366  integron integrase  33.93 
 
 		 332 aa  132  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.341619 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0410  integron integrase  32.8 
 
 		 334 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.761535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0977  integron integrase  33.74 
 
 		 329 aa  130  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0143  integrase IntI1 for transposon Tn21  33.23 
 
 		 337 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0067  integrase/recombinase  33.23 
 
 		 337 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.325485 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0120  integrase/recombinase  33.23 
 
 		 337 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.400978 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5342  integrase/recombinase  33.23 
 
 		 337 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0534  site-specific recombinase IntIA  29.79 
 
 		 327 aa  129  8.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  34.3 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  32.36 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0938  site-specific recombinase IntI4  33.12 
 
 		 320 aa  127  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000827497  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2249  putative transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  34.66 
 
 		 298 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  33.09 
 
 		 290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0779  integron integrase  29.49 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000312296  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3714  tyrosine recombinase XerD  33.8 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2132  integron integrase  29.85 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290373 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0696  phage integrase  33.85 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0425  XerC/CodV family integrase/recombinase  31.61 
 
 		 373 aa  123  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0257  integron integrase  32.04 
 
 		 338 aa  123  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0364142  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1355  phage integrase family site specific recombinase  30.96 
 
 		 318 aa  122  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  33.91 
 
 		 301 aa  122  7e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  31.2 
 
 		 282 aa  122  8e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  30 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3200  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.93 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.93 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0562  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.81 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3380  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.93 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3278  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.93 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0724  integrase family protein  37.4 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.971464 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3275  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.46 
 
 		 298 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5312  integrase/recombinase  51.24 
 
 		 137 aa  119  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.169843 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003169  integron integrase IntI4  31.85 
 
 		 320 aa  119  7.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.9 
 
 		 299 aa  118  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3847  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.9 
 
 		 299 aa  118  9e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.349121 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.9 
 
 		 299 aa  118  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  32.47 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2037  phage integrase family site specific recombinase  30.53 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  35.44 
 
 		 310 aa  118  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3006  integron integrase  32.21 
 
 		 334 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.976928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02003  integrase  32.11 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4307  integron integrase  27.36 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  32.27 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  33.81 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2576  integron integrase  32.06 
 
 		 453 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00600674  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  37.87 
 
 		 292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>